Wirus żółtej plamistości ryżu
| Wirus żółtej plamistości ryżu | |
|---|---|
| Klasyfikacja wirusa | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| Królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornavirae |
| Gromada: | Pisuviricota |
| Klasa: | Pisoniviricetes |
| Zamówienie: | Sobeliwirusy |
| Rodzina: | Solemoviridae |
| Rodzaj: | Sobemowirus |
| Gatunek: |
Wirus żółtej plamistości ryżu
|
| Synonimy | |
|
Sobemowirus żółtej plamistości ryżu, choroba bladożółtej plamistości |
|
Wirus żółtej pstrości ryżu ( RYMV ) jest wirusem chorobotwórczym dla roślin , należącym do rodzaju Sobemovirus . Genom jest jednoniciowym RNA o dodatniej polaryzacji o długości 4450 nukleotydów i nie jest poliadenylowany . Po raz pierwszy odnotowano go w Kenii w 1966 r. w jednym z pierwszych w Afryce programów intensyfikacji upraw, ze względu na powiązanie RYMV z intensyfikacją, ale analiza DNA jego historii ewolucyjnej pokazuje, że wyewoluował w Afryce Wschodniej w 19-stym wieku. Od czasu identyfikacji w Kenii został wykryty w wielu krajach Afryki Subsaharyjskiej . Wykryto go także w Afryce Środkowej , ale nie zaobserwowano go jeszcze poza kontynentem. Organizacja genomowa RYMV jest najbardziej podobna do organizacji sobemowirusa plamistej kupki. RYMV jest jednym z lepiej poznanych patogenów roślinno-wirusowych .
Wirusologia
Struktura
RYMV jest jednoniciowym wirusem RNA o dodatniej polarności . Nukleotydy RYMV charakteryzują się wysokim poziomem różnorodności genetycznej, który wynosi około 14%. RYMV jest wirusem sobemo .
Wpływ na rośliny
RYMV ma ogromny wpływ na uprawy ryżu. Smugi, plamistość , odbarwienie i deformacja liści, a także śmierć zakażonych młodych roślin są typowymi objawami zakażenia RYMV. Straty w plonach mogą wynosić 25–100%. Uważa się, że RYMV zaczął się rozprzestrzeniać od czasu wprowadzenia egzotycznego ryżu ( Oryza sativa ) z Azji na kontynent afrykański. Miejscowe ryże pochodzące z Afryki są zwykle bardziej tolerancyjne na wirusa. Naturalny żywiciel wirusa zwykle pozostaje w Oryzeae plemię roślin. Wirus atakuje tylko kilka gatunków roślin, w tym niektóre gatunki ryżu i dzikie trawy. Jedynym sposobem potwierdzenia obecności RYMV u roślin jest wykonanie testu serologicznego .
Objawy infekcji
Najbardziej podatne są młodsze sadzonki (w fazie wzrostu 3–4 liści) – starsze rośliny na ogół wykazują mniej oczywiste objawy na liściach i mniej karłowatość niż młodsze rodzeństwo. Objawy pojawiają się początkowo w postaci żółto-zielonych, liniowych plam na podstawie najmłodszych liści. W miarę rozwoju infekcji plamy rozszerzają się równolegle do nerwów liści i wyglądają jak żółte lub pomarańczowe smugi; mogą one mieć różną szerokość, ale mogą mieć długość do 10 cm.
Dotknięte rośliny mają żółte lub pomarańczowe liście we wczesnej fazie uprawy. W ciężkich przypadkach liście zwijają się i wysychają. Inne objawy to zahamowanie wzrostu, zmniejszone krzewienie i słabe wypełnienie wiech. Skutkuje to niską produkcją nasion lub ich brakiem i słabą jakością ziarna.
Przenoszenie
RYMV znajduje się w łuskach ryżu w roślinach. Wirus jest przenoszony przez zwierzęta, przez kontakt z liśćmi za pośrednictwem wiatru oraz czynniki abiotyczne (np. woda do nawadniania). Może być przenoszony przez chrząszcze liściowe lub szczury, lub z rośliny na roślinę poprzez resztki liści, puste kłoski ryżu, splatające się korzenie, kontakt z liśćmi, ściernisko ryżowe, zanieczyszczone ręce i przez rośliny znajdujące się blisko siebie. Wirus ten nie przenosi się przez nasiona ani nie jest przenoszony przez nicienie . Stwierdzono, że koniki polne długorogie ( Conocephalus ) są możliwym wektorem RYMV w Ugandzie.
Możliwość dostosowania i odporność
Kilka odmian ryżu wykazuje wysoką odporność na RYMV, charakteryzującą się brakiem objawów i brakiem wykrycia wirusa. Dziedziczenie tej wysokiej odporności jest recesywne . Gen oporności RYMV1 zidentyfikowano jako gen eIF(iso)4G . Scharakteryzowano cztery allele oporności rymv1 , jeden u O. sativa ( rymv1-2 ) i trzy u odmian O. glaberrima ( rymv1-3 , rymv1-4, rymv1-5 ). Opór rymv1–3 jest spowodowany delecją kodonów 322–324 w tej samej domenie eIF(iso)4G .
Kierownictwo
Zapobieganie
Dostępne są odmiany odporne i tolerancyjne.
Korzystanie ze szkółek, które nie zostały wcześniej zakażone, lub bezpośredni siew na polu może również pomóc w zapobieganiu rozprzestrzenianiu się wirusa.
CABI zaleca jak najwcześniejsze sadzenie roślin, aby uniknąć szczytowego okresu występowania owadów będących wektorami wirusa. Ponadto synchronizacja sadzenia na różnych polach może zapobiec rozprzestrzenianiu się wirusa na młodsze uprawy.
Utrzymywanie chwastów w celu zwalczania innych żywicieli wirusa i wycinanie krzaków wokół pól w celu kontrolowania miejsc rozrodu wektorów owadów może również zapobiegać rozprzestrzenianiu się RYMV.
Procedury sanitarne mogą ograniczyć rozprzestrzenianie się RYMV. CABI zaleca czyszczenie kanałów irygacyjnych i okolic pól ryżowych z chwastów, zwłaszcza poza sezonem, w celu usunięcia wirusa, a jego wektory owadów usuną wirusa i wektory owadów. Czyszczenie maszyn rolniczych może zmniejszyć rozprzestrzenianie się i zapobiec rozprzestrzenianiu się mechanicznemu. Dotyczy to również czyszczenia wszelkich maszyn rolniczych po każdym użyciu.
Kontrola
RYMV całkowicie zabije podatne odmiany; w przypadku wykrycia usunięcie zakażonych roślin i ich zniszczenie może zapobiec dalszemu rozprzestrzenianiu się. CABI zaleciło również ograniczenie stosowania nawozów na zakażone rośliny.
Nie ma metod kontroli chemicznej, które bezpośrednio powstrzymałyby rozprzestrzenianie się RYMV. Jednakże w niektórych krajach dostępne są środki owadobójcze do zwalczania wektorów wirusa; odpowiednie chemikalia różnią się w zależności od wytycznych obowiązujących w danym kraju.
Epidemiologia
Od 2019 r. RYMV jest nadal uważany za „nową” chorobę, ponieważ nadal trwa i oczekuje się znacznego rozszerzenia zasięgu tej choroby.
Źródła
Ten artykuł zawiera tekst z bezpłatnej pracy. Licencja na podstawie licencji CC-BY-SA ( oświadczenie licencyjne/zezwolenie ). Tekst zaczerpnięty z arkuszy informacyjnych Plantwise dla rolników: Odporny ryż na wirusa żółtej plamistości ryżu <a i=6>, , Jubilant JN Mwangi, Edith D. Kija Mariam I. Mziray, CABI.
Ten artykuł zawiera tekst z bezpłatnej pracy. Licencja na podstawie licencji CC-BY-SA ( oświadczenie licencyjne/zezwolenie ). Tekst zaczerpnięty z PMDG: Zielona lista – wirus żółtej plamistości ryżu <a i=6>, , Plantwise, CABI.
Ten artykuł zawiera tekst z bezpłatnej pracy. Licencjonowany na podstawie licencji CC-BY-SA ( oświadczenie licencyjne/zezwolenie ). Tekst zaczerpnięty z arkuszy informacyjnych Plantwise dla rolników: Żółta plamistość ryżu (Ikivejuru) <a i=6>, , Joelle Kajuga, Germain Nkima, CABI.
Ten artykuł zawiera tekst z bezpłatnej pracy. Licencjonowany na podstawie licencji CC-BY-SA ( oświadczenie licencyjne/zezwolenie ). Tekst zaczerpnięty z PMDG: Wirus żółtej pstrości ryżu – Rwanda <a i=6>, , J. Chrysostome Muhigirwa & Germain Nkima, CABI.
Ten artykuł zawiera tekst z bezpłatnej pracy. Licencja na podstawie licencji CC-BY-SA ( oświadczenie licencyjne/zezwolenie ). Tekst zaczerpnięty z PMDG: Wirus żółtej plamistości ryżu – Malawi <a i=6>, , Chilasa S.L, J.I.G. Masangwa, Shaibu Y.A., CABI.
, E. Moses, F. C. Brentu & F.A. Nyarko, CABI. Ten artykuł zawiera tekst z bezpłatnej pracy. Licencjonowany na podstawie licencji CC-BY-SA ( oświadczenie licencyjne/zezwolenie ). Tekst zaczerpnięty z PMDG: Wirus żółtej plamistości ryżu – Ghana <a i=6>,
- Pinel-Galzi, Agnès; Traoré, Oumar; Sere, Yacouba; Hébrard, Eugenia; Fargette, Denis (2015). „Bigeografia pojawienia się wirusa: wirus żółtej plamistości ryżu jako studium przypadku”. Aktualna opinia w wirusologii . Elsevier . 10 : 7–13. doi : 10.1016/j.coviro.2014.12.002 . ISSN 1879-6257 . PMID 25544357 . S2CID 45136868 .
- Traoré, O.; Pinel-Galzi, A.; Soro, F.; Sarra, S.; Rakotomalala, M.; Sangu, E.; Kanyeka, Z.; Sere, Y.; Konaté, G.; Fargette, D. (2009). „Ponowna ocena epidemiologii wirusa żółtej plamistości ryżu po ostatnich postępach w badaniach terenowych i molekularnych”. Badania wirusów . Elsevier . 141 (2): 258–267. doi : 10.1016/j.virusres.2009.01.011 . ISSN 0168-1702 . PMID 19195488 . S2CID 25049549 .