egzosortaza
Identyfikatory | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
transbłonowej egzosortazy (Exosortase_EpsH). | |||||||||
Symbol | Exosortase_EpsH | ||||||||
Pfam | PF09721 | ||||||||
|
Egzosortaza odnosi się do rodziny integralnych białek błonowych występujących w bakteriach Gram-ujemnych , które rozpoznają i rozszczepiają sygnał sortujący PEP-CTERM na końcu karboksylowym . Nazwa pochodzi od przewidywanej roli analogicznej do sortazy , pomimo braku jakiejkolwiek wykrywalnej homologii sekwencji , oraz silnego powiązania genów egzosortazy z loci biosyntezy egzopolisacharydu lub pozakomórkowej substancji polimerowej . Wiele archeonów ma archeosortazę , homologiczną raczej do egzosortaz niż do sortaz. Archaeosortaza A rozpoznaje sygnał PGF-CTERM, znajdujący się na C-końcu niektórych archeonów białek warstwy S. Po przetworzeniu przez archeosortazę A, region PGF-CTERM zniknął, a zamiast tego na C-końcu obecna jest kotwica lipidowa pochodząca z prenylu.
Sama egzosortaza nie została scharakteryzowana biochemicznie. Jednak ukierunkowana mutageneza działa na archeosortazie A, archeologicznym homologu egzosortaz, silnie wspiera koncepcję aktywnego miejsca Cys i zbieżnej ewolucji z transpeptydazami z rodziny sortaz . Niedawne badania nad Zoogloea resiniphila, bakterią występującą w oczyszczalniach ścieków z osadem czynnym, wykazały, że białka PEP-CTERM (a co za tym idzie także egzosortaza) są niezbędne do tworzenia się kłaczków w niektórych systemach.