Transpeptydaza sortująca białka

Transpeptydaza sortująca białka to enzym , taki jak sortaza SrtA Staphylococcus aureus , który rozszczepia jedno lub więcej białek docelowych wytwarzanych przez tę samą komórkę w ramach wyspecjalizowanego szlaku ukierunkowania na białka . Typowa transpeptydaza sortująca białka prokariotyczne charakteryzuje się jako proteaza , ale nie hydrolizuje po prostu wiązania peptydowego. Zamiast tego większa, N-końcowa część rozszczepionego polipeptydu jest przenoszona na inną cząsteczkę, taką jak prekursor ściany komórkowej peptydoglikanu w Bakterie Gram-dodatnie .

Termin sortaza jest właściwie zarezerwowany dla zestawu enzymów proteazy cysteinowej , sortazy A , sortazy B i członków dodatkowych klas, z których wszystkie mają homologię. Jednakże u prokariotów opisano rosnącą liczbę dodatkowych systemów sortowania białek, obejmujących enzymy sortujące, które nie mają żadnej homologii z sortazą i które wydają się powstać oddzielnie w wyniku zbieżnej ewolucji . Chociaż sortazy są najlepiej opisanymi członkami transpeptydaz sortujących białka, prace nad analogicznymi enzymami archeosortazą , rombosortaza i enzym PorU układów wydzielniczych typu IX (T9SS).

enzym sortujący	mechanizm	pokrewny sygnał sortowania
sortaza A	proteaza cysteinowa	LPXTG
sortaza B	proteaza cysteinowa	NPQTN
archeosortaza A	proteaza cysteinowa	PGF-CTERM
egzosortaza A	proteaza cysteinowa	PEP-CTERM
rombosortaza	proteaza serynowa	GlyGly-CTERM
PorU jak w Porphyromonas gingivalis	proteaza serynowa	Domena typu beta-końcowa T9SS T9SS