Acidilobus saccharovorans
| Acidilobus saccharovorans | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
A. sacharoworanów
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Acidilobus saccharovorans Prokofewa i in., 2009
|
|
Acidilobus saccharovorans to termoacidofilny (czyli zarówno termofilny , jak i kwasofilny ) gatunek archeonów beztlenowych . Gatunek został po raz pierwszy opisany w 2009 roku po wyizolowaniu go z gorących źródeł na Kamczatce .
Opis
A. saccharovorans ma morfologię kokosa o średnicy 1–2 μm ze stosunkowo grubą warstwą S i wiązką wici . Ma optymalną temperaturę wzrostu 80-85 ° C (kwalifikując go jako hipertermofil ) i optymalne pH 3,5-4,0. Jest bezwzględnym beztlenowcem o metabolizmie fermentacyjnym . Jej wzrost jest przyspieszany przez obecność siarki elementarnej , która jest redukowana do siarkowodoru ; jednakże siarka nie jest niezbędna do wzrostu. Jest odporny na antybiotyki chloramfenikol , penicylinę i streptomycynę . A. saccharovorans różni się od A. aceticus , jedynego innego rozpoznanego gatunku w rodzaju, dwoma głównymi względami: jest wici, podczas gdy A. aceticus jest nieruchomy; i jest zdolny do wzrostu na szerszej gamie substratów, w tym na wielu cukrach i polisacharydach . Jego nazwa nawiązuje do tej właściwości jego metabolizmu.
Genom i metabolizm
Sekwencja genomu A. saccharovorans została zgłoszona w 2010 roku jako pierwszy pełny genom archeonu, który jest termoacidofilny i bezwzględnie beztlenowy. Genom zawiera geny zgodne ze szlakami metabolicznymi Embdena-Meyerhofa i Entnera-Doudoroffa . Nieoczekiwanie odkryto również, że zawiera geny kodujące oksydacyjne enzymy cyklu kwasu trikarboksylowego , aczkolwiek bez kluczowego enzymu, liazy cytrynianowej ATP , który umożliwiłby redukujące działanie szlaku. Co niezwykłe dla archeona, koduje beta-oksydacji , który powinien umożliwić mu wzrost na triacyloglicerydach i kwasach tłuszczowych . Jednak te zdolności metaboliczne nie zostały jeszcze wykazane eksperymentalnie. Przewidywany proteom zawiera również szereg cech interpretowanych jako przystosowanie do wzrostu w warunkach kwaśnych poprzez wykorzystanie wysokiego pozakomórkowego stężenia protonów .
Filogenetyka
Porównanie z innymi zsekwencjonowanymi genomami sugeruje, że A. saccharovorans jest najbliżej spokrewniony z Aeropyrum pernix . Genom zawiera również dowody na poziomy transfer genów między Acidilobales i Sulfolobales , rzędem tlenowych termoacidofilów często spotykanych w tych samych gorących źródłach. Pierwotnie doniesiono, że sekwencja genomu A. saccharovorans wspiera ustanowienie nowego rzędu Acidilobales , obejmującego rodziny Acidilobaceae i Caldisphaeraceae , co jest obecnie akceptowane. Jednak badanie filogenomiczne z 2015 r. Konserwatywnych sekwencji białek archeologicznych sugeruje, że zamiast tego dwie rodziny były lepiej umieszczone w rzędzie Desulfurococcales , który zawiera również Aeropyrum pernix .
Ekologia
Gatunki Acidilobales są szeroko rozpowszechnione w gorących źródłach o kwaśnym środowisku, gdzie prawdopodobnie odgrywają rolę w całkowitym utlenieniu materiału organicznego. Opierając się na zdolnościach metabolicznych przewidywanych na podstawie A. saccharovorans , Acidilobales są metabolicznie podobne do Thermoproteales , a te dwa rzędy mogą pełnić podobne role ekologiczne odpowiednio w kwaśnych i neutralnych gorących źródłach.
