Dioksygenaza acyreduktonowa (wymagająca żelaza (II))
| dioksygenaza acyreduktonowa [wymagająca żelaza(II)] | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identyfikatory | |||||||||
| nr WE | 1.13.11.54 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Dioksygenaza acyreduktonowa [wymagająca żelaza(II)] ( EC 1.13.11.54 ) jest enzymem katalizującym reakcję chemiczną
- 1,2-dihydroksy-5- (metylotio) pent-1-en-3-on + O 2 4- (metylotio) -2-oksobutanian + mrówczan
Zatem dwoma substratami tego enzymu są 1,2-dihydroksy-5-(metylotio)pent-1-en-3-on i tlen , podczas gdy jego dwoma produktami są 4-metylotio-2-oksobutanian i mrówczan .
Enzym ten należy do rodziny oksydoreduktaz , szczególnie tych działających na pojedynczych donorów z O 2 jako utleniaczem i włączeniem dwóch atomów tlenu do substratu (oksygenazy). Wprowadzony tlen nie musi pochodzić z O2 . Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to 1,2-dihydroksy-5-(metylotio)pent-1-en-3-on:oksydoreduktaza tlenowa (formująca mrówczan) . Inne powszechnie używane nazwy to ARD' , dioksygenaza 2-hydroksy-3-keto-5-tiometylopent-1-enu (niejednoznaczna) , dioksygenaza acyreduktonu (niejednoznaczna) , dioksygenaza E-2' i E-3 . Enzym ten bierze udział w metabolizmie metioniny .
Studia strukturalne
Pod koniec 2007 r. rozwiązano tylko jedną strukturę tej klasy enzymów, o kodzie dostępu PDB 2HJI .
- Wray JW, Abeles RH (1993). „Enzym bakteryjny, który katalizuje tworzenie się tlenku węgla”. J. Biol. chemia . 268 (29): 21466–9. PMID 8407993 .
- Wray JW, Abeles RH (1995). „Szlak odzyskiwania metioniny w Klebsiella pneumoniae i wątrobie szczura. Identyfikacja i charakterystyka dwóch nowych dioksygenaz” . J. Biol. chemia . 270 (7): 3147–53. doi : 10.1074/jbc.270.7.3147 . PMID 7852397 .
- Furfine ES, Abeles RH (1988). „Półprodukty w konwersji 5'-S-metylotioadenozyny do metioniny w Klebsiella pneumoniae”. J. Biol. chemia . 263 (20): 9598–606. PMID 2838472 .
- Dai Y, Wensink PC, Abeles RH (1999). „Jedno białko, dwa enzymy” . J. Biol. chemia . 274 (3): 1193-5. doi : 10.1074/jbc.274.3.1193 . PMID 9880484 .
- Mo H, Dai Y, Pochapsky SS, Pochapsky TC (1999). „Przypisania 1H, 13C i 15N NMR dla metaloenzymu wytwarzającego tlenek węgla z Klebsiella pneumoniae”. J. Biomol. NMR . 14 (3): 287–8. doi : 10.1023/A:1008396624784 . PMID 10481280 . S2CID 36731035 .
- Dai Y, Pochapsky TC, Abeles RH (2001). „Badania mechanistyczne dwóch dioksygenaz w szlaku odzyskiwania metioniny przez Klebsiella pneumoniae”. Biochemia . 40 (21): 6379–87. doi : 10.1021/bi010110y . PMID 11371200 .
- Al-Mjeni F, Ju T, Pochapsky TC, Maroney MJ (2002). „Badanie XAS struktury i funkcji Ni w dioksygenazie acyreduktonowej”. Biochemia . 41 (21): 6761–9. doi : 10.1021/bi012209a . PMID 12022880 .
- Pochapsky TC, Pochapsky SS, Ju T, Mo H, Al-Mjeni F, Maroney MJ (2002). „Modelowanie i eksperyment dają strukturę dioksygenazy acyreduktonowej z Klebsiella pneumoniae”. Nat. Struktura. Biol . 9 (12): 966–72. doi : 10.1038/nsb863 . PMID 12402029 . S2CID 38098047 .
