Driada (repozytorium)

Driada
Deweloperzy Narodowe Centrum Syntezy Ewolucyjnej , Centrum Badań nad Metadanymi UNC-CH , Uniwersytet Oksfordzki , Biblioteka Brytyjska , Kalifornijska Biblioteka Cyfrowa
Pierwsze wydanie styczeń 2008 r
Magazyn
Napisane w Rubin
Licencja Nowa licencja BSD
Strona internetowa datadryada.org _

Driada to ogólnodostępne międzynarodowe repozytorium danych badawczych, w szczególności danych stanowiących podstawę publikacji naukowych i medycznych (głównie z zakresu biologii ewolucyjnej, genetycznej i ekologicznej). Dryad to wyselekcjonowane repozytorium ogólnego przeznaczenia, które umożliwia odkrywanie danych, swobodne ich ponowne wykorzystanie i cytowanie. Misją naukową, edukacyjną i charytatywną Driady jest zapewnienie infrastruktury i promowanie ponownego wykorzystywania danych z badań naukowych.

Wizją Driady jest naukowy system komunikacji, w którym towarzystwa naukowe, wydawcy, instytucje badawcze i edukacyjne, instytucje finansujące i inni interesariusze wspólnie wspierają i promują zachowanie i ponowne wykorzystanie danych badawczych.

Dryad ma na celu umożliwienie naukowcom walidacji opublikowanych wyników, odkrywania nowych metodologii analizy, zmiany przeznaczenia danych dla pytań badawczych nieprzewidzianych przez pierwotnych autorów oraz przeprowadzania badań syntetycznych, takich jak formalne metaanalizy. W przypadku wielu publikacji istniejące repozytoria danych nie obejmują całego pakietu danych. W rezultacie wiele ważnych zbiorów danych nie jest zachowywanych i nie są już dostępne ani użyteczne w momencie, gdy są poszukiwane przez późniejszych badaczy.

Dryad służy jako repozytorium dla tabel, arkuszy kalkulacyjnych, plików płaskich i wszystkich innych rodzajów publikowanych danych, dla których nie istnieją jeszcze wyspecjalizowane repozytoria. W optymalnym przypadku autorzy przesyłają dane do Driady w związku z publikacją artykułu, tak aby linki do danych mogły zostać zawarte w publikowanym artykule. Wszystkie pliki danych w Driadzie są powiązane z opublikowanym artykułem i są udostępniane do ponownego wykorzystania na warunkach licencji Creative Commons Zero .

Dryad jest również zarejestrowaną w USA organizacją członkowską typu non-profit, która stanowi forum dla wszystkich interesariuszy, aby ustalać priorytety dla repozytorium, uczestniczyć w planowaniu i dzielić się wiedzą oraz koordynować działania dotyczące zasad dotyczących danych.

Driada jest wpisana do Rejestru Repozytoriów Danych Badawczych re3data.org.

Cechy

Cytat z pakietu danych Driady w Wikipedii
Embarga wybrane przez autorów danych Driady

Driada umożliwia autorom, czasopismom, stowarzyszeniom i wydawcom ułatwienie archiwizacji danych w momencie publikacji, gdy dane są łatwo dostępne. Dane w Driadzie otrzymują stały, unikalny identyfikator obiektu cyfrowego (DOI), który może zostać umieszczony w publikowanym artykule, aby czytelnicy mieli dostęp do danych. Autorzy mogą archiwizować dane w Driadzie i mieć pewność ich zachowania, jednocześnie wypełniając mandaty czasopism i agencji finansujących badania w zakresie rozpowszechniania wyników swoich badań.

Autorzy przesyłają dane do Driady, gdy powiązany artykuł jest w trakcie recenzji lub został przyjęty do publikacji. Wybór zależy od tego, czy czasopismo zawiera dane w zakresie recenzenta. Autorzy mogą przesyłać dane także po opublikowaniu artykułu.

Przesyłanie danych jest ułatwione przez czasopisma wysyłające powiadomienia o nowych rękopisach do Driady. Dzięki temu autorzy nie muszą ponownie wprowadzać danych bibliograficznych podczas przesyłania swoich plików danych.

Kuratorzy Driad przeglądają przesłane pliki danych i przeprowadzają kontrolę jakości opisów metadanych przed włączeniem nowej treści do repozytorium. Podejście Dryada do metadanych kładzie nacisk na prostotę i interoperacyjność, wspierane przez profil aplikacji metadanych Dublin Core . Centrum Badań nad Metadanymi obecnie w College of Computing and Informatics, Drexel University , wcześniej służyło jako centralne centrum kuratorskie Driady, a główna działalność kuratorska odbywa się teraz za pośrednictwem organizacji non-profit w Północnej Karolinie.

Dryad koordynuje przesyłanie danych do wyspecjalizowanych repozytoriów, gdzie w celu (a) zmniejszenia obciążenia użytkowników poprzez usprawnienie przepływu pracy związanego z przesyłaniem oraz (b) umożliwienia Dryad i wyspecjalizowanym repozytoriom wymianę identyfikatorów i innych metadanych w celu umożliwienia wzajemnego powiązania różnych produktów danych powiązanych z daną publikacją. Pierwsi dwaj partnerzy uzgadniania to TreeBASE i GenBank , które czasopisma partnerskie Driady wcześniej zidentyfikowały jako wymagane punkty deponowania odpowiednio danych drzewa filogenetycznego i sekwencji DNA.

Zarządzanie, historia i finansowanie

Driada jest zarządzana przez dwunastoosobową Radę Dyrektorów , wybieraną przez jej członków. Członkami mogą być niezależne czasopisma, stowarzyszenia, wydawcy, instytucje badawcze i edukacyjne, biblioteki, fundatorzy lub inne organizacje wspierające misję Driady. Organizacja koordynuje zasady udostępniania danych i promuje długoterminową trwałość repozytorium.

Dryad zaczął pobierać opłaty za przesłanie we wrześniu 2013 r. Dryad jest organizacją non-profit, która zapewnia długoterminowy dostęp do swoich treści bez żadnych kosztów naukowcom, nauczycielom lub studentom, niezależnie od narodowości lub przynależności instytucjonalnej. Driada jest w stanie zapewnić swobodny dostęp do danych dzięki wsparciu finansowemu ze strony członków i osób przekazujących dane. Opłaty za przesyłanie Driady mają na celu utrzymanie jej podstawowych funkcji poprzez odzyskanie podstawowych kosztów kuracji i przechowywania danych.

Driada wyłoniła się z warsztatów National Evolutionary Synthesis Center (NESCent) zatytułowanych „Zachowanie, udostępnianie i odkrywanie danych cyfrowych: wyzwania dla małych społeczności naukowych w erze cyfrowej” w maju 2007 r. Początkowe fundusze na Driadę zostały przekazane przez National Science Foundation na rzecz National Evolutionary Synthesis Center i inni partnerzy w USA.

DryadUK był projektem finansowanym przez Jisc , prowadzonym przez Bibliotekę Brytyjską i Uniwersytet Oksfordzki we współpracy z NESCent, Digital Curation Centre i Charles Beagrie Ltd. Projekt doprowadził do powstania kopii lustrzanej repozytorium Driad w Wielkiej Brytanii w Bibliotece Brytyjskiej. W ramach projektu udoskonalono również dostępne narzędzia do publikowania i cytowania danych, rozszerzono zakres dyscyplin uczestniczących czasopism i dalej rozwijano ramy biznesowe dla międzynarodowej organizacji zajmującej się długoterminowym przechowywaniem danych.

W 2019 roku Dryad ogłosił partnerstwo z innym repozytorium danych Zenodo w celu wspólnego opracowywania nowych rozwiązań skupiających się na wspieraniu przepływów pracy badaczy i wydawców, a także najlepszych praktyk w zakresie oprogramowania i przechowywania danych .

Driada jest członkiem Data Observation Network for Earth ( DataONE ).

Oprogramowanie

DSpace o otwartym kodzie źródłowym , opracowanym przez Massachusetts Institute of Technology i firmę Hewlett-Packard . W 2019 roku Dryad przeszedł na platformę publikacji danych typu open source Ruby-on-Rails o nazwie Stash.

Zobacz też

Linki zewnętrzne