Glikoproteina surowicy wiążąca lipidy
| Rodzina LBP / BPI / CETP, struktura krystaliczna domeny N-końcowej | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 bpi, ludzkie
| |||||||||
| identyfikatory białek zwiększających przepuszczalność bakteriobójczą | |||||||||
| Symbol | LBP_BPI_CETP | ||||||||
| Pfam | PF01273 | ||||||||
| InterPro | IPR017942 | ||||||||
| PROZYTA | PDOC00367 | ||||||||
| SCOP2 | 1bp1 / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.C.40 | ||||||||
| Nadrodzina OPM | 170 | ||||||||
| Białko OPM | 2obd | ||||||||
| |||||||||
| Rodzina LBP / BPI / CETP, struktura krystaliczna domeny C-końcowej | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
bpi, ludzkie
| |||||||||
| identyfikatory białek zwiększających przepuszczalność bakteriobójczą | |||||||||
| Symbol | LBP_BPI_CETP_C | ||||||||
| Pfam | PF02886 | ||||||||
| InterPro | IPR001124 | ||||||||
| PROZYTA | PDOC00367 | ||||||||
| SCOP2 | 1bp1 / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.C.40 | ||||||||
| |||||||||
W biologii molekularnej rodzina wiążących lipidy glikoprotein surowicy , znana również jako rodzina BPI/LBP/Plunc lub rodzina LBP/BPI/CETP, reprezentuje rodzinę, która obejmuje wiążące lipidy glikoproteiny surowicy ssaków i/lub białka zawierające motyw strukturalny znany jako krotnie BPI . Członkowie tej rodziny to:
- Bakteriobójcze białko zwiększające przepuszczalność (BPI)
- Białko wiążące lipopolisacharydy (LBP)
- Białko przenoszące estry cholesterolu (CETP)
- Białko przenoszące fosfolipidy (PLTP)
- Białko związane z rakiem podniebienia, płuc i nosa (PLUNC)
Struktura
Białka te składają się z domen N- i C-końcowych , które mają podobną dwuwarstwową strukturę alfa/beta, ale wykazują niewielką identyczność sekwencji między sobą. Domeny te zostały po raz pierwszy opisane jako ułożone w kształcie „bumerangu”, który tworzy zagięcie BPI. Fałd zawiera apolarne kieszenie wiążące, które mogą wchodzić w interakcje z cząsteczkami hydrofobowymi i amfipatycznymi , takimi jak acylowe łańcuchy węglowe lipopolisacharydu występującego u bakterii Gram-ujemnych .
Funkcjonować
Białko zwiększające przepuszczalność bakteriobójczą
Białko zwiększające przepuszczalność bakteryjną (BPI) jest silnym przeciwbakteryjnym białkiem składającym się z 456 aminokwasów , które wiąże się i neutralizuje lipopolisacharydy z zewnętrznej błony bakterii Gram-ujemnych . BPI zawiera dwie domeny , które przyjmują ten sam fałd strukturalny , mimo że mają niewielkie podobieństwo sekwencji .
Białko wiążące lipopolisacharydy
Białko wiążące lipopolisacharydy (LBP) jest białkiem wiążącym endotoksyny, które jest blisko spokrewnione i działa w sposób skoordynowany z BPI, aby ułatwić zintegrowaną odpowiedź gospodarza na inwazyjne bakterie Gram-ujemne.
Białko przenoszące estry cholesterolu
Białko przenoszące estry cholesterolu (CETP) jest glikoproteiną , która ułatwia przenoszenie lipidów ( estrów cholesterolu i triglicerydów ) między różnymi lipoproteinami , które transportują je przez osocze, w tym HDL , LDL , VLDL i chylomikrony . Te lipoproteiny chronią lipidy przed wodą , zamykając je w otoczce polarnych lipidów i białek .
Białko przenoszące fosfolipidy
Białko przenoszące fosfolipidy (PLTP) wymienia fosfolipidy między lipoproteinami i przebudowuje lipoproteiny o dużej gęstości (HDL).
Białko związane z rakiem podniebienia, płuc i nosa
Białko związane z rakiem podniebienia, płuc i nabłonka nosa (PLUNC) jest potencjalnym białkiem obronnym gospodarza, które jest wydzielane z gruczołu podśluzówkowego do śliny i popłuczyn z nosa . Wydaje się, że PLUNC jest wydzielanym produktem ziarnistości neutrofili , który bierze udział w aspekcie odpowiedzi zapalnej , która przyczynia się do obrony gospodarza.
Krótki klon podniebienia, płuc i nabłonka nosa 1 (SPLUNC1) może wiązać lipopolisacharyd nanobakterii Gram-ujemnych , odgrywając w ten sposób ważną rolę w obronie gospodarza nabłonka nosowo-gardłowego .
Członek rodziny przepuszczalności bakterii A1 (BPIFA1 / SPLUNC1) jest wrodzonym białkiem, które jest wydzielane podstawno-bocznie ze zdrowych, ale nie chorych na astmę, ludzkich kultur nabłonka oskrzeli (HBEC). Hamuje kurczliwość mięśni gładkich dróg oddechowych, wiążąc się z kanałem napływu Ca2+ Orai1 i hamując go .
Białka ludzkie należące do tej rodziny
- Bakteriobójcze białko zwiększające przepuszczalność (BPI)
- Członek rodziny A zawierający fałdę BPI 1 (BPIFA1, PLUNC, SPLUNC1, SPURT)
- Członek rodziny A zawierający fałdę BPI 2 (BPIFA2, SPLUNC2)
- Członek rodziny A zawierający fałdę BPI 3 (BPIFA3, SPLUNC3)
- Członek rodziny B zawierający fałdę BPI 1 (BPIFB1, LPLUNC1)
- Członek rodziny B zawierający fałdę BPI 2 (BPIFB2, LPLUNC2, BPIL1)
- Członek rodziny B zawierający fałdę BPI 3 (BPIFB3, LPLUNC3)
- Członek rodziny B zawierający fałdę BPI 4 (BPIFB4, LPLUNC4)
- Członek rodziny B zawierający fałdę BPI 6 (BPIFB6, LPLUNC6, BPIL3)
- Białko C z rodziny C zawierające fałdy BPI (BPIFC, BPIL2),
- Białko przenoszące estry cholesterolu
- Latherin (LATH, BPIFA4P)
- Białko wiążące lipopolisacharydy (LBP)
- Białko przenoszące fosfolipidy (PLTP)