HDAC8

HDAC8
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory , CDLS5, HD8, HDACL1, MRXS6, RPD3, WTS, CDA07, deacetylaza histonowa 8,
identyfikatory zewnętrzne
	KDAC8
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Deacetylaza histonowa 8 jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen HDAC8 .

Funkcjonować

Histony odgrywają kluczową rolę w regulacji transkrypcji , progresji cyklu komórkowego i zdarzeniach rozwojowych. Acetylacja /deacetylacja histonów zmienia strukturę chromosomów i wpływa na dostęp czynników transkrypcyjnych do DNA. Białko kodowane przez ten gen należy do klasy I rodziny deacetylazy histonowej/acuc/apha. Ma aktywność deacetylazy histonowej i hamuje transkrypcję, gdy jest przywiązany do promotora .

Deacetylaza histonowa 8 bierze udział w morfogenezie czaszki i kontroli metabolicznej kompleksu transkrypcyjnego ERR-alfa / PGC1-alfa .

Znaczenie kliniczne

HDAC8 został powiązany z wieloma stanami chorobowymi, zwłaszcza z ostrą białaczką szpikową i jest powiązany z cytoszkieletem aktynowym w komórkach mięśni gładkich. siRNA ukierunkowane na HDAC8 wykazało działanie przeciwnowotworowe. Hamowanie apoptozy indukowanej przez HDAC8 obserwowano w chłoniakach z komórek T. Ponadto enzym HDAC8 odgrywa rolę w patogenezie nerwiaka niedojrzałego . W związku z tym pojawiło się zainteresowanie opracowaniem selektywnych inhibitorów HDAC8. Odkryto co najmniej 20 mutacji powodujących choroby w tym genie.

Interakcje

• ERR-alfa .

Zobacz też

• Deacetylaza histonowa

Dalsza lektura

•    Waltregny D, De Leval L, Glénisson W, Ly Tran S, North BJ, Bellahcène A, Weidle U, Verdin E, Castronovo V (2004). „Ekspresja deacetylazy histonowej 8, deacetylazy histonowej klasy I, jest ograniczona do komórek wykazujących zróżnicowanie mięśni gładkich w normalnych tkankach ludzkich” . Am J Pathol . 165 (2): 553–64. doi : 10.1016/S0002-9440(10)63320-2 . PMC 1618574 . PMID 15277229 .
•    Glénisson W, Waltregny D, Tran SL, North BJ, Verdin E, Colige A, Castronovo V (czerwiec 2005). „Deacetylaza histonowa HDAC8 wiąże się z alfa-aktyną mięśni gładkich i jest niezbędna dla kurczliwości komórek mięśni gładkich”. FASEB J. 19 (8): 966-8. doi : 10.1096/fj.04-2303fje . PMID 15772115 . S2CID 12006005 .
•    Wedel T, Van Eys GJ, Waltregny D, Glénisson W, Castronovo V, Vanderwinden JM (2006). „Nowe markery mięśni gładkich ujawniają nieprawidłowości mięśniówki jelit w ciężkich zaburzeniach motoryki jelita grubego”. Neurogastroenterol. Motil . 18 (7): 526–38. doi : 10.1111/j.1365-2982.2006.00781.x . PMID 16771768 . S2CID 58462 .
•    Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). „Deacetylazy histonów klasy II: wszechstronne regulatory”. Trendy Genet . 19 (5): 286–93. CiteSeerX 10.1.1.464.415 . doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . PMID 12711221 .
•   Hu E, Chen Z, Fredrickson T i in. (2000). „Klonowanie i charakterystyka nowej ludzkiej deacetylazy histonowej klasy I, która działa jako represor transkrypcji” . J. Biol. chemia . 275 (20): 15254–64. doi : 10.1074/jbc.M908988199 . PMID 10748112 .
•    Buggy JJ, Sideris ML, Mak P i in. (2001). „Klonowanie i charakterystyka nowej ludzkiej deacetylazy histonowej, HDAC8” . Biochem. J. _ 350 (1): 199–205. doi : 10.1042/0264-6021:3500199 . PMC 1221242 . PMID 10926844 .
•    Amann JM, Nip J, Strom DK i in. (2001). „ETO, cel t (8; 21) w ostrej białaczce, wyraźnie kontaktuje się z wieloma deacetylazami histonowymi i wiąże mSin3A poprzez swoją domenę oligomeryzacyjną” . Mol. Komórka. Biol . 21 (19): 6470–83. doi : 10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001 . PMC 99794 . PMID 11533236 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Durst KL, Lutterbach B, Kummalue T i in. (2003). „Białko fuzyjne inv (16) wiąże się z korepresorami poprzez domenę łańcucha ciężkiego miozyny mięśni gładkich” . Mol. Komórka. Biol . 23 (2): 607–19. doi : 10.1128/MCB.23.2.607-619.2003 . PMC 151524 . PMID 12509458 .
•   Rodriguez M, Yu X, Chen J, Songyang Z (2004). „Specyficzność wiązania fosfopeptydu domen BRCA1 COOH-końcowych (BRCT)” . J. Biol. chemia . 278 (52): 52914–8. doi : 10.1074/jbc.C300407200 . PMID 14578343 .
•     Johnson JM, Castle J, Garrett-Engele P i in. (2004). „Badanie obejmujące cały genom ludzkiego alternatywnego składania pre-mRNA za pomocą mikromacierzy łączących egzony”. nauka . 302 (5653): 2141-4. CiteSeerX 10.1.1.1017.9438 . doi : 10.1126/science.1090100 . PMID 14684825 . S2CID 10007258 .
•    Lee H, Rezai-Zadeh N, Seto E (2004). „Negatywna regulacja aktywności deacetylazy histonowej 8 przez cykliczną kinazę białkową A zależną od AMP” . Mol. Komórka. Biol . 24 (2): 765–73. doi : 10.1128/MCB.24.2.765-773.2004 . PMC 343812 . PMID 14701748 .
•    Vannini A, Volpari C, Filocamo G i in. (2004). „Struktura krystaliczna eukariotycznej deacetylazy histonowej zależnej od cynku, ludzkiego HDAC8, w kompleksie z inhibitorem kwasu hydroksamowego” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 101 (42): 15064–9. Bibcode : 2004PNAS..10115064V . doi : 10.1073/pnas.0404603101 . PMC 524051 . PMID 15477595 .
•   Waltregny D, North B, Van Mellaert F i in. (2005). „Badanie przesiewowe ekspresji deacetylaz histonowych (HDAC) w ludzkim raku prostaty ujawnia różne profile HDAC klasy I między komórkami nabłonkowymi i zrębowymi”. Europejski Dziennik Histochemii . 48 (3): 273–90. PMID 15590418 .
•    Waltregny D, Glénisson W, Tran SL i in. (2006). „Deacetylaza histonowa HDAC8 wiąże się z alfa-aktyną mięśni gładkich i jest niezbędna dla kurczliwości komórek mięśni gładkich”. FASEB J. 19 (8): 966-8. doi : 10.1096/fj.04-2303fje . PMID 15772115 . S2CID 12006005 .
•   Gantt SL, Gattis SG, Fierke CA (2006). „Aktywność katalityczna i hamowanie ludzkiej deacetylazy histonowej 8 zależy od tożsamości jonu metalu w miejscu aktywnym”. Biochemia . 45 (19): 6170–8. doi : 10.1021/bi060212u . PMID 16681389 .
•    Lee H, Sengupta N, Villagra A i in. (2006). „Deacetylaza histonowa 8 chroni ludzkie coraz krótsze telomery 1B (hEST1B) białko przed degradacją za pośrednictwem ubikwityny” . Mol. Komórka. Biol . 26 (14): 5259–69. doi : 10.1128/MCB.01971-05 . PMC 1592721 . PMID 16809764 .
•    Vannini A, Volpari C, Gallinari P i in. (2007). „Wiązanie substratu z deacetylazami histonowymi, jak pokazano na podstawie struktury krystalicznej kompleksu HDAC8-substrat” . Raporty EMBO . 8 (9): 879–84. doi : 10.1038/sj.embor.7401047 . PMC 1973954 . PMID 17721440 .
•   Nakagawa M, Oda Y, Eguchi T i in. (2007). „Profil ekspresji deacetylaz histonów klasy I w ludzkich tkankach nowotworowych” . onkol. przedstawiciel _ 18 (4): 769–74. doi : 10.3892/lub.18.4.769 . PMID 17786334 .

Linki zewnętrzne

• HDAC8 + białko, + człowiek w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .