Haplogrupa HV (mtDNA)

Haplogrupa HV
Możliwy czas pochodzenia > 24 tyś
Możliwe miejsce pochodzenia Azja Zachodnia ( Bliski Wschód lub Kaukaz )
Przodek R0
Potomków HV0, HV1, HV2, HV3, HV4, HV5, H
Definiowanie mutacji T14766C

Haplogrupa HV to haplogrupa ludzkiego mitochondrialnego DNA (mtDNA).

Pochodzenie

Haplogrupa HV wywodzi się z haplogrupy R0 , która z kolei wywodzi się z haplogrupy R. HV jest również kladem przodków haplogrup H i V . Możliwe pochodzenie haplogrupy HV znajduje się w regionie zachodniego Iranu, Mezopotamii i Kaukazu Południowego, gdzie stwierdzono najwyższą częstość występowania HV.

Dystrybucja

Haplogrupa HV występuje głównie w Azji Zachodniej , Azji Środkowej , Europie Południowej , Europie Wschodniej i Afryce Północnej .

W Afryce klad osiąga szczyty wśród Egipcjan zamieszkujących oazę El-Hayez (14,3%). z podkladą HV0 występującą wśród Berberów Mozabitów (8,24%), Libijczyków (7,4%), Reguibate Sahrawi (6,48%), Zenata Berberów (5,48%) i Algierczyków (łącznie 4,84%; 2,15% -3,75% w Oranie ).

W badaniu opublikowanym w 2013 r. haplogrupę HV(xHV0, H) stwierdzono w dużym odsetku populacji w Afganistanie : 11,0% (14/127) uzbecka (w tym 1/127 HV2 i 1/127 HV6), 8,2% (12/127) 146) Tadżycki (w tym 3/146 HV6 i 1/146 HV2), 8,0% (6/75) Turkmenów (w tym 1/75 HV2), 6,4% (5/78) Hazara i 5,6% (5/90) Pasztunów . Ponadto haplogrupa HV0 została znaleziona w 1,4% (2/146) próby afgańskich Tadżyków, ale nie jest jasne, czy należą one do haplogrupy V podklada. Podklada HV1a1a została znaleziona u 1,8% (3/169) Jakutów w jednym badaniu i 1,2% (5/423) Jakutów w innym badaniu opublikowanym w 2013 roku.

Opublikowano badanie z 2003 roku opisujące sekwencjonowanie mtDNA kości dwóch 24 000-letnich anatomicznie współczesnych ludzi typu Cro-Magnon z południowych Włoch . Badanie wykazało, że jeden należał do haplogrupy HV lub R0. Haplogrupa HV została również znaleziona wśród starożytnego Egiptu wykopanych na stanowisku archeologicznym Abusir el-Meleq w środkowym Egipcie, które pochodzą z okresu przedptolemejskiego / późnego Nowego Państwa , ptolemejskiego i rzymskiego .

Haplogrupę HV znaleziono w różnych skamielinach, które analizowano pod kątem starożytnego DNA, w tym okazów związanych z ceramiką liniową Alfölda (HV, Mezőkövesd-Mocsolyás, 1/3 lub 33%), Linearbandkeramik (HV0a, Fajsz-Garadomb, 1/2 lub 50%) i niemieckie kultury środkowego neolitu (HV, Quedlinburg, 1/2 lub 50%).

podklady

Drzewo

To drzewo filogenetyczne podkladów haplogrup HV jest oparte na artykule van Ovena (2009) oraz Malyarchuka i in. (2008).

  • WN
    • HV0 (wcześniej znany jako pre-V)
      • HV0a (wcześniej znany jako preV*2)
        • HV0a1
        • V
      • 195 (wcześniej znany jako preV*1)
        • HV0b
        • HV0c
    • HV1
      • HV1a
        • HV1a1
          • HV1a1a
        • HV1a2
      • HV1b
        • HV1b1
        • HV1b2
      • HV1c
    • 73
      • HV2
        • HV2a
    • HV4
      • HV4a
    • HV5
    • 16311 (wcześniej znany jako HV3) (13 ± 2 kya)
      • HV6 (wcześniej znany jako HV3b) (15,4 ± 4,5 kya)
        • HV6a (wcześniej znany jako HV3b1)
      • HV7 (wcześniej znany jako HV3c)
      • HV8 (wcześniej znany jako HV3d)
      • HV9 (wcześniej znany jako HV3a) (8,2 ± 2,9 kya)
        • 152
          • HV9a
      • HV10
    • H

HV0 i HVSI C16298T

Definiując mutację C / T w lokalizacji 16298 w segmencie I, jeden z segmentów hiperzmiennych jest oznaczony jako HV0 od 2012 r. Odsetek osób, które uzyskały pozytywny wynik testu na powyższą mutację w badaniu populacji zachodnioeuropejskich w 2002 r., podano poniżej.

Populacja #NIE % populacji
Finlandia 50 12
Norwegia 323 4
Szkocja 874 4
Anglia 262 3
Północne Niemcy 140 6
Południowe Niemcy 266 5
Francja 213 3
Galicja 135 5
Północna Portugalia 184 7
Środkowa Portugalia 162 3
Południowa Portugalia 196 4
północna Afryka 349 5

W badaniu populacji rosyjskiej i polskiej odsetek osób, które uzyskały pozytywny wynik testu na tę mutację, wyniósł pięć procent dla obu populacji.

Populacja #NIE Odsetek
Polski 436 5
Rosyjski 201 5

Badanie Irakijczyków podsumowało szereg wcześniejszych badań wykazujących niski poziom tej mutacji wśród populacji Bliskiego Wschodu i Włoch.

Populacja #NIE % populacji
iracki 216 0,5
syryjski 69 2.9
gruziński 139 0,7
Włoski 99 5.1

Mutacja ta została wykryta w starożytnym DNA uzyskanym z jednego z dziewiętnastu ludzkich szczątków wydobytych na wyspie Gotlandia w Szwecji, datowanych na 2800-2000 pne i sklasyfikowanych archeologicznie jako należące do kultury ceramiki bezzębnej .

Zobacz też

Drzewo filogenetyczne haplogrup ludzkiego mitochondrialnego DNA (mtDNA)

  Mitochondrialna Ewa ( L )    
L0 L1–6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
M N  
CZ D mi G Q   O A S R   I W X Y
C Z B F R0   przed JT   P   u
WN JT k
H V J T
  1. Bibliografia _ (2008): „Głównymi składnikami środkowego górnego paleolitu (26 000 YBP) były HV *, U1, prawdopodobnie U2 i U4, a głównym składnikiem wczesnego górnego paleolitu (45 000 YBP) była głównie haplogrupa U5”
  2. Bibliografia _ (2008): „Sugerowano, że większość haplogrup HV znajdowanych obecnie w Europie pochodzi z regionu Bliskiego Wschodu i Kaukazu (Richards i in. 2000; Tambets i in. 2000), ale nadal istnieje wiele pytań dotyczących klasyfikacji haplogrupy należące do rodziny HV”.
  3. ^ ab ; Van Piekarnik, Mannis    Kayser, Manfred (2009). „Zaktualizowane kompleksowe drzewo filogenetyczne globalnej zmienności ludzkiego mitochondrialnego DNA” . Ludzka mutacja . 30 (2): E386–94. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
  4. ^     Shamoon-Pour, Michel; Li, Mian; Merriwether, D. Andrew (14 października 2019). „Rzadkie ludzkie mitochondrialne linie HV rozprzestrzeniły się z Bliskiego Wschodu i Kaukazu podczas ekspansji po LGM i neolicie” . Raporty naukowe . 9 (1). doi : 10.1038/s41598-019-48596-1 . eISSN 2045-2322 . PMC 6791841 . PMID 31611588 .
  5. Bibliografia   _ Luiza Pereira; Weronika Fernandes; Joana B. Pereira; Wiktor Cerny (2009). „Bliskowschodni neolityczny wkład genetyczny w małej oazie egipskiej pustyni zachodniej”. American Journal of Physical Anthropology . 140 (2): 336–346. doi : 10.1002/ajpa.21078 . PMID 19425100 .
  6. ^ a b c d    Asmahan Bekada; Lara R. Arauna; Tahria Deba; Francesc Calafell; Soraya Benhamamouch; David Comas (24 września 2015). „Heterogeniczność genetyczna w algierskich populacjach ludzkich” . PLOS JEDEN . 10 (9): e0138453. Bibcode : 2015PLoSO..1038453B . doi : 10.1371/journal.pone.0138453 . PMC 4581715 . PMID 26402429 . ; Tabela S5
  7. Bibliografia   _ Laura Rodríguez-Botigué; Nejib Naoui; Amel Benammar-Elgaaied; Francesc Calafell; David Comas (maj 2011). „Struktura mitochondrialnego DNA w Afryce Północnej ujawnia genetyczną nieciągłość w Dolinie Nilu” (PDF) . American Journal of Physical Anthropology . 145 (1): 107–117. doi : 10.1002/ajpa.21472 . hdl : 10261/42802 . PMID 21312180 . Źródło 20 kwietnia 2016 r .
  8. ^ a b Di Cristofaro J, Pennarun E, Mazières S, Myres NM, Lin AA i in. (2013), „Afghan Hindukusz: gdzie zbiegają się przepływy genów subkontynentu euroazjatyckiego”. PLoS JEDEN 8(10): e76748. doi:10.1371/journal.pone.0076748
  9. ^ Duggan AT, Whitten M, Wiebe V, Crawford M, Butthof A i in. (2013), „Badanie prehistorii ludów tunguskich Syberii i regionu Amur-Ussuri z kompletnymi sekwencjami genomu mtDNA i markerami chromosomu Y”. PLoS JEDEN 8(12): e83570. doi:10.1371/journal.pone.0083570
  10. ^ Sardana A Fedorova, Maere Reidla, Ene Metspalu i in. , „Autosomalne i jednorodzicielskie portrety rdzennych populacji Sacha (Jakucja): implikacje dla zaludnienia północno-wschodniej Eurazji”. Biologia ewolucyjna BMC 2013, 13:127. http://www.biomedcentral.com/1471-2148/13/127
  11. Bibliografia    _ Lalueza-Fox, C; Vernesi, C; Lari, M; Casoli, A; Mallegni, F; Chiarelli, B.; Dupanloup, I; i in. (2003). „Dowody na genetyczną nieciągłość między neandertalczykami a anatomicznie współczesnymi Europejczykami sprzed 24 000 lat” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 100 (11): 6593–7. Bibcode : 2003PNAS..100.6593C . doi : 10.1073/pnas.1130343100 . PMC 164492 . PMID 12743370 .
  12. ^    Schuenemann, Verena J.; i in. (2017). „Genomy mumii starożytnego Egiptu sugerują wzrost pochodzenia z Afryki Subsaharyjskiej w okresach post-rzymskich” . Komunikacja natury . 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo...815694S . doi : 10.1038/ncomms15694 . PMC 5459999 . PMID 28556824 .
  13. Bibliografia    _ i in. (2017). „Równoległe transekty paleogenomiczne ujawniają złożoną historię genetyczną wczesnych rolników europejskich” . Natura . 551 (7680): 368–372. Bibcode : 2017Natur.551..368L . doi : 10.1038/natura24476 . PMC 5973800 . PMID 29144465 . Źródło 15 listopada 2017 r .
  14. ^   Maljarchuk, B.; Grzybowski T.; Derenko, M.; Perkowa, M.; Vanecek, T.; Lazur, J.; Gomolcak, P.; Cybowski, I. (2008). „Filogeneza mitochondrialnego DNA u Słowian wschodnich i zachodnich” . Biologia molekularna i ewolucja . 25 (8): 1651–8. doi : 10.1093/molbev/msn114 . PMID 18477584 .
  15. ^ Miejsce mitochondrialnego DNA haplogrupy HV Iana Logana 2009
  16. Bibliografia _ (2008): „Wiek koalescencji całego HV3 określony przez przejście w np 16311 wynosi 12 700 ± 1960 YBP. Należy jednak zauważyć, że HV3 może być polifiletyczny ze względu na hiperzmienność np 16311. Tymczasem podgrupy HV3a i HV3b są prawdopodobnie monofiletyczne, a ich wiek oszacowano odpowiednio na 8200 ± 2900 i 15420 ± 4500 YBP.Jednak HV3b charakteryzuje się wysokim stosunkiem podstawień niesynonimicznych do synonimicznych, więc jego wiek koalescencji można oszacować na 11837 ± 4460 YBP, stosując wskaźnik zasugerowali Kivisild i wsp. (2006) (tabela 2). To samo prawdopodobnie odnosi się do szacowania wieku haplogrupy HV4”.
  17. ^   González, AM; Brehm, A; Perez, JA; Maca-Meyer, N; Flores, C; Cabrera, VM (2003). „Powinowactwa mitochondrialnego DNA na atlantyckich obrzeżach Europy”. American Journal of Physical Anthropology . 120 (4): 391–404. doi : 10.1002/ajpa.10168 . PMID 12627534 .
  18. ^    Maljarchuk, BA; Grzybowski, T; Derenko, MV; Czarny, J; Woźniak, M; Miścicka-Śliwka, D (2002). „Zmienność mitochondrialnego DNA u Polaków i Rosjan”. Annals of Human Genetics . 66 (cz. 4): 261–83. doi : 10.1046/j.1469-1809.2002.00116.x . PMID 12418968 . S2CID 221424344 .
  19. ^   Al-Zahery, N; Semino, O; Benuzzi, G; Magri, C; Passarino, G; Torroni, A; Santachiara-Benerecetti, AS (2003). „Polimorfizmy chromosomu Y i mtDNA w Iraku, skrzyżowanie wczesnego rozprzestrzeniania się ludzi i migracji po neolicie”. Filogenetyka molekularna i ewolucja . 28 (3): 458–72. doi : 10.1016/S1055-7903(03)00039-3 . PMID 12927131 .
  20. ^    Malmström, Helena; Gilbert, M. Thomas P .; Thomas, Mark G.; Brandström, Mikael; Storå, Jan; Molnar, Petra; Andersen, Pernille K.; Bendixen, chrześcijanin; i in. (2009). „Starożytne DNA ujawnia brak ciągłości między neolitycznymi łowcami-zbieraczami a współczesnymi Skandynawami” . Bieżąca biologia . 19 (20): 1758–62. doi : 10.1016/j.cub.2009.09.017 . PMID 19781941 . S2CID 9487217 .

Linki zewnętrzne

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Haplogroup_HV_(mtDNA)&oldid=1121801589 ”