izoschizomer
Izoschizomery to pary enzymów restrykcyjnych specyficznych dla tej samej rozpoznawanej sekwencji . Na przykład SphI (CGTAC/G) i BbuI (CGTAC/G) są wzajemnymi izoschizomerami. Pierwszy enzym , który rozpoznaje daną sekwencję, jest znany jako prototyp ; wszystkie następnie zidentyfikowane enzymy, które rozpoznają tę sekwencję, są izoschizomerami. Izoschizomery są izolowane z różnych szczepów bakterii i dlatego mogą wymagać różnych warunków reakcji .
W niektórych przypadkach tylko jeden z pary izoschizomerów może rozpoznać zarówno metylowane , jak i niemetylowane formy miejsc restrykcyjnych . W przeciwieństwie do tego, inny enzym restrykcyjny może rozpoznawać tylko niemetylowaną postać miejsca restrykcyjnego. Ta właściwość niektórych izoschizomerów pozwala na identyfikację stanu metylacji miejsca restrykcyjnego podczas izolowania go ze szczepu bakteryjnego . Na przykład, enzymy restrykcyjne HpaII i MspI są izoschizomerami, ponieważ oba rozpoznają sekwencję 5'-CCGG-3', gdy jest ona niemetylowana. Ale kiedy drugie C sekwencji jest metylowane, tylko MspI może je rozpoznać, podczas gdy HpaII nie.
Enzym, który rozpoznaje tę samą sekwencję, ale tnie ją inaczej, to neoschizomer . Neoschizomery to specyficzny typ (podzbiór) izoschizomerów. Na przykład SmaI (CCC/GGG) i XmaI (C/CCGGG) są swoimi neoschizomerami. Podobnie KpnI (GGTAC/C) i Acc65I (G/GTACC) są swoimi neoschizomerami. Enzym, który rozpoznaje nieco inną sekwencję, ale wytwarza te same końce, to izokaudomer .