Kinaza polinukleotydowa 5'-hydroksylowa
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5'-hydroksykinazy polideoksyrybonukleotydowej zależnej od ATP | |||||||||
| nr WE | 2.7.1.78 | ||||||||
| Nr CAS | 37211-65-7 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| EXPASY | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYAM | profil | ||||||||
| Struktury WPD | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
W enzymologii polinukleotydowa 5' -hydroksykinaza ( EC 2.7.1.78 ) jest enzymem katalizującym reakcję chemiczną
- ATP + 5'-defosfo-DNA ADP + 5'-fosfo-DNA
Zatem dwoma substratami tego enzymu są ATP i 5'-defosfo-DNA, podczas gdy jego dwoma produktami są ADP i 5'-fosfo-DNA. Kinaza polinukleotydowa jest enzymem bakteriofaga T7 (lub bakteriofaga T4 ) , który katalizuje przeniesienie gamma- fosforanu z ATP na wolny koniec hydroksylowy 5' DNA lub RNA . Powstały produkt można zastosować do znakowania końcowego DNA lub RNA lub w reakcjach ligacji.
Nomenklatura
Enzym ten należy do rodziny transferaz , w szczególności przenoszących grupy zawierające fosfor ( fosfotransferazy ), których akceptorem jest grupa alkoholowa. Nazwa systematyczna tej klasy enzymów to ATP:5'-defosfopolinukleotyd 5'-fosfotransferaza . Inne powszechnie używane nazwy to:
- ATP: 5'-defosfopolinukleotyd 5'-fosfataza
- PNK
- kinaza polinukleotydowa 5'-hydroksylowa (fosforylująca),
- kinaza polinukleotydowa 5'-hydroksylowa,
- kinaza polirybonukleotydowa 5'-hydroksylowa,
- kinaza 5'-hydroksylowego RNA,
- kinaza 5'-hydroksylowa DNA,
- kinaza DNA,
- kinaza polinukleotydowa i
- polinukleotydowa 5'-hydroksykinaza.
- Nowogrodzki A, Hurwitz J (1966). „Enzymatyczna fosforylacja kwasu rybonukleinowego i kwasu dezoksyrybonukleinowego. I. Fosforylacja na końcach 5'-hydroksylowych”. J. Biol. Chem . 241 (12): 2923–32. PMID 4287929 .
- Nowogrodzki A, Tal M, Traub A, Hurwitz J (1966). „Enzymatyczna fosforylacja kwasu rybonukleinowego i kwasu dezoksyrybonukleinowego. II. Dalsze właściwości kinazy polinukleotydowej 5'-hydroksylowej”. J. Biol. Chem . 241 (12): 2933–43. PMID 4287930 .
Linki zewnętrzne
