Kinaza szikimowa

Kinaza szikimowa
1e6c opm.png
Kinaza szikimowa Erwinia chrysanthemi
Identyfikatory
Symbol NARTY
Pfam PF01202
Klan Pfam CL0023
InterPro IPR000623
PROZYTA PDOC00868
SCOP2 2shk / ZAKRES / SUPFAM
Nadrodzina OPM 124
Białko OPM 1e6c
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury
Kinaza szikimowa
Shikimate kinase cartoon.png
Kreskówka przedstawiająca kinazę szikimową z Mycobacterium tuberculosis . α-Helisy są pokazane na czerwono, środkowy arkusz β na żółto, a pętle na zielono.
Identyfikatory
nr WE 2.7.1.71
nr CAS 9031-51-0
Bazy danych
IntEnz Widok IntEnz
BRENDA Wpis BRENDY
ExPASy Widok NiceZyme
KEGG Wpis KEGG
MetaCyc szlak metaboliczny
PRYM profil
Struktury PDB RCSB PDB PDBe PDB suma
Ontologia genów AmiGO / QuickGO
Szukaj
PKW artykuły
PubMed artykuły
NCBI białka

Kinaza szikimowa ( EC 2.7.1.71 ) jest enzymem, który katalizuje zależną od ATP fosforylację szikimatu z wytworzeniem 3-fosforanu szikimatu . Ta reakcja jest piątym etapem szlaku szikimowego, który jest wykorzystywany przez rośliny i bakterie do syntezy wspólnego prekursora aminokwasów aromatycznych i metabolitów wtórnych. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to ATP:shikimate 3-fosfotransferaza . Inne powszechnie używane nazwy to kinaza szikimowa (fosforylująca) i kinaza szikimowa II .

Tło

Szlak szikimowy składa się z siedmiu reakcji enzymatycznych, w których fosfoenolopirogronian i 4-fosforan erytrozy są przekształcane w choryzmian , wspólny prekursor aromatycznych aminokwasów fenyloalaniny , tyrozyny i tryptofanu . Aminokwasy aromatyczne są wykorzystywane w syntezie białek, a w roślinach, grzybach i bakteriach dają początek wielu innym wyspecjalizowanym metabolitom, takim jak fenylopropanoidy i alkaloidy . Chorismian i kilka innych półproduktów szlaku służy jako prekursory wielu innych metabolitów, takich jak foliany, chiniany i chinony. Cztery enzymy, które poprzedzają kinazę szikimową na szlaku, to syntaza DAHP , syntaza 3-dehydrochinatu , dehydrataza 3-dehydrochinanu i dehydrogenaza szikimianu , a dwa następujące po nim to syntaza EPSP i syntaza choryzmianu . U grzybów i protistów jest częścią kompleksu AROM, w którym znajduje się pięć centralnych etapów szlaku szikimowego. Szlak ten nie występuje u ludzi i innych zwierząt, które muszą otrzymywać aromatyczne aminokwasy z pożywienia.

Działalność

Reakcję katalizowaną przez kinazę szikimową przedstawiono poniżej:

reaction catalyzed by shikimate kinase
Wypełniający przestrzeń model kinazy szikimowej z ADP i związanym 3-fosforanem szikimowym.

Ta reakcja obejmuje przeniesienie grupy fosforanowej z ATP na grupę 3-hydroksylową szikimatu. Kinaza szikimowa ma zatem dwa substraty , szikimat i ATP oraz dwa produkty , 3-fosforan szikimowy i ADP .

Przykłady

Białka ludzkie zawierające tę domenę obejmują: MAPK7 i THLNSL1