Metanocaldococcus jannaschii

Methanocaldococcus jannaschii
Klasyfikacja naukowa
Domena:	Archeony
Królestwo:	euryarchaeota
Gromada:	euryarchaeota
Klasa:	metanokoki
Zamówienie:	metanokoki
Rodzina:	Metanocaldococcaceae
Rodzaj:	Metanocaldococcus
Gatunek:	M. jannaschii
Nazwa dwumianowa
	Methanocaldococcus jannaschii ;
Synonimy
	Methanococcus jannaschii (Jones 1983) ;

Methanocaldococcus jannaschii (dawniej Methanococcus jannaschii ) to termofilny metanogenny archaean z klasy Methanococci . Był to pierwszy archeon, którego pełny genom został zsekwencjonowany . Sekwencjonowanie zidentyfikowało wiele genów unikalnych dla archeonów. Wiele szlaków syntezy kofaktorów metanogennych zostało opracowanych biochemicznie w tym organizmie, podobnie jak kilka innych szlaków metabolicznych specyficznych dla archeonów.

Historia

Methanocaldococcus jannaschii został wyizolowany z podwodnego komina hydrotermalnego w Woods Hole Oceanographic Institution .

Sekwencjonowanie

Methanocaldococcus jannaschii został zsekwencjonowany przez grupę w TIGR kierowaną przez Craiga Ventera przy użyciu sekwencjonowania strzelby całego genomu . Methanocaldococcus jannaschii reprezentował pierwszego przedstawiciela Archaea, którego genom został zsekwencjonowany. Według Ventera unikalne cechy genomu dostarczyły mocnych dowodów na to, że istnieją trzy domeny życia .

Taksonomia

Methanocaldoccus jannaschii należy do rodzaju Methanocaldococcus (wcześniej część Methanococcus ) i dlatego jest czasami określany jako metanogen „klasy I” (np. [1] ).

Biologia i biochemia

Methanocaldococcus jannaschii jest termofilnym metanogenem , co oznacza, że rośnie poprzez wytwarzanie metanu jako metabolicznego produktu ubocznego . Jest zdolny do wzrostu tylko na dwutlenku węgla i wodorze jako pierwotnych źródłach energii, w przeciwieństwie do wielu innych metanokoków (takich jak Methanococcus maripaludis ), które mogą również wykorzystywać mrówczan jako podstawowe źródło energii. Genom zawiera wiele hydrogenaz , takich jak hydrogenaza 5,10-metenylotetrahydrometanopteryny , hydrogenaza ferredoksyny (eha) i koenzymu hydrogenazy F420 .

proteomiczne wykazały, że M. jannaschii zawiera dużą liczbę intein : 19 zostało odkrytych w jednym badaniu.

M. jannaschii opracowano wiele nowych szlaków metabolicznych , w tym szlaki syntezy wielu kofaktorów metanogennych, ryboflawiny i nowe szlaki syntezy aminokwasów. ^{[ Potrzebne źródło ]} W tym organizmie zbadano również wiele ścieżek przetwarzania informacji, takich jak rodzina polimeraz DNA specyficzna dla archeonów . Informacje o jednoprzebiegowych białkach transbłonowych M. jannaschii zebrano w bazie danych Membranome .

Dalsza lektura

Gao, Yongxiang (listopad 2013). „Krystalizacja i wstępna analiza dyfrakcji rentgenowskiej MJ0458, kinazy adenylanowej z Methanocaldococcus jannaschii ” . Acta Crystallographica Sekcja F . 69 (11): 1272–1274. doi : 10.1107/S1744309113026638 . PMC 3818051 . PMID 24192367 .
Wang, Yu; Xu, Huimin; Biały, Robert H. (sierpień 2014). „Biosynteza beta-alaniny w Methanocaldococcus jannaschii ” . Amerykańskie Towarzystwo Mikrobiologiczne . 196 (15): 2869–2875. doi : 10.1128/JB.01784-14 . PMC 4135672 . PMID 24891443 .
Allen, Kyle D.; Xu, Huimin; Biały, Robert H. (wrzesień 2014). „Identyfikacja unikalnej rodnikowej metylazy S-adenozylometioniny prawdopodobnie zaangażowanej w biosyntezę metanopteryny w Methanocaldococcus jannaschii ” . Journal of Bacteriology . 196 (18): 3315–3323. doi : 10.1128/JB.01903-14 . PMC 4135684 . PMID 25002541 .
Lee, Eun Hye; Lee, Kitaik; Hwang, Kwang Yeon (13 grudnia 2013). „Charakterystyka strukturalna i porównanie dużych podjednostek izomerazy IPM i homoakonitazy z Methanococcus jannaschii ”. Acta Crystallographica Sekcja D . 70 (4): 922–931. doi : 10.1107/S1399004713033762 . PMID 24699638 .
Jeffrey M. Dick, Everett L. Shock: Uwalnianie energii podczas syntezy białek w podwodnych ekosystemach hydrotermalnych hostowanych przez Ultramafic . W: AGU Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, tom 126, wydanie 11, e2021JG006436. doi:10.1029/2021JG006436 . Pierwsza publikacja: 30 października 2021 r. Zobacz też: Nowe możliwości życia w dziwnym, ciemnym świecie na dnie oceanu Ziemi – i być może w oceanach na innych planetach w SciTechDaily. 28 listopada 2021 r. Źródło: Arizona State University

Linki zewnętrzne