Hydrolaza palmitoilo-CoA
| identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| hydrolazy palmitoilo-CoA | |||||||||
| nr WE | 3.1.2.2 | ||||||||
| nr CAS | 9025-87-0 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Hydrolaza palmitoilo-CoA (EC 3.1.2.2) jest enzymem z rodziny hydrolaz, który specyficznie działa na wiązania tioestrowe. Katalizuje hydrolizę długołańcuchowych tioestrów acylowych kwasów tłuszczowych acylowego białka nośnikowego lub koenzymu A z wytworzeniem wolnego kwasu tłuszczowego i odpowiedniego tiolu:
- palmitoilo-CoA + H2O = CoA + palmitynian
Ma ścisłą specyficzność dla tioestrów z ogniwem łańcucha większym niż C10 .
Enzymy te są zlokalizowane w prawie wszystkich przedziałach komórkowych, takich jak retikulum endoplazmatyczne, cytozol, mitochondria i peroksysomy. Są one silnie regulowane przez receptory aktywowane przez proliferatory peroksysomów, co prowadzi do ich udziału w metabolizmie lipidów. Enzym jest regulowany w górę w okresach zwiększonego utleniania kwasów tłuszczowych, co sugeruje, że enzym ten może odgrywać potencjalną rolę w beta-oksydacji peroksysomów.
Nazwa systematyczna to hydrolaza palmitoilo-CoA . Inne powszechnie stosowane nazwy to długołańcuchowa hydrolaza acylo-CoA, hydrolaza palmitoilo-koenzymu A, tioesteraza palmitoilu, hydrolaza palmitoilo-koenzymu A, deacylaza palmitoilo-CoA, tioesteraza palmitylu, deacylaza palmitylo-CoA, tioesteraza acylu tłuszczowego I i tioesteraza palmitylu ja .
Studia strukturalne
Pod koniec 2007 roku rozwiązano 3 struktury dla tej klasy enzymów o kodach dostępu PDB 1TBU , 2Q2B i 2QQ2 .
Mechanizm
Na poziomie subkomórkowym hydrolaza palmitoilo-CoA jest zlokalizowana w retikulum endoplazmatycznym, cytozolu, mitochondriach i peroksysomach. Badania wykazały, że u szczurów karmionych dietą wysokotłuszczową aktywność hydrolazy palmitoilo-CoA w wątrobie wzrosła. Chociaż szczegóły tego mechanizmu nie są znane, wyniki sugerują, że istnieje mechanizm „indukcji” dla hydrolazy palmitoilo-CoA i peroksysomalnych enzymów beta-oksydacji.
Istotność choroby
Cukrzyca jest najczęstszą przyczyną chorób wątroby w USA, cukrzyca typu 2. Przeprowadzono badania, aby wykazać, że chociaż nie ma bezpośredniej korelacji między hydrolazą palmitoilo-CoA a cukrzycą, cukrzyca wywołana streptozotocyną znacznie zmniejszyła hydrolazę palmitoilo-CoA w wątrobie szczura. Doprowadziło to do wysokiego poziomu tłuszczowego acylo-CoA obecnego w wątrobie, co pokazuje, że chora wątroba nie może regulować ilości obecnego tłuszczowego acylo-CoA w porównaniu z normalną, zdrową wątrobą. Defekt degradacji acylo-CoA w wątrobie może powodować hiperamonemię i hipoglikemię.
- Barnes EM Jr; Wakil SJ (1968). „Badania nad mechanizmem syntezy kwasów tłuszczowych. XIX. Wytwarzanie i ogólne właściwości tioesterazy palmitylowej” . Dziennik Chemii Biologicznej . 243 (11): 2955–62. doi : 10.1016/S0021-9258(18)93365-X . PMID 4871199 .
- Berge RK, Farstad M (1981). „Długołańcuchowa tłuszczowa hydrolaza acylo-CoA z mitochondriów wątroby szczura”. Metody w enzymologii 71 Pt . C : 234–42. doi : 10.1016/0076-6879(81)71030-9 . PMID 6116156 .
- Miyazawa S, Furuta S, Hashimoto T (1981). „Indukcja nowej długołańcuchowej hydrolazy acylo-CoA w wątrobie szczura przez podawanie proliferatorów peroksysomów”. Europejski Dziennik Biochemii . 117 (2): 425–30. doi : 10.1111/j.1432-1033.1981.tb06356.x . PMID 6115749 .
- Srere PA, Seubert W, Lynen F (1959). „Deacylaza palmitylo-koenzymu A” (PDF) . Biochimica et Biophysica Acta . 33 (2): 313–319. doi : 10.1016/0006-3002(59)90118-0 . hdl : 2027.42/32457 . PMID 13670899 .
- Yabusaki KK; Ballou CE (1981). Długołańcuchowe tioesterazy tłuszczowe acylo-CoA z Mycobacterium smegmatis . Metody w enzymologii. Tom. 71. s. 242–246. doi : 10.1016/0076-6879(81)71031-0 . ISBN 978-0-12-181971-2 .
- Berge RK, Nilsson A, Husøy AM (1988). „Szybka stymulacja syntetazy palmitoilo-CoA wątroby, palmitoilotransferazy karnitynowej i acylotransferazy glicerofosforanowej w porównaniu z β-oksydacją peroksysomów i hydrolazą palmitoilo-CoA u szczurów karmionych dietą wysokotłuszczową”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Lipidy i metabolizm lipidów . 960 (3): 417–26. doi : 10.1016/0005-2760(88)90050-1 . Identyfikator PMID 2898261 .
- Berge RK, Thomassen MS (1985). „Wpływ diety wysokotłuszczowej na aktywność hydrolazy palmitoilo-CoA w wątrobie szczura”. Lipidy . 20 (1): 49–52. doi : 10.1007/bf02534363 . PMID 2857471 . S2CID 4036488 . .
- Berge RK, Farstad M (1979). „Oczyszczanie i charakterystyka długołańcuchowej hydrolazy acylo-CoA z mitochondriów wątroby szczura”. Dziennik FEBS . 96 (2): 393–401. doi : 10.1111/j.1432-1033.1979.tb13051.x . PMID 37085 .
- Barnes E, Wakil S (1968). „Badania mechanizmu syntezy kwasów tłuszczowych” . Dziennik Chemii Biologicznej . 243 (11): 2955–2962. doi : 10.1016/S0021-9258(18)93365-X .
- Tolman K, Fonseca V, Dalpiazm A, Tan M (2007). „Spektrum chorób wątroby w cukrzycy typu 2 i postępowanie z pacjentami z cukrzycą i chorobami wątroby” . Opieka nad cukrzycą . 30 (3): 734–743. doi : 10.2337/dc06-1539 . PMID 17327353 .
- Dang AQ, Fass FH (1984). „Wpływ cukrzycy wywołanej streptozotocyną na syntetazę i hydrolazę mikrosomalnego długołańcuchowego acylo-CoA tłuszczowego”. Lipidy . 19 (8): 578–582. doi : 10.1007/bf02534714 . PMID 6148682 . S2CID 4045839 .
- Tilton G, Shockey J, Przeglądaj J (2004). „Charakterystyka biochemiczna i molekularna ACH2, tioesterazy acylo-CoA z Arabidopsis thaliana ” . Dziennik Chemii Biologicznej . 279 (9): 7487–7494. doi : 10.1074/jbc.M309532200 . PMID 14660652 .
