Parachlamydiaceae
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Parachlamydiaceae | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | Chlamydiota |
| Klasa: | Chlamydia |
| Zamówienie: | Chlamydia |
| Rodzina: |
Parachlamydiaceae Everett et al. , 1999 |
| Rodzaj | |
|
|
Parachlamydiaceae to rodzina bakterii z rzędu Chlamydiales . Gatunki z tej rodziny mają cykl replikacji podobny do chlamydii , a ich geny rybosomalnego RNA są w 80–90% identyczne z genami rybosomalnymi Chlamydiaceae . Parachlamydiaceae naturalnie infekują ameby i mogą być hodowane w hodowlach komórek Vero . Parachlamydiaceae nie są rozpoznawane przez przeciwciała monoklonalne , które wykrywają lipopolisacharyd Chlamydiaceae . [ potrzebne źródło ]
Filogeneza
Obecnie akceptowana taksonomia jest oparta na Liście nazw prokariotycznych z obowiązującą nomenklaturą (LPSN) i National Center for Biotechnology Information (NCBI)
| LTP oparty na 16S rRNA _01_2022 | 120 białek markerowych opartych na GTDB 07-RS207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Gatunki nieprzypisane:
- „ Ca. Mesochlamydia elodeae” Corsaro i in. 2012
- „ Ca. Metachlamydia lacustris” Corsaro i in. 2010
Izolowane endosymbionty obejmują:
- Coccus Halla
- P9
- UV-7
- endosymbiont Acanthamoeba sp. TUME1
- endosymbiont Acanthamoeba sp. UWC22
- endosymbiont Acanthamoeba sp. UWE1
Niehodowane rodowody obejmują:
- Neochlamydia typ 1
- środowiskowa Neochlamydia
- korvenA4
- cvC15
- cvC7
- cvE5
Parachlamydia acanthamoebae ma zmienną charakterystykę barwienia metodą Grama i jest mezofilna . Trofozoity Acanthamoeba będące żywicielami tych szczepów zostały wyizolowane od bezobjawowych kobiet w Niemczech , a także podczas wybuchu gorączki nawilżającej („Koks Halla”) w Vermont w USA. [ potrzebne źródło ] Czterech pacjentów z Nowej Szkocji , których surowice rozpoznały coccus Halla, nie wykazało serologicznej reakcji krzyżowej z antygenami Chlamydiaceae.
Notatki
Metachlamydia lacustris i Protochlamydia zostały znalezione w Narodowym Centrum Informacji Biotechnologicznej (NCBI), ale nie są zgodne z Kodeksem bakteriologicznym (z 1990 r. i późniejszymi zmianami), jak wyszczególniono w Liście nazw prokariotycznych w nomenklaturze (LPSN), z następujących powodów: • Brak wyizolowanej lub dostępnej czystej kultury dla prokariotów. • Nieważnie opublikowana, ponieważ obowiązująca publikacja dokumentuje jedynie depozyt typu szczepu w jednej uznanej kolekcji kultur.
• Nie zatwierdzone i opublikowane przez International Journal of Systematic Bacteriology lub International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).