Pracownia Odkrywców
Discovery Studio to pakiet oprogramowania do symulacji układów małocząsteczkowych i makrocząsteczkowych . Jest rozwijany i dystrybuowany przez Dassault Systemes BIOVIA (dawniej Accelrys).
Pakiet produktów ma silny program współpracy akademickiej , wspierający badania naukowe i wykorzystuje szereg algorytmów oprogramowania opracowanych pierwotnie w społeczności naukowej, w tym CHARMM , MODELLER , DELPHI , ZDOCK, DMol3 i inne.
Zakres
Discovery Studio dostarcza oprogramowanie obejmujące następujące obszary:
- Symulacje
- W tym mechanika molekularna , dynamika molekularna , mechanika kwantowa
- W przypadku symulacji opartych na mechanice molekularnej: uwzględnij modele rozpuszczalników i modele membranowe oparte na implicit i explicit
- Obejmuje również możliwość wykonywania hybrydowych obliczeń QM/MM
- Ligand Design
- Zawiera narzędzia do wyliczania bibliotek molekularnych i optymalizacji bibliotek
-
Modelowanie farmakoforów
- W tym tworzenie, walidacja i wirtualne badania przesiewowe
-
Projektowanie oparte na strukturze,
- w tym narzędzia do umieszczania i udoskonalania fragmentów , dokowania receptora-ligandu i udoskonalania pozy, projektowanie de novo
- Projektowanie i walidacja makrocząsteczek
- Inżynieria makrocząsteczkowa
- Specjalistyczne narzędzia do dokowania białko-białko
- Specjalistyczne narzędzia do projektowania i optymalizacji przeciwciał
- Specjalistyczne narzędzia do białek związanych z błoną , w tym GPCR
-
QSAR
- Obejmuje metody, takie jak wielokrotna regresja liniowa , częściowe najmniejsze kwadraty , partycjonowanie rekurencyjne , aproksymacja funkcji genetycznych i QSAR oparty na polach 3D
- DODAJ MNIE
- Toksyczność predykcyjna
Zobacz też
- Programy mechaniki molekularnej
- Oprogramowanie mechaniki kwantowej
- Modelowanie molekularne
- Oprogramowanie do projektowania molekularnego
- Modelowanie homologii białek
- Dzwonek MDL
Linki zewnętrzne
- Accelrys.com
- Pracownia Odkrywców
- Wspieranie darmowych narzędzi programowych: Discovery Studio Visualizer i formantów ActiveX