QRICH1
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| QRICH1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , bogate w glutaminę 1, VERBRAS, AB-DIP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
QRICH1 , znane również jako białko bogate w glutaminę 1 , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen QRICH1 . Jedną z godnych uwagi cech tego białka jest to, że zawiera domenę rekrutacji aktywacji kaspazy, znaną również jako domena CARD . Uważa się, że w wyniku posiadania tej domeny QRICH1 bierze udział w szlakach odpowiedzi apoptotycznej, zapalnej i odpowiedzi immunologicznej gospodarza.
| Numery dostępu | Lokalizacja | Identyfikatory | MW | Liczba Pi |
|---|---|---|---|---|
| mRNA: NM_017730.2 białko: NP_060200.2 |
3p21.31 | FLJ20259, MFC131838 | 86,4 kDa | 5,59 |
Gen
Gen QRICH1 ma długość 64 363 par zasad i koduje transkrypt mRNA o długości 3331 pz. QRICH1 znajduje się na chromosomie 3p21.31 i zawiera 11 eksonów . Sekwencja genomowa zaczyna się od pary zasad 49 057 531 i kończy na parze zasad 49 141 201.
Funkcjonować
Dokładna funkcja QRICH1 nie jest dobrze rozumiana przez społeczność naukową. Uważa się jednak, że bierze udział w procesach, takich jak zapalenie i apoptoza , ze względu na obecność domeny CARD w pobliżu początku sekwencji białka. Przewiduje się, że białko to lokalizuje się w jądrze i wiadomo, że oddziałuje z białkami ATXN1 i ATF7IP pokazanymi na poniższym obrazku.
Białko
Białko bogate w glutaminę 1 ma długość 776 aminokwasów . Reszty glutaminy są liczne i obejmują 109 aminokwasów lub 14% białka. Białko zawiera trzy odrębne domeny. Pierwsza, domena CARD, jest członkiem nadrodziny fałd śmierci i bierze udział w szlakach sygnałowych apoptozy, sygnalizacji immunologicznej, stanach zapalnych i mechanizmach obronnych gospodarza. Druga domena to domena bogata w glutaminę, która obejmuje większość białka i jest wysoce konserwatywna wśród ortologów. Ostatnią domeną jest domena o nieznanej funkcji (DUF3504) znaleziony blisko końca sekwencji białka. Wszystkie trzy z tych domen są dobrze konserwowane w ścisłych ortologach.
Przewidywane funkcje
Właściwości QRICH1, które zostały przewidziane za pomocą narzędzi bioinformatycznych :
- Masa cząsteczkowa: 86,5 kDa
- Punkt izoelektryczny: 5,59
- Modyfikacja potranslacyjna : Zgłoszono lub przewiduje się wiele miejsc fosforylacji. PhosphoSitePlus zawiera trzy fosforylowane seryny z adnotacjami w resztach 343, 345 i 659. Program NetPhos na ExPASy przewidział 45 miejsc fosforylacji na wielu resztach seryny, treoniny i tyrozyny. Istnieje jedna przewidywana sulfinowana tyrozyna w aminokwasie 725.
- Brak przewidywanego cięcia peptydu sygnałowego lub peptydu sygnałowego.
- Białka oddziałujące: ATXN1 , białko ataksji rdzeniowo-móżdżkowej typu 1 i ATF7IP , aktywujące białko oddziałujące z czynnikiem transkrypcyjnym 7 1. ATXN1 bierze udział w wiązaniu RNA in vitro i może brać udział w metabolizmie RNA. ATF7IP jest białkiem rekrutującym, które łączy czynniki transkrypcyjne z ogólnym aparatem transkrypcyjnym, modulując w ten sposób regulację transkrypcji i tworzenie chromatyny.
Wyrażenie
QRICH1 ulega ekspresji na wysokim poziomie, 3,3 razy większym od przeciętnego genu. Wyraża się go wszechobecnie w całym ludzkim ciele, chociaż dane EST Profile ujawniają, że QRICH1 jest szczególnie silnie wyrażany w tkankach, takich jak grasica , jądra , kora móżdżku i inne obszary mózgu, tchawica i tkanka embrionalna. Stany zdrowotne, takie jak guzy zarodkowe , białaczka , chłoniak i chrzęstniakomięsak , również zgłaszały wysoką ekspresję QRICH1.
Homologia
ortologi
QRICH1 jest wysoce konserwatywny wśród ortologów ssaków, wraz z innymi strunowcami , takimi jak ryby, ptaki i płazy. Gen ma pewną konserwację wśród owadów, ale nie znaleziono ortologów u roślin, grzybów ani drożdży.
| Rodzaj/gatunek | Nazwa zwyczajowa organizmu | Numer dostępowy | Tożsamość sekwencji | Podobieństwo sekwencji | Długość (AA) | |
| Panowie troglodyci | Szympans | XP_001161499.1 | 99% | 99% | 766 | |
| Macaca Mulat | Makak rezus | XP_001110386.2 | 99% | 99% | 659 | |
| Pongo abelii | Orangutan | XP_002813809.1 | 99% | 99% | 777 | |
| Mus musculus | Mysz domowa | NP_780352.2 | 99% | 99% | 777 | |
| Rattus norvegicus | Norweski szczur | NP_001128004.1 | 99% | 99% | 687 | |
| Znajomy pies | Pies | XP_850904.1 | 99% | 99% | 780 | |
| Bos byk | Krowa | NP_001091484.1 | 99% | 99% | 779 | |
| Sus scrofa | Dzik | XP_003132250.1 | 99% | 99% | 781 | |
| Oryctolagus cuniculus | Królik europejski | XP_002713458.1 | 99% | 99% | 777 | |
| Ailuropoda melanoleuca | Panda wielka | XP_002920598.1 | 99% | 99% | 780 | |
| Callithrix jacchus | Pazurczatka | XP_002758378.1 | 99% | 99% | 777 | |
| Equus caballus | Koń | XP_001498380.2 | 98% | 98% | 780 | |
| Monodelphis domestica | Opos | XP_001367745.1 | 95% | 97% | 776 | |
| Gallus gallus | Kurczak | XP_001233527.1 | 94% | 96% | 773 | |
| Ornithorhynchus anatinus | Dziobak | XP_001505372.1 | 94% | 95% | 741 | |
| Taeniopygia guttata | Zięba zebry | XP_002187824.1 | 93% | 97% | 772 | |
| Xenopus laevis | Afrykańska żaba szponiasta | NP_001083416.1 | 79% | 85% | 755 | |
| Tetraodon nigroviridis | Rozdymka tygrysia | CAG11318.1 | 71% | 80% | 729 | |
| Danio Rerio | Zebry | NP_001020633.1 | 63% | 73% | 717 | |
| Apis mellifera | pszczoła | XP_624959.2 | 47% | 64% | 1356 | |
| Camponotus floridanus | Mrówka cieśla | EFN71787.1 | 45% | 63% | 1724 | |
Paralogi
QRICH1 ma pięć paralogów , z których wszystkie kodują białko palca cynkowego .
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .