Reduktaza aldo-keto
Rodzina reduktazy aldo/keto | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||||||
Symbol | Aldo_ket_red | ||||||||||
Pfam | PF00248 | ||||||||||
InterPro | IPR001395 | ||||||||||
PROZYTA | PDOC00061 | ||||||||||
SCOP2 | 1ads / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||||
CDD | cd06660 | ||||||||||
|
Rodzina reduktaz aldo-keto to rodzina białek, które są podzielone na 16 kategorii; obejmują one szereg pokrewnych monomerycznych oksydoreduktaz zależnych od NADPH , takich jak reduktaza aldehydowa , reduktaza aldozowa , syntaza prostaglandyny F , reduktaza ksylozowa , krystalina rho i wiele innych.
Struktura
Wszystkie mają podobną strukturę, z fałdowaniem beta-alfa-beta charakterystycznym dla białek wiążących nukleotydy . Fałd zawiera równoległą beczkę beta-8/alfa-8, która zawiera nowy motyw wiążący NADP. Miejsce wiązania znajduje się w dużej, głębokiej, eliptycznej kieszeni na C- końcu arkusza beta , przy czym substrat jest związany w rozszerzonej konformacji. Hydrofobowy charakter kieszeni faworyzuje substraty aromatyczne i apolarne w porównaniu z substratami wysoce polarnymi.
Wiązanie koenzymu NADPH powoduje ogromną zmianę konformacyjną, reorientację pętli, skutecznie blokując koenzym na miejscu. To wiązanie jest bardziej podobne do oksydoreduktaz wiążących FAD niż NAD (P).
Przykłady
Niektóre białka z tej rodziny zawierają domenę regulatorową łańcucha beta kanału potasowego ; zgłasza się, że mają one aktywność oksydoreduktazy.