Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
SKP1
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie ortologiczne:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, EMC19, OCP-II, OCP2, SKP1A, TCEB1L, p19A, białko związane z kinazą fazy S 1, białko związane z kinazą fazy S 1
Zewnętrzne identyfikatory
Wikidane
Białko 1 związane z kinazą fazy S jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen SKP1 .
Gen ten koduje białko będące członkiem kompleksu białkowego ligazy ubikwitynowej SCF . Wiąże się z białkami F-box (białkami zawierającymi motyw F-box), takimi jak cyklina F, białko związane z kinazą fazy S 2 i inne białka regulatorowe zaangażowane w ubikwitynę zależna proteoliza. Kodowane białko współpracuje również z siecią białek w celu kontrolowania poziomu beta-kateniny i wpływa na poziom aktywności zależnych od beta-kateniny czynników transkrypcyjnych TCF. Badania scharakteryzowały również białko jako czynnik wydłużania polimerazy RNA II. alternatywnego splicingu tego genu powstają dwa warianty transkryptu. Na chromosomie 7 zidentyfikowano powiązany pseudogen .
Interakcje
Wykazano, że SKP1A wchodzi w interakcję z:
BTRC ,
CACYBP ,
CDCA3 ,
CDK9 ,
CUL1 ,
FBXL3 ,
FBXO4 ,
FBXO5 ,
FBXO7 ,
FBXW2 ,
FBXW7 i
SKP2 .
Dalsza lektura
Chen H, Thalmann I, Adams JC, Avraham KB, Copeland NG, Jenkins NA, Beier DR, Corey DP, Thalmann R, Duyk GM (1995). „Klonowanie cDNA, dystrybucja tkanek i lokalizacja chromosomów Ocp2, genu kodującego domniemany czynnik związany z transkrypcją, wyrażany głównie w narządach słuchowych”. Genomika . 27 (3): 389–98. doi : 10.1006/geno.1995.1068 . PMID 7558018 .
Sowden J, Morrison K, Schofield J, Putt W, Edwards Y (1996). „Nowe cDNA z homologią do czynnika wydłużania polimerazy RNA II odwzorowuje ludzki chromosom 5q31 (TCEB1L) i mysi chromosom 11 (Tceb1l)”. Genomika . 29 (1): 145–51. doi : 10.1006/geno.1995.1225 . PMID 8530064 .
Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (1996). „SKP1 łączy regulatory cyklu komórkowego z maszynerią proteolizy ubikwityny poprzez nowatorski motyw, F-box” . Komórka . 86 (2): 263–74. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80098-7 . PMID 8706131 . S2CID 18387009 .
Brown KA, Leek JP, Lench NJ, Moynihan LM, Markham AF, Mueller RF (1996). „Ludzkie sekwencje homologiczne do genu białka ślimakowego Ocp-II nie odpowiadają obecnie znanym loci niesyndromowego ubytku słuchu”. Anna. Szum. Geneta . 60 (cz. 5): 385–9. doi : 10.1111/j.1469-1809.1996.tb00436.x . PMID 8912791 . S2CID 7687393 .
Liang Y, Chen H, Asher JH, Chang CC, Friedman TB (1997). „CDNA ludzkiego ucha wewnętrznego OCP2 mapuje się na 5q22-5q35.2 z powiązanymi sekwencjami na chromosomach 4p16.2-4p14, 5p13-5q22, 7pter-q22, 10 i 12p13-12qter” . Gene . 184 (2): 163–7. doi : 10.1016/S0378-1119(96)00590-2 . PMID 9031623 .
Lisztwan J, Marti A, Sutterlüty H, Gstaiger M, Wirbelauer C, Krek W (1998). „Stowarzyszenie ludzkiego CUL-1 i enzymu koniugującego ubikwitynę CDC34 z białkiem F-box p45 (SKP2): dowód ewolucyjnej konserwacji składu podjednostek szlaku CDC34-SCF” . EMBO J. 17 (2): 368–83. doi : 10.1093/emboj/17.2.368 . PMC 1170388 . PMID 9430629 .
Ng RW, Arooz T, Yam CH, Chan IW, Lau AW, Poon RY (1998). „Charakterystyka kulliny i partnera białkowego F-box Skp1” . FEBS Lett . 438 (3): 183–9. doi : 10.1016/S0014-5793(98)01299-X . PMID 9827542 . S2CID 40950881 .
Yam CH, Ng RW, Siu WY, Lau AW, Poon RY (1999). „Regulacja cykliny A-Cdk2 przez składnik SCF Skp1 i białko F-box Skp2” . Mol. Komórka. Biol . 19 (1): 635–45. doi : 10.1128/mcb.19.1.635 . PMC 83921 . PMID 9858587 .
Henzl MT, Thalmann I, Thalmann R (1999). „OCP2 istnieje w postaci dimeru w narządzie Cortiego”. Słyszeć. Rez . 126 (1–2): 37–46. doi : 10.1016/S0378-5955(98)00148-8 . PMID 9872132 . S2CID 20953392 .
Winston JT, Strack P, Beer-Romero P, Chu CY, Elledge SJ, Harper JW (1999). „Kompleks ligazy SCFbeta-TRCP-ubikwityny wiąże się specyficznie z fosforylowanymi motywami destrukcji w IkappaBalpha i beta-kateninie oraz stymuluje ubikwitynację IkappaBalpha in vitro” . Genes Dev . 13 (3): 270–83. doi : 10.1101/gad.13.3.270 . PMC 316433 . PMID 9990852 .
Ilyin GP, Rialland M, Glaise D, Guguen-Guillouzo C (1999). „Identyfikacja nowego białka ssaczego podobnego do Skp2, zawierającego powtórzenia F-box i leucynę”. FEBS Lett . 459 (1): 75–9. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01211-9 . PMID 10508920 . S2CID 22945082 .
Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999). „Identyfikacja rodziny ludzkich białek F-box” . Aktualny Biol . 9 (20): 1177–9. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID 10531035 . S2CID 7467493 .
Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (1999). „Rodzina ssaczych białek F-box” . Aktualny Biol . 9 (20): 1180–2. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80021-4 . PMID 10531037 . S2CID 14341845 .
Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (2000). „Homodimer dwóch białek F-box betaTrCP1 lub betaTrCP2 wiąże się z IkappaBalpha w celu uzyskania ubikwitynacji zależnej od sygnału” . J. Biol. Chem . 275 (4): 2877–84. doi : 10.1074/jbc.275.4.2877 . PMID 10644755 .
Przeczytaj MA, Brownell JE, Gladysheva TB, Hottelet M, Parent LA, Coggins MB, Pierce JW, Podust VN, Luo RS, Chau V, Palombella VJ (2000). „Modyfikacja Nedd8 cul-1 aktywuje zależną od SCF (beta (TrCP)) ubikwitynację IkappaBalpha” . Mol. Komórka. Biol . 20 (7): 2326–33. doi : 10.1128/MCB.20.7.2326-2333.2000 . PMC 85397 . PMID 10713156 .
Schulman BA, Carrano AC, Jeffrey PD, Bowen Z, Kinnucan ER, Finnin MS, Elledge SJ, Harper JW, Pagano M, Pavletich NP (2000). „Wgląd w ligazy ubikwitynowe SCF ze struktury kompleksu Skp1-Skp2”. Natura . 408 (6810): 381–6. Bibcode : 2000Natur.408..381S . doi : 10.1038/35042620 . PMID 11099048 . S2CID 4300503 .
Lyapina S, Cope G, Szewczenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, Wolf DA, Wei N, Szewczenko A, Deshaies RJ (2001). „Promowanie rozszczepienia koniugatu NEDD-CUL1 przez sygnałosom COP9”. Nauka . 292 (5520): 1382–5. Kod Biblijny : 2001Sci...292.1382L . doi : 10.1126/science.1059780 . PMID 11337588 . S2CID 14224920 .
Fukuchi M, Imamura T, Chiba T, Ebisawa T, Kawabata M, Tanaka K, Miyazono K (2001). „Zależna od liganda degradacja Smad3 przez kompleks ligazy ubikwitynowej ROC1 i powiązanych białek” . Mol. Biol. Komórka . 12 (5): 1431–43. doi : 10.1091/mbc.12.5.1431 . PMC 34595 . PMID 11359933 .
Linki zewnętrzne
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : P63208 (białko 1 związane z kinazą fazy S) w PDBe-KB .
Galeria PB
1fs1 : Wgląd w ligazy ubikwitynowe SCF na podstawie struktury kompleksu SKP1-SKP2
1fs2 : Wgląd w ligazy ubikwitynowe SCF na podstawie struktury kompleksu SKP1-SKP2
1ldk : Struktura kompleksu ligazy ubikwitynowej Cul1-Rbx1-Skp1-FSkp2 SCF
2ass : Struktura krystaliczna kompleksu Skp1-Skp2-Cks1
2ast : Struktura krystaliczna Skp1-Skp2-Cks1 w kompleksie z peptydem p27
2e31 : Strukturalne podstawy selekcji glikozylowanego substratu przez ligazę ubikwitynową SCFFbs1
2e32 : Strukturalne podstawy selekcji glikozylowanego substratu przez ligazę ubikwitynową SCFFbs1