SNRPB

SNRPB
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, COD, SNRPB1, Sm-B/B', SmB/B', SmB/SmB', snRNP-B, CCMS, polipeptydy małych jądrowych rybonukleoprotein B i B1 Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białka B i B' związane z małymi jądrowymi rybonukleoproteinami są białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SNRPB .

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen jest jednym z kilku białek jądrowych, które są wspólne dla małych cząsteczek rybonukleoprotein (snRNP) U1, U2, U4/U6 i U5. Te snRNP są zaangażowane w splicing pre-mRNA, a kodowane białko może również odgrywać rolę w splicingu pre-mRNA lub strukturze snRNP. Autoprzeciwciała od pacjentów z toczniem rumieniowatym układowym często rozpoznają epitopy na kodowanym białku. Dla tego genu znaleziono dwa warianty transkryptu kodujące różne izoformy (B i B').

Interakcje

Wykazano, że SNRPB oddziałuje z DDX20 i Coilin .

Dalsza lektura

•   Will CL, Lührmann R (2001). „Biogeneza, struktura i funkcja spliceosomalnego UsnRNP”. bież. Opinia. Biol komórkowy . 13 (3): 290–301. doi : 10.1016/S0955-0674(00)00211-8 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F770-0 . PMID 11343899 .
•   Schmauss C, Lerner MR (1990). „Blisko spokrewnione małe jądrowe polipeptydy rybonukleoproteinowe N i B/B” można odróżnić na podstawie przeciwciał, jak również różnic w ich mRNA i strukturach genów” . J. Biol. chemia . 265 (18): 10733-9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)87008-9 . PMID 1693924 .
•   Elkon KB, Hines JJ, Chu JL, Parnassa A (1990). „Mapowanie epitopów rekombinowanych peptydów HeLa SmB i B 'otrzymanych w reakcji łańcuchowej polimerazy”. J. Immunol . 145 (2): 636–43. PMID 1694885 .
•   Chu JL, Elkon KB (1991). „Małe jądrowe rybonukleoproteiny, SmB i B”, są produktami pojedynczego genu”. gen . 97 (2): 311–2. doi : 10.1016/0378-1119(91)90069-N . PMID 1825643 .
•    Sharpe NG, Williams DG, Latchman DS (1990). „Regulowana ekspresja białka małych cząsteczek rybonukleoproteiny jądrowej SmN w różnicowaniu embrionalnych komórek macierzystych” . Mol. Komórka. Biol . 10 (12): 6817–20. doi : 10.1128/mcb.10.12.6817 . PMC 362965 . PMID 2174118 .
•    Schmauss C, McAllister G, Ohosone Y, Hardin JA, Lerner MR (1989). „Porównanie autoantygenów Sm związanych z snRNP: ludzkiego N, szczurzego N i ludzkiego B / B ” . Kwasy nukleinowe Res . 17 (4): 1733–43. doi : 10.1093/nar/17.4.1733 . PMC 331831 . PMID 2522186 .
•   Feeney RJ, Sauterer RA, Feeney JL, Zieve GW (1989). „Montaż cytoplazmatyczny i akumulacja jądrowa dojrzałych małych jądrowych cząstek rybonukleoprotein” . J. Biol. chemia . 264 (10): 5776–83. doi : 10.1016/S0021-9258(18)83617-1 . PMID 2522439 .
•    Ohosone Y, Mimori T, Griffith A, Akizuki M, Homma M, Craft J, Hardin JA (1989). „Klonowanie molekularne cDNA kodującego autoantygen Sm: wyprowadzenie cDNA dla polipeptydu B serii U małych jądrowych cząstek rybonukleoproteiny” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 86 (11): 4249–53. Bibcode : 1989PNAS...86.4249O . doi : 10.1073/pnas.86.11.4249 . PMC 287428 . PMID 2524838 .
•    van Dam A, Winkel I, Zijlstra-Baalbergen J, Smeenk R, Cuypers HT (1989). „Sklonowane ludzkie białka snRNP B i B”różnią się tylko częścią na końcu karboksylowym” . EMBO J. 8 (12): 3853–60. doi : 10.1002/j.1460-2075.1989.tb08563.x . PMC 402073 . PMID 2531083 .
•    Huntriss JD, Latchman DS, Williams DG (1993). „Autoprzeciwciała tocznia rozróżniają wysoce homologiczne polipeptydy Sm B/B' i SmN przez wiązanie epitopu ograniczonego do B/B' ” . Clin. Do potęgi. immunol . 92 (2): 263–7. doi : 10.1111/j.1365-2249.1993.tb03390.x . PMC 1554819 . PMID 7683587 .
•   Gerrelli D, Grimaldi K, Horn D, Mahadeva U, Sharpe N, Latchman DS (1993). „Sercowa postać tkankowo specyficznego białka SmN jest identyczna z mózgową i embrionalną formą białka”. J. Mol. Komórka. kardiol . 25 (3): 321–9. doi : 10.1006/jmcc.1993.1038 . PMID 8510173 .
•   Simons A, Melamed-Bessudo C, Wolkowicz R, Sperling J, Sperling R, Eisenbach L, Rotter V (1997). „PAKT: klonowanie i charakteryzacja komórkowego białka wiążącego p53, które oddziałuje z Rb” . Onkogen . 14 (2): 145–55. doi : 10.1038/sj.onc.1200825 . PMID 9010216 .
•    Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (1997). „Produkt genu choroby rdzeniowego zaniku mięśni, SMN i związane z nim białko SIP1 są w kompleksie z białkami spliceosomalnymi snRNP” . komórka . 90 (6): 1013–21. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . PMID 9323129 . S2CID 10855404 .
•   Fury MG, Zhang W, Christodoulopoulos I, Zieve GW (1997). „Wiele białek: interakcje białek między wspólnymi białkami rdzeniowymi snRNP”. Do potęgi. Rozdz . komórki 237 (1): 63-9. doi : 10.1006/excr.1997.3750 . PMID 9417867 .
•    Bedford MT, Reed R, Leder P (1998). „Interakcje, w których pośredniczy domena WW, ujawniają białko związane ze spliceosomem, które wiąże trzecią klasę motywu bogatego w prolinę: motyw bogaty w prolinę, glicynę i metioninę” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 95 (18): 10602–7. Bibcode : 1998PNAS...9510602B . doi : 10.1073/pnas.95.18.10602 . PMC27941 . _ PMID 9724750 .
•    Kambach C, Walke S, Young R, Avis JM, de la Fortelle E, Raker VA, Lührmann R, Li J, Nagai K (1999). „Struktury krystaliczne dwóch kompleksów białek Sm i ich implikacje dla montażu spliceosomalnych snRNP” . komórka . 96 (3): 375–87. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80550-4 . PMID 10025403 . S2CID 17379935 .
•    Szary TA, Smithwick MJ, Schaldach MA, Martone DL, Graves JA, McCarrey JR, Nicholls RD (1999). „Uzgodniona regulacja i ewolucja molekularna zduplikowanych loci SNRPB'/B i SNRPN” . Kwasy nukleinowe Res . 27 (23): 4577–84. doi : 10.1093/nar/27.23.4577 . PMC 148745 . PMID 10556313 .
•    Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Szewczenko A, Mann M, Dreyfuss G (1999). „Gemin3: nowe białko DEAD box, które oddziałuje z SMN, produktem genu rdzeniowego zaniku mięśni i jest składnikiem klejnotów” . J. Cell Biol . 147 (6): 1181–94. doi : 10.1083/jcb.147.6.1181 . PMC 2168095 . PMID 10601333 .
•    Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Yong J, Szewczenko A, Mann M, Dreyfuss G (2000). „Gemin4. Nowy składnik kompleksu SMN, który znajduje się zarówno w klejnotach, jak i jąderkach” . J. Cell Biol . 148 (6): 1177–86. doi : 10.1083/jcb.148.6.1177 . PMC 2174312 . PMID 10725331 .