HNRNPL

HNRNPL
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, HNRPL, hnRNP-L, P/OKcl.14, heterogenna jądrowa rybonukleoproteina L
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Heterogenna jądrowa rybonukleoproteina L jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen HNRNPL .

Funkcjonować

Heterogeniczne jądrowe RNA (hnRNA), które obejmują prekursory mRNA i dojrzałe mRNA, są związane ze specyficznymi białkami, tworząc heterogeniczne kompleksy rybonukleoproteinowe (hnRNP). Heterogenna jądrowa rybonukleoproteina L należy do białek, które są stabilnie związane z kompleksami hnRNP i wraz z innymi białkami hnRNP prawdopodobnie odgrywają główną rolę w tworzeniu, pakowaniu, przetwarzaniu i funkcji mRNA. Heterogenna jądrowa rybonukleoproteina L jest obecna w nukleoplazmie jako część kompleksu HNRP. Białka HNRP zidentyfikowano również poza nukleoplazmą. Wymiana hnRNP na białka wiążące mRNA towarzyszy transportowi mRNA z jądra do cytoplazmy. Ponieważ wykazano, że białka HNRP przemieszczają się między jądra i cytoplazmy , możliwe, że pełnią one również funkcje cytoplazmatyczne. Dla tego genu znaleziono dwa warianty transkryptu kodujące różne izoformy.

Interakcje

Wykazano, że HNRNPL wchodzi w interakcje z:

• HNRNPLL ,
• HNRPK ,
• PCBP2 i
• PTBP1 .

Dalsza lektura

•   Dreyfuss G, Choi YD, Adam SA (1990). „Struktury rybonukleoprotein wzdłuż szlaku tworzenia mRNA”. endokr. Rez . 15 (4): 441–74. doi : 10.3109/07435808909036348 . PMID 2576798 .
•    Rasmussen HH, van Damme J, Puype M i in. (1993). „Mikrosekwencje 145 białek zarejestrowanych w dwuwymiarowej bazie danych białek żelowych normalnych ludzkich keratynocytów naskórka”. Elektroforeza . 13 (12): 960–9. doi : 10.1002/elps.11501301199 . PMID 1286667 . S2CID 41855774 .
•    Hahm B, Cho OH, Kim JE i in. (1998). „Białko wiążące przewód polipirymidynowy oddziałuje z HnRNP L” . FEBS Lett . 425 (3): 401–6. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00269-5 . PMID 9563502 . S2CID 4980318 .
•   Shih SC, Claffey KP (1999). „Regulacja stabilności mRNA ludzkiego czynnika wzrostu śródbłonka naczyń w niedotlenieniu przez heterogenną jądrową rybonukleoproteinę L” . J. Biol. chemia . 274 (3): 1359–65. doi : 10.1074/jbc.274.3.1359 . PMID 9880507 .
•   Hamilton BJ, Nichols RC, Tsukamoto H i in. (1999). „hnRNP A2 i hnRNP L wiążą 3'UTR mRNA transportera glukozy 1 i istnieją jako kompleks in vivo” . Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 261 (3): 646–51. doi : 10.1006/bbrc.1999.1040 . PMID 10441480 .
•    Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). „Sekwencjonowanie typu shotgun ludzkiego transkryptomu za pomocą znaczników sekwencji wyrażanych w ORF” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 97 (7): 3491-6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
•   Kim JH, Hahm B, Kim YK i in. (2000). „Interakcja białko-białko między hnRNP przemieszczającymi się między jądrem a cytoplazmą”. J. Mol. Biol . 298 (3): 395–405. doi : 10.1006/jmbi.2000.3687 . PMID 10772858 .
•   Shnyreva M, Schullery DS, Suzuki H i in. (2000). „Interakcja dwóch wielofunkcyjnych białek. Heterogenna jądrowa rybonukleoproteina K i białko wiążące Y-box” . J. Biol. chemia . 275 (20): 15498–503. doi : 10.1074/jbc.275.20.15498 . PMID 10809782 .
•   Ito M, Shichijo S, Tsuda N i in. (2001). „Molekularne podstawy rozpoznawania komórek raka trzustki za pośrednictwem komórek T”. Rak Res . 61 (5): 2038–46. PMID 11280764 .
•    Kuninger DT, Izumi T, Papaconstantinou J, Mitra S (2002). „Ludzka AP-endonukleaza 1 i hnRNP-L oddziałują z elementem represorowym podobnym do nCare w promotorze AP-endonukleazy 1” . Kwasy nukleinowe Res . 30 (3): 823–9. doi : 10.1093/nar/30.3.823 . PMC 100287 . PMID 11809897 .
•    Söderberg M, Raffalli-Mathieu F, Lang MA (2002). „Zapalenie moduluje interakcję heterogennej jądrowej rybonukleoproteiny (hnRNP) I / białka wiążącego przewód polipirymidynowy i hnRNP L z nieulegającym translacji regionem mysiego mRNA indukowanej syntazy tlenku azotu”. Mol. Farmakol . 62 (2): 423–31. doi : 10.1124/mol.62.2.423 . PMID 12130696 . S2CID 14855837 .
•    Hui J, Stangl K, Lane WS, Bindereif A (2007). „HnRNP L stymuluje splicing genu eNOS przez wiązanie się z powtórzeniami CA o zmiennej długości”. Nat. Struktura. Biol . 10 (1): 33–7. doi : 10.1038/nsb875 . PMID 12447348 . S2CID 19057994 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Costain WJ, Mishra RK (2003). „PLG reguluje ekspresję hnRNP-L w prążkowiu szczura i korze przedczołowej: identyfikacja metodą ddPCR”. Peptydy . 24 (1): 137–46. doi : 10.1016/S0196-9781(02)00286-3 . PMID 12576095 . S2CID 44677561 .
•    Hui J, Reither G, Bindereif A (2003). „Nowa funkcjonalna rola powtórzeń CA i hnRNP L w stabilności RNA” . RNA . 9 (8): 931–6. doi : 10.1261/rna.5660803 . PMC 1370459 . PMID 12869704 .
•   Gulesserian T, Engidawork E, Fountoulakis M, Lubec G (2004). „Zmniejszony poziom białka Lupus La w mózgu i zwiększone białko 40 kDa specyficzne dla małych rybonukleoprotein U5 w płodowym zespole Downa”. Komórka. Mol. Biol. (Noisy-le-grand) . 49 (5): 733–8. PMID 14528909 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T i in. (2004). „Kompletne sekwencjonowanie i charakterystyka 21 243 pełnej długości ludzkich cDNA” . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Cheng J, Kapranov P, Drenkow J i in. (2005). „Mapy transkrypcyjne 10 ludzkich chromosomów w rozdzielczości 5 nukleotydów”. nauka . 308 (5725): 1149–54. Bibcode : 2005Sci...308.1149C . doi : 10.1126/science.1108625 . PMID 15790807 . S2CID 13047538 .