Wulkanizacja

Klasyfikacja naukowa
Vulcanisaeta
Domena:	Archeony
Gromada:	termoprotea
Klasa:	termoprotei
Zamówienie:	termoproteale
Rodzina:	termoproteowate
Rodzaj:	Wulkanizacja Itoh, Suzuki i Nakase 2002
Wpisz gatunek
Vulcanisaeta distributa Itoh, Suzuki i Nakase 2002
Gatunek
V. dystrybucja " V. montnowska " V. souniana V. termofilna

W taksonomii Vulcanisaeta jest rodzajem Thermoproteaceae . _ _

Opis i znaczenie

Vulcanisaeta to beztlenowy, heterotroficzny, hipertermofilny archeon, który optymalnie rośnie w temperaturze 85–90 ° C i przy pH 4,0–4,5. Organizm jest izolowany z próbek pobranych bezpośrednio z pól solfatarycznych lub wody z gorących źródeł we wschodniej Japonii.

Struktura genomu

Zsekwencjonowano kilka genomów Vulcanisaeta , patrz Lista zsekwencjonowanych genomów archeologicznych . Przewiduje się, że zawartość G + C w jego DNA, która wynosi od 44 do 46%, będzie stosunkowo niższa niż w przypadku innych przedstawicieli rodzaju Thermoproteaceae .

Budowa komórki i metabolizm

Komórki Vulcanisaeta to proste lub lekko zakrzywione pręciki o szerokości od 0,4 do 0,6 µm. W niektórych przypadkach komórki są rozgałęzione lub mają kuliste ciała na końcach. Archaeon wykorzystuje maltozę, skrobię, jabłczan, ekstrakt drożdżowy, pepton, ekstrakt wołowy, kazaminokwasy i żelatynę jako źródła węgla, nie może wykorzystywać D- arabinozy , D- fruktozy , laktozy , sacharozy , D- ksylozy , octanu , maślanu , mrówczanu , fumaranu , propionian pirogronian , bursztynian , metanol , formamid , metyloamina lub trimetyloamina . _ Jako akceptory elektronów organizm wykorzystuje siarkę i tiosiarczan. W przeciwieństwie do niektórych innych genetycznie podobnych archeonów, takich jak Thermocladium lub Caldivirga , Vulcanisaeta rośnie pod nieobecność mieszaniny witamin lub roztworu ekstraktu z komórek archeonów w pożywce.

Ekologia

Szczepy Vulcanisaeta znaleziono w gorących źródłach w Japonii. Pomimo tego, że organizmy te są najpowszechniejszym crenarchaeote w kształcie pręcika wśród izolatów z gorących źródeł w Japonii, nie wyizolowały się z innych krajów. Kontrastuje to z rodzajami Thermoproteus i Pyrobaculum , które są dystrybuowane na całym świecie, w tym na Azorach , Islandii , Indonezji , Włoszech, Japonii, Filipinach , Rosji i Stanach Zjednoczonych. Dlatego możliwe jest, że rodzaj Vulcanisaeta ma ograniczoną dystrybucję, która obejmuje Japonię.

Filogeneza

LTP_12_2021 oparte na 16S rRNA autorstwa The All-Species Living Tree Project .	GTDB 07-RS207 przez bazę danych taksonomii genomu .
Wulkanizacja V. thermophila V. souniana V. distributa	Wulkanizacja V. thermophila Yim i in. 2015 V. distributa Itoh, Suzuki & Nakase 2002 " V. moutnovskia " Gumerov et al. 2011 V. souniana Itoh, Suzuki & Nakase 2002

Dalsza lektura

Czasopisma naukowe

•   Jay ZJ; JP. Belka; MAMA. Kozubal; Rdem Jennings; DB. Rusch & Inskeep WP (grudzień 2016). „Rozmieszczenie, różnorodność i funkcja dominujących Thermoproteales w środowiskach o wysokiej temperaturze w Parku Narodowym Yellowstone” . Mikrobiologia Środowiskowa . 18 (12): 4755–4769. doi : 10.1111/1462-2920.13366 . PMID 27130276 .
•    Jay ZJ, Inskeep WP (lipiec 2015). „Rozmieszczenie, różnorodność i znaczenie intronów genów 16S rRNA w kolejności Thermoproteales” . Biologia bezpośrednia . 10 (35): 35. doi : 10.1186/s13062-015-0065-6 . PMC 4496867 . PMID 26156036 .
•    Mavromatis, Konstantinos (2010). „Pełna sekwencja genomu szczepu typu Vulcanisaeta distributa (IC-017 (T))” . Standardy w naukach genomicznych . 3 (2): 117–125. doi : 10.4056/sigs.1113067 . PMC 3035369 . PMID 21304741 .
•   Ito T; Suzuki K; Nakase T (2002). „Vulcanisaeta distributa gen. nov., sp. nov. i Vulcanisaeta souniana sp. nov., hipertermofilne crenarchaeote w kształcie pręta wyizolowane z gorących źródeł w Japonii”. Int. J. Syst. ewolucja Mikrobiol . 52 (cz. 4): 1097–1104. doi : 10.1099/ijs.0.02152-0 . PMID 12148613 .
•   Burggraf S; Hubera H.; Stetter KO (1997). „Reklasyfikacja rzędów i rodzin crenarchael zgodnie z danymi sekwencji 16S rRNA” . Int. J. Syst. Bakteriol . 47 (3): 657–660. doi : 10.1099/00207713-47-3-657 . PMID 9226896 .
• Zillig W; Stetter KO; Schafer W; Janekowicz D; Wunderl S; Holz I; Palma P. (1981). „Thermoproteales: nowy typ wyjątkowo termoacidofilnych beztlenowych archaebakterii wyizolowanych z islandzkich solfataras”. Zentralbl. Mikrobiol. Pasożytnik Infekcjekr. Hyg. Abt. 1 Oryg . C2 : 205–227.