ARHGEF6

ARHGEF6
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, COOL2, Cool-2, MRX46, PIXA, alpha-PIX, alphaPIX, czynnik wymiany guaninowej nukleotydów Rac/Cdc42 6
identyfikatorów zewnętrznych
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Czynnik wymiany nukleotydów guaniny 6 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen ARHGEF6 .

ARHGEF6 jest powszechnie znany jako p21 - aktywowana kinaza białkowa e x czynnik zmiany alfa (alfa-PIX lub αPIX), ponieważ został zidentyfikowany przez wiązanie się z kinazą aktywowaną p21 (PAK) i zawiera również domenę czynnika wymiany nukleotydów guaniny .

Domeny i funkcje

αPIX jest białkiem wielodomenowym, które działa zarówno jako białko rusztowania sygnałowego , jak i enzym . αPIX dzieli tę strukturę domeny i funkcję sygnalizacyjną z bardzo podobnym ARHGEF7/βPIX . αPIX zawiera centralną domenę DH/PH RhoGEF , która działa jako czynnik wymiany nukleotydów guaninowych (GEF) dla małych GTPaz z rodziny Rho , a konkretnie Rac i Cdc42 . Podobnie jak inne GEF, αPIX może promować zarówno uwalnianie GDP z nieaktywnego małego białka wiążącego GTP, jak i wiązanie GTP w celu promowania jego aktywacji. Rusztowania sygnalizacyjne wiążą się z określonymi partnerami, aby promować wydajną transdukcję sygnału, układając kolejne elementy ścieżki blisko siebie, aby ułatwić interakcję / transfer informacji, a także utrzymując te partnerskie kompleksy białkowe w określonych miejscach w komórce, aby promować lokalną lub regionalną sygnalizację. W przypadku αPIX, jego domena SH3 wiąże się z białkami partnerskimi z odpowiednimi motywami poliprolinowymi, a zwłaszcza z kinazami aktywowanymi p21 (PAK) grupy I ( PAK1 , PAK2 i PAK3 ). PAK jest związany z domeną αPIX SH3 w stanie nieaktywnym, a aktywowane wiązanie Rac1 lub Cdc42 z tym PAK stymuluje jego kinazy białkowej , prowadząc do dalszej fosforylacji białka docelowego ; ponieważ αPIX może aktywować małe GTPazy „p21'' Rac1 lub Cdc42 poprzez swoją aktywność GEF, ten kompleks αPIX/PAK/Rac jest przykładem funkcji rusztowania. Strukturalnie, αPIX składa się jako trimer przez swoją domenę zwojową na końcu karboksylowym i dalej oddziałuje z dimerami GIT1 lub GIT2 przez pobliską domenę wiążącą GIT, tworząc oligomeryczne kompleksy GIT-PIX. Dzięki temu kompleksowi GIT-PIX funkcja rusztowania αPIX jest wzmacniana przez możliwość trzymania partnerów GIT w pobliżu partnerów αPIX. domenę homologii kalponiny (CH) na końcu aminowym , której funkcje pozostają stosunkowo słabo zdefiniowane, ale oddziałuje z białkami z rodziny parwin / afiksyn .

Ponieważ gen ARHGEF6 znajduje się na chromosomie X , więc mężczyźni mają tylko jedną kopię, mutacje w tym genie u ludzi mogą powodować nieswoistą niesprawność intelektualną związaną z chromosomem X , podobnie jak mutacje wpływające na jego partnera wiążącego PAK3, którego gen jest również zlokalizowany na chromosomie X. W modelach zwierzęcych utrata funkcji genu ARHGEF6 jest związana z defektami synaps neuronalnych , migracją immunologicznych komórek T i defektami dojrzewania oraz utratą słuchu .

Interakcje

Doniesiono, że αPIX wchodzi w interakcje z ponad 40 białkami.

Główne białka oddziałujące obejmują:

Sam lub wysoce spokrewniony ARHGEF7 / βPIX poprzez trimeryczną interakcję typu coiled-coil.
GIT1 lub GIT2 poprzez domenę wiążącą GIT.
Kinazy aktywowane przez p21 (PAK) 1, 2 i 3 poprzez domenę SH3.
c-Cbl przez domenę SH3.
Członkowie rodziny białek wiążących GTP z rodziny Rho, Rac1 i Cdc42 , aktywowani przez domenę DHPH RhoGEF .

Zobacz też

Linki zewnętrzne

Lokalizacja ludzkiego genomu ARHGEF6 i strona szczegółów genu ARHGEF6 w przeglądarce genomu UCSC .
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : Q15052 (czynnik wymiany nukleotydu guaniny ludzkiego Rho 6) w PDBe-KB .
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : Q8K4I3 (współczynnik wymiany nukleotydu guaninowego myszy Rho 6) w PDBe-KB .

Dalsza lektura

Yntema HG, Hamel BC, Smits AP i in. (1999). „Lokalizacja genu nieswoistego upośledzenia umysłowego sprzężonego z X (MRX46) do Xq25-q26” . J. Med. Genet . 35 (10): 801–5. doi : 10.1136/jmg.35.10.801 . PMC 1051453 . PMID 9783701 .
Yoshii S, Tanaka M, Otsuki Y i in. (1999). „Czynnik wymiany nukleotydów alfaPIX jest aktywowany przez interakcję z 3-kinazą fosfatydyloinozytolu” . Onkogen . 18 (41): 5680–90. doi : 10.1038/sj.onc.1202936 . PMID 10523848 .
Brązowy A, Wang X, Sawai E, Cheng-Mayer C (1999). „Aktywacja kinazy związanej z PAK przez ludzki wirus niedoboru odporności typu 1 Nef w pierwotnych ludzkich limfocytach krwi obwodowej i makrofagach prowadzi do fosforylacji kompleksu PIX-p95” . J. Wirol . 73 (12): 9899–907. doi : 10.1128/JVI.73.12.9899-9907.1999 . PMC 113039 . PMID 10559302 .
Premont RT, Claing A, Vitale N i in. (2000). „Rodzina GIT białek aktywujących GTPazę czynnika ADP-rybozylacji. Różnorodność funkcjonalna GIT2 poprzez alternatywne składanie” . J. Biol. chemia . 275 (29): 22373–80. doi : 10.1074/jbc.275.29.22373 . PMID 10896954 .
Dolny KM, Gecz J (2001). „Charakterystyka ARHGEF6, czynnika wymiany nukleotydów guaninowych dla GTPaz Rho i genu kandydata na upośledzenie umysłowe sprzężone z X: badania przesiewowe mutacji w zespole Börjesona-Forssmana-Lehmanna i MRX27”. Jestem. J. Med. Genet . 100 (1): 43–8. doi : 10.1002/ajmg.1189 . PMID 11337747 .
Yoshii S, Tanaka M, Otsuki Y i in. (2001). „Zaangażowanie czynnika wymiany oddziałującego z alfa-PAK w aktywację PAK1-c-Jun NH (2)-końcowej kinazy 1 i apoptozę indukowaną przez benzo [a] piren” . Mol. Komórka. Biol . 21 (20): 6796–807. doi : 10.1128/MCB.21.20.6796-6807.2001 . PMC 99857 . PMID 11564864 .
Vikis HG, Li W, Guan KL (2002). „Interakcja plexin-B1 / Rac hamuje aktywację PAK i wzmacnia wiązanie ligandu Sema4D” . Geny Dev . 16 (7): 836–45. doi : 10.1101/gad.966402 . PMC 186329 . PMID 11937491 .
Flanders JA, Feng Q, Bagrodia S i in. (2003). „Białka Cbl są partnerami wiążącymi dla rodziny Cool / Pix białek wiążących kinazę aktywowaną przez p21”. FEBS Lett . 550 (1–3): 119–23. doi : 10.1016/S0014-5793(03)00853-6 . PMID 12935897 . S2CID 46540220 .
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB i in. (2004). „Solidne profilowanie fosfoproteomiczne miejsc fosforylacji tyrozyny z ludzkich limfocytów T przy użyciu chromatografii powinowactwa z unieruchomionym metalem i tandemowej spektrometrii mas”. Analny. chemia . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
Beausoleil SA, Jędrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). „Charakterystyka na dużą skalę fosfoprotein jądrowych komórek HeLa” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Jin J, Smith FD, Stark C i in. (2004). „Analiza proteomiczna, funkcjonalna i domenowa białek wiążących in vivo 14-3-3 zaangażowanych w regulację cytoszkieletu i organizację komórkową” . bież. Biol . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 . S2CID 2371325 .