Domena homologii kalponiny
| Domena homologii kalponiny (CH) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura roztworu domeny homologii kalponiny
| |||||||||||
| identyfikatorów IQGAP1 | |||||||||||
| Symbol | CH | ||||||||||
| Pfam | PF00307 | ||||||||||
| InterPro | IPR001715 | ||||||||||
| MĄDRY | CH | ||||||||||
| PROZYTA | PDOC00019 | ||||||||||
| SCOP2 | 1aoa / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd00014 | ||||||||||
| |||||||||||
Domena homologii kalponiny (lub domena CH) to rodzina domen wiążących aktynę występujących zarówno w białkach cytoszkieletu, jak i białkach transdukcji sygnału. Domena ma długość około 100 aminokwasów i składa się z czterech helis alfa. Obejmuje następujące grupy domen wiążących aktynę:
Obszerny przegląd białek zawierających ten typ domen wiążących aktynę podano w.
Domena CH jest zaangażowana w wiązanie aktyny u niektórych członków rodziny. Jednak w kalponinach istnieją dowody na to, że domena CH nie jest zaangażowana w jej aktywność wiązania aktyny. Większość białek ma dwie kopie domeny CH, jednak niektóre białka, takie jak kalponina i ludzki protoonkogen vav () mają tylko jedną kopię. Strukturę przykładowej domeny CH określono za pomocą krystalografii rentgenowskiej .
Przykłady
Ludzkie geny kodujące białka zawierające domenę homologii kalponiny obejmują:
- ACTN1 , ACTN2 , ACTN3 , ACTN4 , ARHGEF6 , ARHGEF7 , ASPM ,
- CLMN, CNN1 , CNN2 , CNN3 ,
- DIXDC1 , DMD , DST ,
- EHBP1, EHBP1L1,
- FLNA , FLNB , FLNC,
- GAZ2 , GAZ2L1 , GAZ2L2, GAZ2L3,
- IQGAP1 , IQGAP2 , IQGAP3,
- LCP1 , LIMCH1 , LMO7 , LRCH1, LRCH2, LRCH3, LRCH4 ,
- MACF1 , MAPRE1 , MAPRE2 , MAPRE3 , MICAL1 , MICALL2 , MICAL2PV1, MICAL2PV2, MICALL3 , MICALL1 , MICALL2,
- NAV2 , NAV3,
- PARVA , PARVB , PARVG , PLEC1 , PLS1 , PLS3 , PP14183,
- SMTN , SMTNL2, SPECC1 , SPECC1L, SPNB4, SPTB , SPTBN1 , SPTBN2 , SPTBN4 , SPTBN5 , SYNE1 , SYNE2 ,
- TAGLN , TAGLN2 , TAGLN3 ,
- UTRN i
- VAV1 , VAV2 , VAV3