HDAC4

HDAC4
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, AHO3, BDMR, HA6116, HD4, HDAC-4, HDAC-A, HDACA, deacetylaza histonowa 4,
identyfikatory zewnętrzne NEDCHID
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Deacetylaza histonowa 4 , znana również jako HDAC4 , jest białkiem kodowanym u ludzi przez gen HDAC4 .

Funkcjonować

Histony odgrywają kluczową rolę w regulacji transkrypcji , progresji cyklu komórkowego i zdarzeniach rozwojowych. Acetylacja /deacetylacja histonów zmienia strukturę chromosomów i wpływa na dostęp czynników transkrypcyjnych do DNA. Białko kodowane przez ten gen należy do klasy II deacetylazy histonowej /acuc/apha. Posiada aktywność deacetylazy histonowej i hamuje transkrypcję, gdy jest przywiązany do promotora. Białko to nie wiąże DNA bezpośrednio, ale poprzez czynniki transkrypcyjne MEF2C i MEF2D . Wydaje się oddziaływać w kompleksie wielobiałkowym z RbAp48 i HDAC3. Ponadto HDAC4 jest wymagany do różnicowania miofibroblastów indukowanego przez TGFbeta1.

Znaczenie kliniczne

Badania wykazały, że HDAC4 reguluje rozwój kości i mięśni. Naukowcy z Uniwersytetu Harvarda doszli również do wniosku, że promuje on zdrowy wzrok: obniżony poziom białka doprowadził do śmierci fotoreceptorów pręcików i komórek dwubiegunowych w siatkówkach myszy.

Interakcje

Wykazano, że HDAC4 wchodzi w interakcje z:

• BCL6 ,
• BTG2 ,
• CBX5 ,
• GATA1 ,
• HDAC3 ,
• MAPK1 ,
• MAPK3 ,
• MEF2C ,
• Specyficzny dla miocytów czynnik wzmacniający 2A ,
• Korepresor receptora jądrowego 1 ,
• Korepresor receptora jądrowego 2 ,
• Receptor jąder 2 ,
• YWHAB ,
• YWHAE i
• Białko zawierające palec cynkowy i domenę BTB 16 .

Zobacz też

• Deacetylaza histonowa

Dalsza lektura

•    Pazin MJ, Kadonaga JT (maj 1997). „Co jest w górę iw dół z deacetylacją i transkrypcją histonów?” . komórka . 89 (3): 325–8. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . PMID 9150131 . S2CID 11488594 .
•   Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (maj 2003). „Deacetylazy histonów klasy II: wszechstronne regulatory”. Trendy w genetyce . 19 (5): 286–93. doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . hdl : 2268/80861 . PMID 12711221 .
•   Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (kwiecień 1996). „Metoda„ podwójnego adaptera ”do ulepszonej konstrukcji biblioteki strzelb”. Biochemia analityczna . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
•    Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (kwiecień 1997). „Sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Badania genomu . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
•    Wolffe AP (maj 1997). „Kontrola transkrypcji. Grzeszne represje” . Natura . 387 (6628): 16–7. doi : 10.1038/387016a0 . PMID 9139815 . S2CID 29803420 .
•   Ohara O, Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Nomura N (luty 1997). „Konstrukcja i charakterystyka bibliotek cDNA ludzkiego mózgu odpowiednich do analizy klonów cDNA kodujących stosunkowo duże białka” . Badania DNA . 4 (1): 53–9. doi : 10.1093/dnares/4.1.53 . PMID 9179496 .
•   Fischle W, Emiliani S, Hendzel MJ, Nagase T, Nomura N, Voelter W, Verdin E (kwiecień 1999). „Nowa rodzina deacetylaz ludzkich histonów związanych z Saccharomyces cerevisiae HDA1p” . Journal of Biological Chemistry . 274 (17): 11713-20. doi : 10.1074/jbc.274.17.11713 . PMID 10206986 .
•    Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL (kwiecień 1999). „Trzy białka definiują klasę ludzkich deacetylaz histonowych związanych z drożdżami Hda1p” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (9): 4868–73. Bibcode : 1999PNAS...96.4868G . doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . PMC 21783 . PMID 10220385 .
•    Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (wrzesień 1999). „Deacetylaza HDAC4 wiąże się z czynnikiem transkrypcyjnym MEF2 i hamuje go” . Dziennik EMBO . 18 (18): 5099–107. doi : 10.1093/emboj/18.18.5099 . PMC 1171580 . PMID 10487761 .
•    Wang AH, Bertos NR, Vezmar M, Pelletier N, Crosato M, Heng HH, Th'ng J, Han J, Yang XJ (listopad 1999). „HDAC4, ludzka deacetylaza histonowa związana z HDA1 drożdży, jest korepresorem transkrypcyjnym” . Biologia molekularna i komórkowa . 19 (11): 7816–27. doi : 10.1128/mcb.19.11.7816 . PMC84849 . _ PMID 10523670 .
•   Youn HD, Grozinger CM, Liu JO (lipiec 2000). „Wapń reguluje represję transkrypcji czynnika wzmacniającego miocyty 2 przez deacetylazę histonową 4” . Journal of Biological Chemistry . 275 (29): 22563–7. doi : 10.1074/jbc.C000304200 . PMID 10825153 .
•    Grozinger CM, Schreiber SL (lipiec 2000). „Regulacja deacetylazy histonowej 4 i 5 oraz aktywności transkrypcyjnej przez lokalizację komórkową zależną od 14-3-3” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (14): 7835–40. Bibcode : 2000PNAS...97.7835G . doi : 10.1073/pnas.140199597 . PMC 16631 . PMID 10869435 .
•    Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (lipiec 2000). „BCoR, nowy korepresor zaangażowany w represję BCL-6” . Geny i rozwój . 14 (14): 1810–23. doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . PMC 316791 . PMID 10898795 .
•    Li J, Wang J, Wang J, Nawaz Z, Liu JM, Qin J, Wong J (sierpień 2000). „Oba białka korepresorowe SMRT i N-CoR występują w dużych kompleksach białkowych zawierających HDAC3” . Dziennik EMBO . 19 (16): 4342–50. doi : 10.1093/emboj/19.16.4342 . PMC 302030 . PMID 10944117 .
•    Wang AH, Kruhlak MJ, Wu J, Bertos NR, Vezmar M, Posner BI, Bazett-Jones DP, Yang XJ (wrzesień 2000). „Regulacja deacetylazy histonowej 4 przez wiązanie białek 14-3-3” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (18): 6904–12. doi : 10.1128/MCB.20.18.6904-6912.2000 . PMC88766 . _ PMID 10958686 .
•   Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (styczeń 2001). „Związek białka wiążącego terminal COOH (CtBP) i represora transkrypcji oddziałującego z MEF2 (MITR) przyczynia się do represji transkrypcji czynnika transkrypcyjnego MEF2” . Journal of Biological Chemistry . 276 (1): 35–9. doi : 10.1074/jbc.M007364200 . PMID 11022042 .
•    McKinsey TA, Zhang CL, Lu J, Olson EN (listopad 2000). „Zależny od sygnału eksport jądrowy deacetylazy histonowej reguluje różnicowanie mięśni” . Natura . 408 (6808): 106–11. Bibcode : 2000Natur.408..106M . doi : 10.1038/35040593 . PMC 4459600 . PMID 11081517 .
•    Zhou X, Richon VM, Wang AH, Yang XJ, Rifkind RA, Marks PA (grudzień 2000). „Deacetylaza histonowa 4 wiąże się z kinazami 1 i 2 regulowanymi sygnałem zewnątrzkomórkowym, a jej lokalizacja w komórce jest regulowana przez onkogenne Ras” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (26): 14329–33. Bibcode : 2000PNAS...9714329Z . doi : 10.1073/pnas.250494697 . PMC 18918 . PMID 11114188 .
•    McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN (grudzień 2000). „Aktywacja czynnika transkrypcyjnego wzmacniacza miocytów-2 przez stymulowane wapniem/kalmoduliną kinazy białkowe wiązanie 14-3-3 z deacetylazą histonową 5” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (26): 14400–5. Bibcode : 2000PNAS...9714400M . doi : 10.1073/pnas.260501497 . PMC 18930 . PMID 11114197 .

Linki zewnętrzne

• HDAC4 + białko, + człowiek w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .