Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
NCOR2
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, jądrowy receptor korepresorowy 2 Identyfikatory
zewnętrzne
Wikidane
Korepresor receptora jądrowego 2 ( NCOR2 ) koregulacyjnym białkiem transkrypcyjnym , które zawiera kilka domen oddziałujących z receptorem jądrowym . Ponadto wydaje się, że NCOR2 rekrutuje deacetylazy histonowe do regionów promotorowych DNA. Stąd NCOR2 wspomaga receptory jądrowe w regulacji w dół ekspresji docelowego genu. NCOR2 jest również określany jako mediator wyciszający receptory retinoidowe lub hormonu tarczycy ( SMRT ) lub kofaktor 1 związany z receptorem T3 ( TRAC -1 ).
Funkcjonować
NCOR2/SMRT jest koregulacyjnym białkiem transkrypcyjnym, które zawiera kilka modulujących domen funkcjonalnych, w tym wiele autonomicznych domen represyjnych, jak również dwie lub trzy domeny oddziałujące z C-końcowymi receptorami jądrowymi. NCOR2/SMRT służy jako represyjny czynnik koregulacyjny ( korepresor ) dla wielu szlaków czynników transkrypcyjnych . Pod tym względem NCOR2/SMRT działa jako białko platformowe, ułatwiając rekrutację deacetylaz histonowych do promotorów DNA związanych z jego oddziałującymi czynnikami transkrypcyjnymi.
Rodzina
Jest członkiem rodziny korepresorów receptorów jądrowych; innym ludzkim białkiem należącym do tej rodziny jest korepresor receptora jądrowego 1 .
Odkrycie
SMRT został początkowo sklonowany i scharakteryzowany w laboratorium dr Ronalda M. Evansa w Salk Institute for Biological Studies. W innym wczesnym badaniu tej cząsteczki podobne wyniki odnotowano w wariancie określanym jako TRAC-1.
Interakcje
Wykazano, że korepresor receptora jądrowego 2 wchodzi w interakcje z:
AR ,
BCL6 ,
C-Fos ,
C-jun ,
HDAC1 ,
HDAC3 ,
HDAC4 ,
HDAC5 ,
HDAC10 ,
MeCP2 ,
NR4A1 ,
POU2F1 ,
PPARD ,
PGR ,
PML
RBPJ ,
RELA ,
RUNX1T1 ,
RARA ,
SIN3A ,
SNW1 ,
SPEN ,
SRF ,
TBL1X ,
THRB ,
VDR i
ZBTB16 .
Dalsza lektura
Hörlein AJ, Näär AM, Heinzel T, Torchia J, Gloss B, Kurokawa R, Ryan A, Kamei Y, Söderström M, Glass CK (październik 1995). „Represja niezależna od ligandu przez receptor hormonu tarczycy, w której pośredniczy współrepresor receptora jądrowego”. Natura . 377 (6548): 397–404. Bibcode : 1995Natur.377..397H . doi : 10.1038/377397a0 . PMID 7566114 . S2CID 4230850 .
Chen JD, Evans RM (październik 1995). „Korepresor transkrypcji, który oddziałuje z jądrowymi receptorami hormonów”. Natura . 377 (6548): 454–7. Bibcode : 1995Natur.377..454C . doi : 10.1038/377454a0 . PMID 7566127 . S2CID 4361329 .
Sande S, Privalsky ML (lipiec 1996). „Identyfikacja TRAC (kofaktorów związanych z receptorem T3), rodziny kofaktorów, które łączą się z jądrowymi receptorami hormonów i modulują ich aktywność” . Endokrynologia Molekularna . 10 (7): 813–25. doi : 10.1210/mend.10.7.8813722 PMID 8813722 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (wrzesień 1996). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrywanie genów” . Badania genomu . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 PMID 8889548 .
Margolis RL, Abraham MR, Gatchell SB, Li SH, Kidwai AS, Breschel TS, Stine OC, Callahan C, McInnis MG, Ross CA (lipiec 1997). „cDNA z długimi powtórzeniami trinukleotydów CAG z ludzkiego mózgu”. Genetyka człowieka . 100 (1): 114–22. doi : 10.1007/s004390050476 . PMID 9225980 . S2CID 25999127 .
Hong SH, David G, Wong CW, Dejean A, Privalsky ML (sierpień 1997). „Korepresor SMRT oddziałuje z PLZF iz receptorem alfa kwasu PML-retinowego (RARalpha) i onkoproteinami PLZF-RARalpha związanymi z ostrą białaczką promielocytową” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (17): 9028–33. Bibcode : 1997PNAS...94.9028H . doi : 10.1073/pnas.94.17.9028 PMC23013 . _ PMID 9256429 .
Chen H, Lin RJ, Schiltz RL, Chakravarti D, Nash A, Nagy L, Privalsky ML, Nakatani Y, Evans RM (sierpień 1997). „Koaktywator receptora jądrowego ACTR jest nową acetylotransferazą histonową i tworzy multimeryczny kompleks aktywacyjny z P / CAF i CBP / p300” . komórka . 90 (3): 569–80. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80516-4 PMID 9267036 . S2CID 15284825 .
Lin RJ, Nagy L, Inoue S, Shao W, Miller WH, Evans RM (luty 1998). „Rola kompleksu deacetylazy histonowej w ostrej białaczce promielocytowej”. Natura . 391 (6669): 811–4. Bibcode : 1998Natur.391..811L . doi : 10.1038/35895 . PMID 9486654 . S2CID 4383951 .
Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN (lipiec 1998). „SAP30, składnik kompleksu korepresora mSin3 zaangażowanego w represję, w której pośredniczy N-CoR, przez określone czynniki transkrypcyjne” . Komórka molekularna . 2 (1): 33–42. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 PMID 9702189 .
Liu Y, Takeshita A, Misiti S, Chin WW, Yen PM (październik 1998). „Brak interakcji koaktywatora może być mechanizmem dominującej negatywnej aktywności zmutowanych receptorów hormonów tarczycy” . Endokrynologia . 139 (10): 4197–204. doi : 10.1210/endo.139.10.6218 PMID 9751500 .
Wong CW, Privalsky ML (październik 1998). „Składniki kompleksu korepresora SMRT wykazują charakterystyczne interakcje z onkoproteinami domeny POZ PLZF, PLZF-RARalpha i BCL-6” . Journal of Biological Chemistry . 273 (42): 27695–702. doi : 10.1074/jbc.273.42.27695 PMID 9765306 .
Ordentlich P, Downes M, Xie W, Genin A, Spinner NB, Evans RM (marzec 1999). „Unikalne formy ludzkiego i mysiego korepresora receptora jądrowego SMRT” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (6): 2639–44. Bibcode : 1999PNAS...96.2639O . doi : 10.1073/pnas.96.6.2639 PMC 15821 PMID 10077563 .
Park EJ, Schroen DJ, Yang M, Li H, Li L, Chen JD (marzec 1999). „SMRTe, mediator wyciszający dla przedłużonej izoformy receptorów retinoidów i hormonów tarczycy, który jest bardziej powiązany z korepresorem receptora jądrowego” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (7): 3519–24. Bibcode : 1999PNAS...96.3519P . doi : 10.1073/pnas.96.7.3519 PMC 22325 PMID 10097068 .
Nguyen TA, Hoivik D, Lee JE, Safe S (lipiec 1999). „Interakcje białek koaktywatora / korepresora receptora jądrowego z kompleksem receptora węglowodorów arylowych”. Archiwa Biochemii i Biofizyki . 367 (2): 250–7. doi : 10.1006/abbi.1999.1282 . PMID 10395741 .
Bailey P, Downes M, Lau P, Harris J, Chen SL, Hamamori Y, Sartorelli V, Muscat GE (lipiec 1999). „Korepresor receptora jądrowego N-CoR reguluje różnicowanie: N-CoR bezpośrednio oddziałuje z MyoD” . Endokrynologia Molekularna . 13 (7): 1155–68. doi : 10.1210/mend.13.7.0305 PMID 10406466 .
Kao HY, Downes M, Ordentlich P, Evans RM (styczeń 2000). „Izolacja nowej deacetylazy histonowej ujawnia, że deacetylazy klasy I i II promują represję, w której pośredniczy SMRT” . Geny i rozwój . 14 (1): 55–66. doi : 10.1101/gad.14.1.55 . PMC 316336 PMID 10640276 .
Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Miyamoto A, Weinmaster G, Hayward SD (kwiecień 2000). „SKIP, białko związane z CBF1, oddziałuje z domeną powtórzeń ankiryny NotchIC, aby ułatwić funkcję NotchIC” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (7): 2400–10. doi : 10.1128/MCB.20.7.2400-2410.2000 . PMC85419 . _ PMID 10713164 .
Lee SK, Kim JH, Lee YC, Cheong J, Lee JW (kwiecień 2000). „Wyciszający mediator kwasu retinowego i receptorów hormonów tarczycy, jako nowa transkrypcyjna cząsteczka korepresora aktywującego białka-1, czynnika jądrowego-kappaB i czynnika odpowiedzi surowicy” . Journal of Biological Chemistry . 275 (17): 12470-4. doi : 10.1074/jbc.275.17.12470 PMID 10777532 .
Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (maj 2000). „Kompleks korepresora rdzenia SMRT zawierający HDAC3 i TBL1, białko powtórzeń WD40 związane z głuchotą” . Geny i rozwój . 14 (9): 1048–57. doi : 10.1101/gad.14.9.1048 . PMC 316569 PMID 10809664 .
Grozinger CM, Schreiber SL (lipiec 2000). „Regulacja deacetylazy histonowej 4 i 5 oraz aktywności transkrypcyjnej przez lokalizację komórkową zależną od 14-3-3” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (14): 7835–40. Bibcode : 2000PNAS...97.7835G . doi : 10.1073/pnas.140199597 PMC 16631 PMID 10869435 .
Galeria PDB
1xc5 : Struktura rozwiązania domeny aktywacji deacetylazy SMRT
Linki zewnętrzne
