PCAF

KAT2B
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, CAF, P/CAF, PCAF, acetylotransferaza lizynowa 2B
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcje molekularne Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Czynnik związany z P300/CBP ( PCAF ), znany również jako acetylotransferaza K(lizyny) 2B ( KAT2B ), jest ludzkim genem i koaktywatorem transkrypcji związanym z p53 .

Struktura

Kilka domen PCAF może działać niezależnie lub wspólnie, aby umożliwić jego funkcje. PCAF ma oddzielne acetylotransferazy i ligazy ubikwityny E3 , a także bromodomenę do interakcji z innymi białkami. PCAF posiada również miejsca do własnej acetylacji i ubikwitynacji.

Funkcjonować

CBP i p300 to duże białka jądrowe, które wiążą się z wieloma specyficznymi dla sekwencji czynnikami zaangażowanymi we wzrost i/lub różnicowanie komórek, w tym c-jun i onkoproteinę adenowirusową E1A. Białko kodowane przez gen PCAF wiąże się z p300/CBP. Ma aktywność wiązania in vitro i in vivo z CBP i p300 oraz konkuruje z E1A o miejsca wiązania w p300/CBP. Ma acetylotransferazy histonowej z histonami rdzeniowymi i cząstkami rdzenia nukleosomu , co wskazuje, że białko to odgrywa bezpośrednią rolę w regulacji transkrypcji.

Rozporządzenie

Aktywność acetylotransferazy i lokalizacja komórkowa PCAF są regulowane przez acetylację samego PCAF. PCAF może być autoacetylowany (acetylowany samodzielnie) lub przez p300 . Acetylacja prowadzi do migracji do jądra i zwiększa jego aktywność acetylotransferazy. PCAF oddziałuje z HDAC3 i jest przez niego deacetylowany , co prowadzi do zmniejszenia aktywności acetylotransferazy PCAF i lokalizacji w cytoplazmie.

Interakcje białek

PCAF tworzy kompleksy z licznymi białkami, które kierują jego aktywnością. Na przykład PCAF jest rekrutowany przez ATF do acetylowania histonów i promowania transkrypcji docelowych genów ATF4.

Cele

Istnieją różne cele białkowe aktywności acetylotransferazy PCAF, w tym czynniki transkrypcyjne, takie jak Fli1 , p53 i liczne reszty histonowe. Wykazano również, że Hdm2 , która sama jest ligazą ubikwitynową ukierunkowaną na p53, jest celem aktywności ligazy ubikwitynowej PCAF.

Interakcje

Wykazano, że PCAF wchodzi w interakcje z:

• BRCA2 ,
• CTNNB1 ,
• CREBBP ,
• EVI1 ,
• HNF1A ,
• IRF1 ,
• IRF2 ,
• KLF13 ,
• Mdm2
• Myc ,
• NCOA1 ,
• POLR2A ,
• RBPJ ,
• TCF3 ,
• TRAP i
• SKRĘT1 .

Zobacz też

• Koregulator transkrypcji
• Acetylotransferaza

Linki zewnętrzne

• Białko PCAF, ludzkie w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• NURSA C105

Dalsza lektura

•    Marcello A, Zoppe M, Giacca M (2002). „Wiele trybów regulacji transkrypcji przez transaktywator HIV-1 Tat”. Życie IUBMB . 51 (3): 175–81. doi : 10.1080/152165401753544241 . PMID 11547919 . S2CID 10931640 .
•    Ott M, Dorr A, Hetzer-Egger C, Kaehlcke K, Schnolzer M, Henklein P, Cole P, Zhou MM, Verdin E (2004). Acetylacja Tat: przełącznik regulacyjny między wczesną i późną fazą wydłużania transkrypcji HIV . Znaleziono Novartisa. Symp . Sympozja Fundacji Novartis. Tom. 259. s. 182-93, omówienie 193-6, 223-5. doi : 10.1002/0470862637.ch13 . ISBN 978-0-470-86263-6 . PMID 15171254 .
•   Liou LY, Herrmann CH, Rice AP (2005). „Zakażenie HIV-1 i regulacja funkcji Tat w makrofagach”. Int. J. Biochem. Biol komórkowy . 36 (9): 1767–75. doi : 10.1016/j.biocel.2004.02.018 . PMID 15183343 .
•   Gibellini D, Vitone F, Schiavone P, Re MC (2005). „Białko tat wirusa HIV-1 oraz proliferacja i przeżycie komórek: krótki przegląd”. Nowy mikrobiom . 28 (2): 95–109. PMID 16035254 .
•   Hetzer C, Dormeyer W, Schnölzer M, Ott M (2006). „Dekodowanie Tat: biologia potranslacyjnych modyfikacji HIV Tat”. Zarażają drobnoustroje . 7 (13): 1364-9. doi : 10.1016/j.micinf.2005.06.003 . PMID 16046164 .
•   Peruzzi F (2006). „Wiele funkcji HIV-1 Tat: proliferacja a apoptoza” . Przód. Biologia . 11 : 708–17. doi : 10.2741/1829 . PMID 16146763 .
•    Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). „Regulacja transkrypcji HIV-1: cele molekularne dla interwencji chemioterapeutycznej” . Med Res ks . 26 (5): 595–625. doi : 10.1002/med.20081 . PMC 7168390 . PMID 16838299 .
•   Harrich D, McMillan N, Munoz L, Apolloni A, Meredith L (2007). „Czy różnorodne interakcje Tat doprowadzą do nowych celów leków przeciwretrowirusowych?”. Aktualne cele leków . 7 (12): 1595–606. doi : 10.2174/138945006779025338 . PMID 17168834 .
•   Dawson SJ, Biały LA (1992). „Leczenie zapalenia wsierdzia wywołanego przez Haemophilus aphrophilus cyprofloksacyną”. J. Zarażać . 24 (3): 317–20. doi : 10.1016/S0163-4453(05)80037-4 . PMID 1602151 .
•    Yang XJ, Ogryzko VV, Nishikawa J, Howard BH, Nakatani Y (1996). „Czynnik związany z p300 / CBP, który konkuruje z adenowirusowym onkoproteiną E1A”. Natura . 382 (6589): 319–24. Bibcode : 1996Natur.382..319Y . doi : 10.1038/382319a0 . PMID 8684459 . S2CID 4328685 .
•    Ogryzko VV, Schiltz RL, Russanova V, Howard BH, Nakatani Y (1997). „Koaktywatory transkrypcji p300 i CBP to acetylotransferazy histonowe” . komórka . 87 (5): 953–9. doi : 10.1016/S0092-8674(00)82001-2 . PMID 8945521 . S2CID 2624456 .
•    Jenster G, Spencer TE, Burcin MM, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (1997). „Indukcja receptora steroidowego transkrypcji genów: model dwuetapowy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 94 (15): 7879–84. Bibcode : 1997PNAS...94.7879J . doi : 10.1073/pnas.94.15.7879 . PMC 21523 . PMID 9223281 .
•    Chen H, Lin RJ, Schiltz RL, Chakravarti D, Nash A, Nagy L, Privalsky ML, Nakatani Y, Evans RM (1997). „Koaktywator receptora jądrowego ACTR jest nową acetylotransferazą histonową i tworzy multimeryczny kompleks aktywacyjny z P / CAF i CBP / p300” . komórka . 90 (3): 569–80. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80516-4 . PMID 9267036 . S2CID 15284825 .
•    Spencer TE, Jenster G, Burcin MM, Allis CD, Zhou J, Mizzen CA, McKenna NJ, Onate SA, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (1997). „Koaktywator receptora steroidowego-1 to acetylotransferaza histonowa”. Natura . 389 (6647): 194-8. Bibcode : 1997Natur.389..194S . doi : 10.1038/38304 . PMID 9296499 . S2CID 4404530 .
•   Takeshita A, Cardona GR, Koibuchi N, Suen CS, Chin WW (1997). „TRAM-1, nowa cząsteczka aktywatora receptora hormonu tarczycy o masie cząsteczkowej 160 kDa, wykazuje różne właściwości od koaktywatora receptora steroidowego-1” . J. Biol. chemia . 272 (44): 27629–34. doi : 10.1074/jbc.272.44.27629 . PMID 9346901 .
•   Korzus E, Torchia J, Rose DW, Xu L, Kurokawa R, McInerney EM, Mullen TM, Glass CK, Rosenfeld MG (1998). „Wymagania specyficzne dla czynnika transkrypcyjnego dla koaktywatorów i ich funkcji acetylotransferazy”. nauka . 279 (5351): 703–7. Bibcode : 1998Sci...279..703K . doi : 10.1126/science.279.5351.703 . PMID 9445475 .
•   Puri PL, Sartorelli V, Yang XJ, Hamamori Y, Ogryzko VV, Howard BH, Kedes L, Wang JY, Graessmann A, Nakatani Y, Levrero M (1998). „Różne role acetylotransferaz p300 i PCAF w różnicowaniu mięśni” . Mol. komórka . 1 (1): 35–45. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80005-2 . PMID 9659901 .
•    Ogryzko VV, Kotani T, Zhang X, Schiltz RL, Howard T, Yang XJ, Howard BH, Qin J, Nakatani Y (1998). „Histonopodobne TAF w obrębie kompleksu acetylazy histonowej PCAF” . komórka . 94 (1): 35–44. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . PMID 9674425 . S2CID 18942972 .
•   Randhawa GS, Bell DW, Testa JR, Feinberg AP (1998). „Identyfikacja i mapowanie homologów genów modyfikujących acetylację ludzkich histonów”. Genomika . 51 (2): 262–9. doi : 10.1006/geno.1998.5370 . PMID 9722949 .
•   Benkirane M, Chun RF, Xiao H, Ogryzko VV, Howard BH, Nakatani Y, Jeang KT (1998). „Aktywacja zintegrowanego prowirusa wymaga acetylotransferazy histonowej. p300 i P / CAF są koaktywatorami HIV-1 Tat” . J. Biol. chemia . 273 (38): 24898–905. doi : 10.1074/jbc.273.38.24898 . PMID 9733796 .

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .