HDAC3
| HDAC3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , HD3, RPD3, RPD3-2, deacetylaza histonowa 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deacetylaza histonowa 3 jest enzymem kodowanym przez gen HDAC3 u ludzi i myszy.
Funkcjonować
Histony to wysoce alkaliczne białka, które pakują i porządkują DNA w jednostki strukturalne zwane nukleosomami, które stanowią główny białkowy składnik chromatyny. Potranslacyjna i enzymatyczna acetylacja i deacetylacja ogonów histonowych lizyny zmienia lokalną strukturę chromatyny poprzez zmianę przyciągania elektrostatycznego między ujemnie naładowanym szkieletem DNA a histonami. HDAC3 jest członkiem klasy I nadrodziny deacetylazy histonowej (składającej się z czterech klas w oparciu o homologię funkcji i sekwencji DNA), która jest rekrutowana do wzmacniaczy w celu modulowania zarówno ekspresji epigenomu, jak i pobliskiego genu. HDAC3 występuje wyłącznie w jądrze komórkowym , gdzie jest jedyną endogenną deacetylazą histonową oczyszczoną biochemicznie w kompleksie jądro-receptor korepresor zawierający NCOR i SMRT (NCOR2). Zatem HDAC3, w przeciwieństwie do innych HDAC, odgrywa wyjątkową rolę w modulowaniu aktywności transkrypcyjnej receptorów jądrowych.
Funkcje alternatywne
Deacetylazy histonowe mogą być regulowane przez czynniki endogenne, składniki diety, syntetyczne inhibitory i sygnały pochodzące od bakterii. Badania na myszach ze specyficzną delecją HDAC3 w komórkach nabłonka jelit (IEC) wykazują rozregulowaną ekspresję genów IEC. U tych myszy z mutacją delecyjną utrata komórek Panetha zaobserwowano upośledzoną funkcję IEC oraz zmiany w składzie jelitowym bakterii komensalnych. Tych negatywnych skutków nie zaobserwowano u myszy wolnych od drobnoustrojów, co wskazuje, że skutki delecji są widoczne tylko w obecności kolonizacji drobnoustrojami jelitowymi. Ale negatywne skutki delecji HDAC3 nie wynikają z obecności zmienionej mikroflory, ponieważ normalne myszy wolne od zarazków skolonizowane zmienioną mikroflorą nie wykazywały negatywnych skutków obserwowanych w mutantach delecyjnych.
Chociaż dokładny mechanizm i specyficzne sygnały nie są znane, jasne jest, że HDAC3 oddziałuje z pochodnymi sygnałami bakterii komensalnych mikroflory jelitowej . Te interakcje są odpowiedzialne za kalibrację odpowiedzi komórek nabłonka niezbędnych do ustanowienia prawidłowego stosunku między żywicielem a komensalem oraz do utrzymania homeostazy jelitowej .
Organizmy modelowe
| Charakterystyka | Fenotyp |
|---|---|
| Żywotność homozygoty | Nieprawidłowy |
| Recesywne śmiertelne badanie | Nieprawidłowy |
| Płodność | Normalna |
| Masy ciała | Normalna |
| Lęk | Normalna |
| Ocena neurologiczna | Normalna |
| Siła uścisku | Normalna |
| Gorący talerz | Normalna |
| Dysmorfologia | Normalna |
| Kalorymetria pośrednia | Normalna |
| Test tolerancji glukozy | Normalna |
| Słuchowa reakcja pnia mózgu | Normalna |
| DEXA | Normalna |
| Radiografia | Normalna |
| Temperatura ciała | Normalna |
| Morfologia oka | Normalna |
| Chemia kliniczna | Normalna |
| Immunoglobuliny osocza | Normalna |
| Hematologia | Normalna |
| Limfocyty krwi obwodowej | Normalna |
| Test mikrojądrowy | Normalna |
| Waga serca | Normalna |
| Histopatologia skóry | Normalna |
| Histopatologia mózgu | Normalna |
| Zakażenie Salmonellą | Normalna |
| Infekcja citrobakterii | Normalna |
| Wszystkie testy i analizy z |
W badaniu funkcji HDAC3 wykorzystano organizmy modelowe . Linia myszy z warunkowym nokautem , zwana Hdac3 tm1a (EUCOMM) Wtsi , została wygenerowana w ramach programu International Knockout Mouse Consortium , wysokowydajnego projektu mutagenezy mającego na celu generowanie i dystrybucję zwierzęcych modeli chorób do zainteresowanych naukowców.
Samce i samice zwierząt poddano standaryzowanemu badaniu fenotypowemu w celu określenia skutków delecji.
Przeprowadzono dwadzieścia sześć testów na zmutowanych myszach i zaobserwowano dwie znaczące nieprawidłowości. Nie homozygotycznych zmutowanych zarodków podczas ciąży, aw oddzielnym badaniu żaden nie przeżył do odsadzenia . Pozostałe testy przeprowadzono na heterozygotycznych zmutowanych dorosłych myszach; u tych zwierząt nie zaobserwowano żadnych istotnych nieprawidłowości.
Interakcje
Wykazano, że HDAC3 wchodzi w interakcje z:
Zobacz też
Dalsza lektura
- Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). „Deacetylazy histonów klasy II: wszechstronne regulatory”. Trendy Genet . 19 (5): 286–93. doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . hdl : 2268/80861 . PMID 12711221 .
Linki zewnętrzne
- HDAC3 + białko, + człowiek w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .
