HLA-A11
HLA-A11 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
( MHC klasy I , antygen powierzchniowy komórki) Renderowanie | ||||||||||
O | ||||||||||
Białko | receptor / ligand transbłonowy | |||||||||
Struktura | heterodimer αβ | |||||||||
podjednostki | HLA-A *11--, β2 - mikroglobulina | |||||||||
Starsze nazwy | HL-A11 | |||||||||
Podtypy | ||||||||||
| ||||||||||
Rzadkie allele | ||||||||||
| ||||||||||
Łączenie alleli z bazą danych IMGT/HLA w EBI |
HLA-A11 (A11) to ludzki serotyp antygenu leukocytarnego należący do grupy serotypów HLA-A „A”. Serotyp jest określany przez rozpoznawanie przez przeciwciało podzbioru α11 łańcuchów α HLA-A. W przypadku A11 łańcuch alfa „A” jest kodowany przez grupę alleli HLA-A *11 , a łańcuch β jest kodowany przez locus B2M . Ta grupa jest obecnie zdominowana przez A*1101. A11 i A *11 są prawie synonimami w znaczeniu. A11 występuje częściej w Azji Wschodniej niż gdzie indziej, jest częścią kilku długich haplotypów które wydają się być częste wśród starożytnych ludów Azji.
Serotyp
A*11 | A11 | Próbka |
allel | % | rozmiar (N) |
*1101 | 99 | 2530 |
*1102 | 76 | 42 |
*1103 | 83 | 18 |
*1104 | 60 | 6 |
Serotypowanie A11 wykazuje lepsze rozpoznawanie produktów genu *1101 i gorsze rozpoznawanie innych produktów genu A*11. Istnieje ~ 40 rozpoznanych alleli A * 11. Jest tylko jeden null sklasyfikowany jako A11.
W chorobie zakaźnej
Zaobserwowano powiązania między A11 a rodzinną otosklerozą , gruźlicą płuc, trądem i zakażeniem wirusem cytomegalii z padaczką . Te i inne badania sugerują związek między A11 a wtórnymi skutkami niektórych infekcji wirusem opryszczki. A11 stwierdzono również wzrost raka nadgłośniowego ze słabym 3-letnim przeżyciem. W kostniakomięsaku A11 stwierdzono podwyższenie.
Istnieje silny związek między zapaleniem wątroby wywołanym lekami przeciwdepresyjnymi a HLA-A11. W autoimmunologicznym zapaleniu wątroby A11 ma działanie synergistyczne, działając razem z DR4 i DR3, zwiększając prawdopodobieństwo wystąpienia choroby do ponad 300.
A11 jest również częścią haplotypu A11-Cw4-B35-DR1-DQ1, który jest drugim czynnikiem szybkiego rozwoju HIV. Zaangażowanie chłoniaka nieziarniczego, głównie w wyniku reinfekcji wirusem Epsteina-Barr, nie wydaje się być przyczyną tego przyspieszenia.
Anomalia wirusa Epsteina-Barra
Istnieje co najmniej kilka postaci chorób limfoproliferacyjnych , które wydają się wynikać z nierozwiązanej infekcji wirusem Epsteina-Barra . Badanie samego wirusa doprowadziło do odkrycia szczepów, które mogą prawie wyłączyć odpowiedź klasy I za pośrednictwem A11 na wirusa u ludzi wzbogaconych w A11 (patrz tabele poniżej). Ta zdolność do wyłączania układu odpornościowego i utrzymywania aktywności wirusa jest czynnikiem karcynogenezy. Wczesne badania serotypów A ujawniły związek A11 z chłoniakiem Hodgkina a ostatnie badania wykazały złożony udział infekcji wirusem Epsteina-Barra w wyniku niskiej kontroli A11 nad infekcją.
Chłoniak Burkitta ostatecznie doprowadził do odkrycia wirusa, jednak choroba ta jest bardziej widoczna w Afryce. Następnie odkryto udział w cytotoksycznych limfocytów T w chłoniaku Burkitta. Nowsze badania pokazują, że A11 jest zmniejszona, a prawdopodobną przyczyną są inne defekty genetyczne. Zdolność do prezentacji antygenów wirusa EB ujawniła defekt w procesie po procesie antygenowym, ale przed zaangażowaniem TAP1 . Inne badania wykazały, że peptydy wiążą A11 przy dostarczaniu na powierzchnię komórki w celu badania przesiewowego CTL, ale odpadają i są niszczone wewnątrzkomórkowo. Jednak A3 i A11 mogą przetwarzać i ładować antygeny nawet wtedy, gdy proteosomu jest zmniejszona, co sugeruje alternatywny mechanizm ładowania, który może korzystnie wpływać na powrót do zdrowia po niektórych chorobach, ale utrudniać powrót do zdrowia innych.
Wygląda na to, że te i inne wirusy nauczyły się wykorzystywać pewien defekt w regionie otaczającym A11, który umożliwia niemal całkowite wyłączenie ekspresji genów. Co dziwne, w Afryce A11 występuje na bardzo niskich częstotliwościach, a homozygoty są rzadkie, co sugeruje, że mogą istnieć inne predyspozycje genetyczne, które kierują wirusa w stronę chłoniaka Burkitta.
Allele
Badana populacja |
Częstotliwość (W %) |
---|---|
P apua Nowa G uinea Madang | 63,6 |
PNG West Schrader Ranges | 55,0 |
Tajwan Hakka | 40,0 |
PNG Wosera | 38,5 |
Chiny Yunnan Naxi | 38,0 |
Tajwan Tao | 36,0 |
Chiny Guangxi Maonan | 35.2 |
Chiny Kanton | 33,8 |
Tajwan Minnan (1) | 30,9 |
Tajlandia | 29,9 |
Chiny Wuhan | 29,3 |
Tajwan Pazeh | 28.2 |
Chiny Południowe Han | 27,7 |
Tajlandia północno-wschodnia | 27.1 |
Singapurski Chińczyk | 26,5 |
Tajwańczycy ze środkowych Chin… | 26.2 |
PNG New Britain Rabaul | 26.0 |
Pakistański Brahui | 25.2 |
Australia Ind. Groote E… | 24.0 |
Indie Nowe Delhi | 23,5 |
Amerykańska Azjatka | 23.0 |
Pakistan Baloch | 22.2 |
Tajwan Thao | 21.7 |
Chiny, Shandong, Linqu Co… | 20.4 |
pakistański sindhi | 19.6 |
Australia Ind. Przylądek Yor… | 18.0 |
PNG Płaskowyż Karimui | 17,9 |
Singapur Riau malajski | 17.7 |
Tajwan Siraya | 17.6 |
Chiny Pekin | 16.4 |
Pakistański Patan | 16.3 |
Chiny Mongolia Wewnętrzna | 16.2 |
Samoa Amerykańskie | 16.0 |
Hiszpania Baskijska dolina Arratia… | 16.0 |
Chiny Qinghai Hui | 15.9 |
Rosja Murmańsk Saomi | 14.0 |
Singapur jawajski indonezyjski… | 14.0 |
Nowa Kaledonia | 13.1 |
Japonia Aichi | 12.7 |
Georgia Svaneti Svans | 12,5 |
Indie Północne Hindusi | 12,5 |
Burusho z Pakistanu | 12,5 |
Chiny Yunnan Han (2) | 12.3 |
Indie Mumbai Marathów | 12.3 |
China Harbin N. Koreański | 12.1 |
Indie Andhra Pradesh Goll… | 11.9 |
Tajwański Saisiat | 11.8 |
Oman | 11.4 |
Izraelscy Arabowie Druzowie | 11.0 |
Korea Południowa (3) | 10.8 |
Tajwan Tsou | 10.8 |
Mongolia Khoton Tarialan | 10.7 |
Sri Lanka Kolombo syngaleski… | 10.4 |
Gruzja Tbilisi Kurdowie | 10.0 |
Mongolia Khalkha | 10.0 |
Australia Ind. Kimberly | 9.7 |
Indie Północne Delhi | 9.4 |
Japonia Hyogo | 9.4 |
Hiszpania Północne Cabuernigo | 8.9 |
Arabia Saudyjska | 8.7 |
Rosja Tuwa (2) | 8.7 |
Hiszpania Północno-Kantabryjski | 8.4 |
Japonia Środkowa | 8.2 |
rumuński | 8.2 |
Grecja Północna | 8.0 |
Irlandia Północna | 8.0 |
Tajwański Atayal | 8.0 |
Jordan Amman | 7.9 |
Włochy Północne (1) | 7.7 |
Włochy Sardynia (3) | 7.7 |
Australia Ind. Yuendumu | 7.6 |
Mongolia Tsaatan | 7.6 |
Amerykanie rasy kaukaskiej (3) | 7.4 |
Bułgaria | 7.3 |
Tajwan Taroko | 7.3 |
Filipiny Ivatan | 7.0 |
Amerykańska kaukaska Bethesda | 7.0 |
Centrum Portugalii (2) | 6.8 |
Australia Nowa Południowa Walia | 6.7 |
Maroko | 6.7 |
Stany Zjednoczone Hawaje Okinawa | 6.7 |
Walia | 6.6 |
Serbia | 6.5 |
Gruzja Tbilisi Gruziński… | 6.2 |
Irlandia Południowa | 6.2 |
Algieria(1) | 6.2 |
Brazylia | 6.1 |
Hiszpania Basków Gipuzkoa Pro… | 6.1 |
Turcja (2) | 6.1 |
Rosja północno-zachodnia | 6.0 |
Portugalia Południowa pop2 | 5.9 |
Anglia Newcastle | 5.7 |
Włochy Północna Pawia | 5.6 |
izraelscy Żydzi | 5.4 |
Szwecja Sztokholm | 5.1 |
Finlandia | 5.0 |
Macedonia (4) | 4.9 |
Włochy Bergamo | 4.8 |
Maroko Berber Nador Meta… | 4.8 |
Przedstawiono tylko częstości alleli |
Badana populacja |
Częstotliwość (W %) |
---|---|
Tajwański Saisiat | 12.7 |
Tajwan Pazeh | 10.9 |
Tajwan Ami | 8.7 |
Tajwan Puyuma | 7.0 |
Tajwan Siraya | 6.9 |
Chiny Guangxi Maonan | 6.5 |
Tajwański Atayal | 5.2 |
Filipiny Ivatan | 5.0 |
Ch. Guangdong Meizhou Han | 4.6 |
Tajwan Hakka | 4.5 |
chiński z Hongkongu | 4.0 |
Tajwan Minnan (1) | 3.9 |
Tajlandia | 3.5 |
Singapurski Chińczyk | 3.0 |
Tajwan Tao | 3.0 |
Tajwan Tsou | 2.9 |
Chiny Pekin Shijiazhuan… | 2.0 |
Włochy Północne pop 1 | 1.9 |
Tajwan Taroko | 1.8 |
Chiny Mongolia Wewnętrzna | 1.0 |
Parsowie na zachodnim wybrzeżu Indii | 1.0 |
Tajwan Bunun | 1.0 |
Chiny Qinghai Hui | 0,9 |
Chiny Yunnan Lisu | 0,6 |
Japonia (3) | 0,2 |
Przedstawiono tylko częstości alleli |
Badana populacja |
Częstotliwość (W %) |
---|---|
Chiny Yunnan Lisu | 5.1 |
Chiny Yunnan Nu | 3.8 |
Chiny Pekin Shijiazhuan… | 0,2 |
Przedstawiono tylko częstości alleli |
Badana populacja |
Częstotliwość (W %) |
---|---|
Georgia Svaneti Svans | 1.3 |
Singapur Riau malajski | 1.2 |
Samoa Amerykańskie | 1.0 |
Indie Północne Hindusi | 1.0 |
Izrael aszkenazyjscy i nie… | 0,4 |
Chiny Pekin Shijiazhuan… | 0,2 |
Przedstawiono tylko częstości alleli |
Stowarzyszenia chorobowe
A*1104 wiąże się ze zwiększonym ryzykiem nowotworu szyjki macicy w wyniku zakażenia wirusem brodawczaka ludzkiego
haplotypy A11-B
A11-B13
- A11-Cw2-B13 (Li)
- A11-Cw9-B13 (południowe Chiny i południowo-wschodnia Azja)
- A11-C10-B13 Kupuj
- A11-CBL-B13 Północne Chiny