HLA-A11

HLA-A11
( MHC klasy I , antygen powierzchniowy komórki) Renderowanie
HLA-A11.png
A11 (A*1101-B2M) w kompleksie z homologiem peptydu HBV HLA-A11 „łańcuch alfa” (cyjan), β2- mikroglobulina (różowy), HBV peptyd (żółty).
O
Białko receptor / ligand transbłonowy
Struktura heterodimer αβ
podjednostki HLA-A *11--, β2 - mikroglobulina
Starsze nazwy HL-A11
Podtypy
Podtyp
allel
Dostępne konstrukcje
A11E, A11.1 , , ,
A11K, A11.2
Rzadkie allele
Podtyp
allel
Dostępne konstrukcje
A11.3
A11.4
Łączenie alleli z bazą danych IMGT/HLA w EBI

HLA-A11 (A11) to ludzki serotyp antygenu leukocytarnego należący do grupy serotypów HLA-A „A”. Serotyp jest określany przez rozpoznawanie przez przeciwciało podzbioru α11 łańcuchów α HLA-A. W przypadku A11 łańcuch alfa „A” jest kodowany przez grupę alleli HLA-A *11 , a łańcuch β jest kodowany przez locus B2M . Ta grupa jest obecnie zdominowana przez A*1101. A11 i A *11 są prawie synonimami w znaczeniu. A11 występuje częściej w Azji Wschodniej niż gdzie indziej, jest częścią kilku długich haplotypów które wydają się być częste wśród starożytnych ludów Azji.

Serotyp

Rozpoznawanie przez A11 niektórych produktów genów HLA A*11
A*11 A11 Próbka
allel % rozmiar (N)
*1101 99 2530
*1102 76 42
*1103 83 18
*1104 60 6

Serotypowanie A11 wykazuje lepsze rozpoznawanie produktów genu *1101 i gorsze rozpoznawanie innych produktów genu A*11. Istnieje ~ 40 rozpoznanych alleli A * 11. Jest tylko jeden null sklasyfikowany jako A11.

W chorobie zakaźnej

Zaobserwowano powiązania między A11 a rodzinną otosklerozą , gruźlicą płuc, trądem i zakażeniem wirusem cytomegalii z padaczką . Te i inne badania sugerują związek między A11 a wtórnymi skutkami niektórych infekcji wirusem opryszczki. A11 stwierdzono również wzrost raka nadgłośniowego ze słabym 3-letnim przeżyciem. W kostniakomięsaku A11 stwierdzono podwyższenie.

Istnieje silny związek między zapaleniem wątroby wywołanym lekami przeciwdepresyjnymi a HLA-A11. W autoimmunologicznym zapaleniu wątroby A11 ma działanie synergistyczne, działając razem z DR4 i DR3, zwiększając prawdopodobieństwo wystąpienia choroby do ponad 300.

A11 jest również częścią haplotypu A11-Cw4-B35-DR1-DQ1, który jest drugim czynnikiem szybkiego rozwoju HIV. Zaangażowanie chłoniaka nieziarniczego, głównie w wyniku reinfekcji wirusem Epsteina-Barr, nie wydaje się być przyczyną tego przyspieszenia.

Anomalia wirusa Epsteina-Barra

Istnieje co najmniej kilka postaci chorób limfoproliferacyjnych , które wydają się wynikać z nierozwiązanej infekcji wirusem Epsteina-Barra . Badanie samego wirusa doprowadziło do odkrycia szczepów, które mogą prawie wyłączyć odpowiedź klasy I za pośrednictwem A11 na wirusa u ludzi wzbogaconych w A11 (patrz tabele poniżej). Ta zdolność do wyłączania układu odpornościowego i utrzymywania aktywności wirusa jest czynnikiem karcynogenezy. Wczesne badania serotypów A ujawniły związek A11 z chłoniakiem Hodgkina a ostatnie badania wykazały złożony udział infekcji wirusem Epsteina-Barra w wyniku niskiej kontroli A11 nad infekcją.

Chłoniak Burkitta ostatecznie doprowadził do odkrycia wirusa, jednak choroba ta jest bardziej widoczna w Afryce. Następnie odkryto udział w cytotoksycznych limfocytów T w chłoniaku Burkitta. Nowsze badania pokazują, że A11 jest zmniejszona, a prawdopodobną przyczyną są inne defekty genetyczne. Zdolność do prezentacji antygenów wirusa EB ujawniła defekt w procesie po procesie antygenowym, ale przed zaangażowaniem TAP1 . Inne badania wykazały, że peptydy wiążą A11 przy dostarczaniu na powierzchnię komórki w celu badania przesiewowego CTL, ale odpadają i są niszczone wewnątrzkomórkowo. Jednak A3 i A11 mogą przetwarzać i ładować antygeny nawet wtedy, gdy proteosomu jest zmniejszona, co sugeruje alternatywny mechanizm ładowania, który może korzystnie wpływać na powrót do zdrowia po niektórych chorobach, ale utrudniać powrót do zdrowia innych.

Wygląda na to, że te i inne wirusy nauczyły się wykorzystywać pewien defekt w regionie otaczającym A11, który umożliwia niemal całkowite wyłączenie ekspresji genów. Co dziwne, w Afryce A11 występuje na bardzo niskich częstotliwościach, a homozygoty są rzadkie, co sugeruje, że mogą istnieć inne predyspozycje genetyczne, które kierują wirusa w stronę chłoniaka Burkitta.

Allele

Częstotliwości HLA A*1101
Badana populacja
  Częstotliwość (W %)
P apua Nowa G uinea Madang 63,6
PNG West Schrader Ranges 55,0
Tajwan Hakka 40,0
PNG Wosera 38,5
Chiny Yunnan Naxi 38,0
Tajwan Tao 36,0
Chiny Guangxi Maonan 35.2
Chiny Kanton 33,8
Tajwan Minnan (1) 30,9
Tajlandia 29,9
Chiny Wuhan 29,3
Tajwan Pazeh 28.2
Chiny Południowe Han 27,7
Tajlandia północno-wschodnia 27.1
Singapurski Chińczyk 26,5
Tajwańczycy ze środkowych Chin… 26.2
PNG New Britain Rabaul 26.0
Pakistański Brahui 25.2
Australia Ind. Groote E… 24.0
Indie Nowe Delhi 23,5
Amerykańska Azjatka 23.0
Pakistan Baloch 22.2
Tajwan Thao 21.7
Chiny, Shandong, Linqu Co… 20.4
pakistański sindhi 19.6
Australia Ind. Przylądek Yor… 18.0
PNG Płaskowyż Karimui 17,9
Singapur Riau malajski 17.7
Tajwan Siraya 17.6
Chiny Pekin 16.4
Pakistański Patan 16.3
Chiny Mongolia Wewnętrzna 16.2
Samoa Amerykańskie 16.0
Hiszpania Baskijska dolina Arratia… 16.0
Chiny Qinghai Hui 15.9
Rosja Murmańsk Saomi 14.0
Singapur jawajski indonezyjski… 14.0
Nowa Kaledonia 13.1
Japonia Aichi 12.7
Georgia Svaneti Svans 12,5
Indie Północne Hindusi 12,5
Burusho z Pakistanu 12,5
Chiny Yunnan Han (2) 12.3
Indie Mumbai Marathów 12.3
China Harbin N. Koreański 12.1
Indie Andhra Pradesh Goll… 11.9
Tajwański Saisiat 11.8
Oman 11.4
Izraelscy Arabowie Druzowie 11.0
Korea Południowa (3) 10.8
Tajwan Tsou 10.8
Mongolia Khoton Tarialan 10.7
Sri Lanka Kolombo syngaleski… 10.4
Gruzja Tbilisi Kurdowie 10.0
Mongolia Khalkha 10.0
Australia Ind. Kimberly 9.7
Indie Północne Delhi 9.4
Japonia Hyogo 9.4
Hiszpania Północne Cabuernigo 8.9
Arabia Saudyjska 8.7
Rosja Tuwa (2) 8.7
Hiszpania Północno-Kantabryjski 8.4
Japonia Środkowa 8.2
rumuński 8.2
Grecja Północna 8.0
Irlandia Północna 8.0
Tajwański Atayal 8.0
Jordan Amman 7.9
Włochy Północne (1) 7.7
Włochy Sardynia (3) 7.7
Australia Ind. Yuendumu 7.6
Mongolia Tsaatan 7.6
Amerykanie rasy kaukaskiej (3) 7.4
Bułgaria 7.3
Tajwan Taroko 7.3
Filipiny Ivatan 7.0
Amerykańska kaukaska Bethesda 7.0
Centrum Portugalii (2) 6.8
Australia Nowa Południowa Walia 6.7
Maroko 6.7
Stany Zjednoczone Hawaje Okinawa 6.7
Walia 6.6
Serbia 6.5
Gruzja Tbilisi Gruziński… 6.2
Irlandia Południowa 6.2
Algieria(1) 6.2
Brazylia 6.1
Hiszpania Basków Gipuzkoa Pro… 6.1
Turcja (2) 6.1
Rosja północno-zachodnia 6.0
Portugalia Południowa pop2 5.9
Anglia Newcastle 5.7
Włochy Północna Pawia 5.6
izraelscy Żydzi 5.4
Szwecja Sztokholm 5.1
Finlandia 5.0
Macedonia (4) 4.9
Włochy Bergamo 4.8
Maroko Berber Nador Meta… 4.8
Przedstawiono tylko częstości alleli
Częstotliwości HLA A*1102
Badana populacja
  Częstotliwość (W %)
Tajwański Saisiat 12.7
Tajwan Pazeh 10.9
Tajwan Ami 8.7
Tajwan Puyuma 7.0
Tajwan Siraya 6.9
Chiny Guangxi Maonan 6.5
Tajwański Atayal 5.2
Filipiny Ivatan 5.0
Ch. Guangdong Meizhou Han 4.6
Tajwan Hakka 4.5
chiński z Hongkongu 4.0
Tajwan Minnan (1) 3.9
Tajlandia 3.5
Singapurski Chińczyk 3.0
Tajwan Tao 3.0
Tajwan Tsou 2.9
Chiny Pekin Shijiazhuan… 2.0
Włochy Północne pop 1 1.9
Tajwan Taroko 1.8
Chiny Mongolia Wewnętrzna 1.0
Parsowie na zachodnim wybrzeżu Indii 1.0
Tajwan Bunun 1.0
Chiny Qinghai Hui 0,9
Chiny Yunnan Lisu 0,6
Japonia (3) 0,2
Przedstawiono tylko częstości alleli
Częstotliwości HLA A*1103
Badana populacja
  Częstotliwość (W %)
Chiny Yunnan Lisu 5.1
Chiny Yunnan Nu 3.8
Chiny Pekin Shijiazhuan… 0,2
Przedstawiono tylko częstości alleli
Częstotliwości HLA A*1104
Badana populacja
  Częstotliwość (W %)
Georgia Svaneti Svans 1.3
Singapur Riau malajski 1.2
Samoa Amerykańskie 1.0
Indie Północne Hindusi 1.0
Izrael aszkenazyjscy i nie… 0,4
Chiny Pekin Shijiazhuan… 0,2
Przedstawiono tylko częstości alleli

Stowarzyszenia chorobowe

A*1104 wiąże się ze zwiększonym ryzykiem nowotworu szyjki macicy w wyniku zakażenia wirusem brodawczaka ludzkiego

haplotypy A11-B

A11-B13

  • A11-Cw2-B13 (Li)
  • A11-Cw9-B13 (południowe Chiny i południowo-wschodnia Azja)
  • A11-C10-B13 Kupuj
  • A11-CBL-B13 Północne Chiny