HLA-A3
| HLA-A3 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ( MHC klasy I , antygen powierzchniowy komórki ) | ||||||||||
 HLA-A3
| ||||||||||
| Około | ||||||||||
| Białko | receptor / ligand transbłonowy | |||||||||
| Struktura | heterodimer αβ | |||||||||
| podjednostki | HLA-A *03--, β2 - mikroglobulina | |||||||||
| Starsze nazwy | HL-A3 | |||||||||
| Podtypy | ||||||||||
| ||||||||||
| Rzadkie allele | ||||||||||
| ||||||||||
| Łączenie alleli z bazą danych IMGT/HLA w EBI | ||||||||||
HLA-A3 (A3) to ludzki serotyp antygenu leukocytarnego należący do grupy serotypów HLA-A . Serotyp jest określany przez rozpoznawanie przez przeciwciało podzbioru α3 łańcuchów α HLA-A. W przypadku A3 łańcuch alfa, „A” jest kodowany przez grupę alleli HLA-A *03 , a łańcuch β jest kodowany przez locus B2M . Ta grupa jest obecnie zdominowana przez A*03:01. A3 i A *03 są prawie synonimami w znaczeniu. A3 jest bardziej powszechny w Europie, jest częścią najdłużej znanego haplotypu wielogenowego , A3~B7~DR15~DQ6.
Serotyp
| A*03 | A3 | Próbka |
| allel | % | rozmiar (N) |
| *03:01 | 99 | 3504 |
| *03:02 | 78 | 342 |
| *03:05 | 20 | 5 |
A3 składa się głównie z A*03:01 i *03:02, które serotypują dobrze z przeciwciałami anty-A3. Istnieje 26 niesynonimicznych wariantów A*03, 4 zerowe i 22 warianty białkowe.
Choroby towarzyszące
Serotyp A3 jest wtórnym czynnikiem ryzyka miastenii i niższych poziomów CD8 + u pacjentów z hemochromatozą . Locus HFE (hemochromatoza) leży między A3 a B7 w superhaplotypie A3 ~ DQ6.
W HIV
HLA-A3 selekcjonuje ewolucję HIV pod kątem mutacji epitopu Gag KK9 i powoduje szybki spadek odpowiedzi limfocytów T CD8. Komórki T CD8 są odpowiedzialne za szybkie zabijanie zakażonych wirusem HIV komórek CD4+. Ten typ wyewoluowanej odpowiedzi może nie być specyficzny dla HLA-A3, a ponieważ wirus HIV jest zdolny do szybkiego przystosowania się in situ do czynników selektywnych.
Allele
| Badana populacja |
Częstotliwość (W %) |
|---|---|
| Finlandia | 25.0 |
| Indie Tamil Nadu Nadar | 20,5 |
| Republika Czeska | 18.9 |
| Belgia | 17.1 |
| Irlandia Północna | 14.3 |
| Australia Nowa Południowa Walia | 13.8 |
| Georgia Svaneti Svans | 13.8 |
| Gruzja Tbilisi Gruziński… | 13.8 |
| Burusho z Pakistanu | 13.0 |
| Północno-zachodnie Wyspy Zielonego Przylądka… | 12.0 |
| Irlandia Południowa | 11.6 |
| rumuński | 11.6 |
| Chorwacja | 11.0 |
| Amerykanie rasy kaukaskiej (3) | 10.8 |
| Włochy Północne (1) | 9.7 |
| Afroamerykanie z USA (2) | 9.4 |
| Indie Mumbai Marathów | 9.3 |
| Indie Zachodnie Bhils | 9.0 |
| Centrum Portugalii | 9.0 |
| Pakistański Patan | 8.7 |
| Kamerun Beti | 8.6 |
| Kamerun Bamileke | 7.8 |
| Pakistański Kałasz | 7,5 |
| Arabia Saudyjska Gurajat i… | 7,5 |
| Amerykanin latynoski | 7.3 |
| Indie Północne Delhi | 7.2 |
| Madera | 7.0 |
| Rosja Tuwa (2) | 6.9 |
| Tunezja | 6.7 |
| Rdzenni mieszkańcy Ameryki Północnej… | 6.7 |
| Republika Zielonego Przylądka południowo-wschodnia I… | 6.5 |
| Azory Santa Maria i Sa… | 6.4 |
| Pakistan Baloch | 6.3 |
| Gwinea Bissau | 6.2 |
| Izraelscy Arabowie Druzowie | 6.0 |
| Południowoafrykański Natal Zulus | 6.0 |
| Latynosi z południowego Teksasu w USA | 6.0 |
| Indie Północne Hindusi | 5.8 |
| Zambia Lusaka | 5.8 |
| Iran Baloch | 5.6 |
| Uganda Kampala | 5.5 |
| Jordan Amman | 5.2 |
| Kenia | 5.2 |
| Brazylia | 5.1 |
| Oman | 5.1 |
| Kameruński Pigmej Baka | 5.0 |
| Gruzja Tbilisi Kurdowie | 5.0 |
| sudański | 4.8 |
| Bułgaria | 4.6 |
| Pakistański Brahui | 4.6 |
| Chiny Pekin | 4.5 |
| Australia Ind. Przylądek Yor… | 4.4 |
| Chiny Mongolia Wewnętrzna | 4.4 |
| Mali Bandiagara | 4.4 |
| pakistański sindhi | 4.4 |
| Chiny Qinghai Hui | 4.1 |
| Zimbabwe Harare Shona | 4.0 |
| Kamerun Sawa | 3.8 |
| Senegal Niokholo Mandenka | 3.8 |
| Kenia Luo | 3.6 |
| Maroko Nador Metalsa Cla… | 3.4 |
| Kenia Nandi | 3.1 |
| Meksyk. Guadalajara Mestizos… | 3.1 |
| Chiny Kanton | 2.9 |
| Chiny Północne Han | 2.9 |
| Mongolia Buriat | 2.9 |
| Chińscy Tybetańczycy | 2.5 |
| Chiny Yunnan Nu | 2.5 |
| meksykańscy metysi | 2.4 |
| Samoa Amerykańskie | 2.0 |
| Singapur jawajski indonezyjski… | 2.0 |
| Przedstawiono tylko częstości alleli | |
| Badana populacja |
Częstotliwość (W %) |
|---|---|
| Gruzja Tbilisi Kurdowie | 8.3 |
| Maroko Nador Metalsa Cla… | 4.1 |
| Pakistan Karaczi Parsowie | 2.8 |
| Izraelscy Arabowie Druzowie | 2.5 |
| Indie Nowe Delhi | 2.3 |
| sudański | 2.3 |
| Indie Północne Delhi | 2.2 |
| Parsowie Zachodniego Wybrzeża Indii | 2.0 |
| Centrum Portugalii | 2.0 |
| Indie Andhra Pradesh Goll… | 1.7 |
| Pakistański Kałasz | 1.7 |
| Pakistan Baloch | 1.6 |
| Gruzja Tbilisi Gruziński… | 1.4 |
| Arabia Saudyjska Gurajat i… | 1.4 |
| Oman | 1.3 |
| pakistański sindhi | 1.3 |
| Indie Północne Hindusi | 1.0 |
| Pakistański Patan | 1.0 |
| Republika Południowej Afryki Natal Tamil | 1.0 |
| Latynosi z południowego Teksasu w USA | 0,8 |
| Przedstawiono tylko częstości alleli | |
Choroby towarzyszące
A*03:01 moduluje zwiększone ryzyko stwardnienia rozsianego
Haplotypy A3~B
A3-B7 jest częścią superhaplotypu A3~DQ2 A3-B8 (Rumunia, svanS) A3~B35 (Bułgaria, Chorwacja, wschodnie Morze Czarne) A3~B55 (wschodnie Morze Czarne)
A3~Cw7~B7
A3 ~ B7 ma częstotliwość bimodalną w Europie z jednym węzłem w Irlandii, a drugim w Szwajcarii, relatywnie rzecz biorąc, Szwajcaria wydaje się być wyższa. A3~Cw7~B7 jest jednym z najczęstszych haplotypów wielogenowych w świecie zachodnim, szczególnie w Europie Środkowej i Wschodniej.
A *03:01 ~ C *07:02 ~ B *07:02 ~ DRB1 *15:01 ~ DQA1 *01:02 ~ DQB1 *06:02