Halorubraceae

Halorubraceae
Klasyfikacja naukowa
Domena:
Gromada:
Klasa:
Zamówienie:
Rodzina:
Halorubraceae

Gupta i in. 2016
Rodzaje

Halorubraceae to rodzina halofilnych , chemoorganotroficznych lub heterotroficznych archeonów z rzędu Haloferacales . Typowym rodzajem tej rodziny jest Halorubrum . Jego właściwości biochemiczne są takie same jak rzędu Haloferacales .

Nazwa Halorubraceae pochodzi od łacińskiego terminu Halorubrum, odnoszącego się do rodzaju rodziny i przyrostka „-ceae”, końcówki używanej do określenia rodziny. Razem Halorubraceae odnosi się do rodziny, której typem nomenklaturowym jest rodzaj Halorubrum .

Obecna taksonomia i sygnatury molekularne

Od 2021 roku Halorubraceae zawiera dziewięć ważnie opublikowanych rodzajów. Tę rodzinę można odróżnić od innych halobakterii dzięki obecności czterech konserwatywnych białek sygnaturowych (CSP).

Filogeneza

Obecnie akceptowana taksonomia oparta jest na Liście nazw prokariotycznych ze stałą nomenklaturą (LPSN) i National Center for Biotechnology Information (NCBI).

LTP na bazie 16S rRNA _01_2022 53 białka markerowe oparte na GTDB 07-RS207
Haloferakale

Halobaculum *

Salinigranum Cui & Zhang 2014 *

Halolamina *

Halohasta *

Halonotius *

Haloferax

Halopelagius

Halogeometricum

Halobellus (w tym Haloquadratum )

Halobium *

Halegenticoccus

Haloprofundus

Halogranum

Haloplanus

Halalkaliarchaeum *

Halopenitus *

Haloparvum

Halorubrum *

Haloferakale

Haloferacaceae

Halorubraceae

Halobaculum Oren i in. 1995

Halolamina Cui i in. 2011

Halalkalirubrum Zuo i in. 2021

Halohasta Mou i in. 2013

Halonotius Burns i in. 2010

Halalkaliarchaeum Sorokin i in. 2019

Halopenitus Amoozegar i in. 2012

Haloparvum Chen i in. 2016

Halorubrum McGenity & Grant 1996

Uwaga: * Halorubraceae

Zobacz też

  1. ^ ab Gupta, Radhey   S.; Naushad, Sohail; Fabros, Reena; Adeolu, Mobolaji (2016-02-02). „Filogenomiczna ponowna ocena podziałów na poziomie rodziny w klasie Halobacteria: propozycja podziału rzędu Halobacteriales na rodziny Halobacteriaceae, Haloarculaceae fam. Nov. I Halococcaceae fam. Nov. Oraz rząd Haloferacales na rodziny Haloferacaceae i Halorubraceae fam lis" . Antoniego van Leeuwenhoeka . 109 (4): 565–587. doi : 10.1007/s10482-016-0660-2 . ISSN 0003-6072 .    PMID 26837779 . S2CID 10437481 .
  2. ^   Grant, William D.; Kamekura, Masahiro; McGenity, Terry J.; Ventosa, Antonio (2015-09-14). „Klasa halobakterii. lis” . Bergey's Manual of Systematic of Archaea and Bacteria : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 . ISBN 9781118960608 .
  3. ^    Oren, Aaron (2012-02-01). „Taksonomia rodziny Halobacteriaceae: paradygmat zmiany koncepcji w systematyce prokariotów” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 . PMID 22155757 .
  4. ^ a b „Rodzina: Halorubraceae” . lpsn.dsmz.de . Źródło 2021-06-27 .
  5. Bibliografia _ „Halorubraceae” . Lista nazw prokariotycznych ze stałą nomenklaturą (LPSN) . Źródło 2021-11-17 .
  6. Bibliografia _ i in. „Halorubraceae” . Baza danych taksonomii Narodowego Centrum Informacji Biotechnologicznej (NCBI) . Źródło 2022-06-05 .
  7. Bibliografia _ _ Źródło 23 lutego 2022 r .
  8. ^ "LTP_all drzewo w formacie newick" . Źródło 23 lutego 2022 r .
  9. ^ „LTP_01_2022 Informacje o wydaniu” (PDF) . Źródło 23 lutego 2022 r .
  10. ^ „Wydanie GTDB 07-RS207” . Baza danych taksonomii genomu . Źródło 20 czerwca 2022 r .
  11. Bibliografia _ _ Baza danych taksonomii genomu . Źródło 20 czerwca 2022 r .
  12. ^ „Historia taksonów” . Baza danych taksonomii genomu . Źródło 20 czerwca 2022 r .