Morganellaceae
Morganellaceae | |
---|---|
Providencia alcalifaciens | |
Klasyfikacja naukowa | |
Domena: | |
Gromada: | |
Klasa: | |
Zamówienie: | |
Rodzina: |
Morganellaceae
Adeolu i in., 2016
|
Rodzaje | |
|
Morganellaceae to rodzina bakterii Gram-ujemnych , która obejmuje niektóre ważne ludzkie patogeny, wcześniej sklasyfikowane jako Enterobacteriaceae . Ta rodzina jest członkiem rzędu Enterobacterales w klasie Gammaproteobacteria typu Pseudomonadota . Rodzaje z tej rodziny obejmują rodzaj typu Morganella , wraz z Arsenophonus , Cosenzaea, Moellerella, Photorhabdus , Proteus , Providencia i Xenorhabdus .
Nazwa Morganellaceae pochodzi od łacińskiego terminu Morganella , odnoszącego się do rodzaju rodziny i przyrostka „-aceae”, końcówki używanej do określenia rodziny. Razem Morganellaceae odnosi się do rodziny, której typem nomenklaturowym jest rodzaj Morganella .
Patogeny człowieka
Szereg gatunków bakterii Morganellaceae to oportunistyczne patogeny człowieka, w tym Proteus , Providencia i czasami Morganella w warunkach szpitalnych.
Odmieniec
Trzy gatunki Proteus , P. vulgaris , P. mirabilis i P. penneri , są oportunistycznymi patogenami człowieka , najczęściej powodującymi infekcje dróg moczowych . Proteus vulgaris jest powszechnie spotykany w jelitach różnych zwierząt i jest wydalany do obornika i gleby.
Około 10-15% kamieni nerkowych to kamienie struwitowe , powstałe w wyniku alkalizacji moczu w wyniku działania enzymu ureazy bakterii Proteus (i innych) gatunków.
Providencia
Providencia rettgeri jest częstą przyczyną biegunki podróżnych.
Patogeny owadów i symbionty
Wiele Morganellaceae ma bliskie relacje z owadami i innymi bezkręgowcami.
Arsenofon
Arsenophonus to endosymbiotyczne bakterie różnych owadów. U pasożytniczych os Nasonia Arsenophonus nasoniae działa jako manipulator reprodukcyjny, zabijając rozwijające się samce os. Sprzyja to zwiększonej częstotliwości występowania samic w populacji, które są jedyną płcią biologiczną, która przekazuje Arsenofonus następnemu pokoleniu. Ten rodzaj interakcji jest określany jako „ zabijanie mężczyzn lub zabijanie synów ”.
U much i wszy bakterie podobne do Arsenofonusa działają jako pierwotne symbionty wiernie przekazywane z pokolenia na pokolenie. W takich związkach główny endosymbiont zwykle uzupełnia metabolizm żywiciela, dostarczając niezbędnych witamin i składników odżywczych, których gospodarz nie jest w stanie sam zsyntetyzować.
Fotorhabdus i Ksenorhabdus
Photorhabdus i Xenorhabdus są bakteryjnymi towarzyszami owadobójczych nicieni . Te nicienie infekują owady i zwracają swoje Photorhabdus lub Xenorhabdus do krwi owadów (zwanej również hemolimfą ). Bakterie następnie tłumią odpowiedź immunologiczną owada, zwiększając sukces pasożyta nicienia. W wyniku tej wysoce skutecznej strategii ewolucyjnej nicienie owadobójcze są powszechnie stosowane jako biologiczne środki zwalczania szkodników owadzich, takich jak stonki kukurydziane .
Providencia
Providencia są powszechnymi gatunkami bakterii w mikrobiomie muszek owocowych Drosophila . U Drosophila melanogaster Providencia rettgeri jest powszechnym patogenem wyizolowanym z dzikich much. Układ odpornościowy muchy broni się przed tą infekcją za pomocą wysoce specyficznego peptydu przeciwbakteryjnego , który jest wymagany do obrony przed P. rettgeri , ale nie przed innymi gatunkami Providencia .
Charakterystyka biochemiczna i podpisy molekularne
Bakterie te są ujemne pod względem oksydazy i ujemne pod względem dekarboksylazy argininowej i testu Vogesa-Proskauera .
Siedem konserwatywnych indeli sygnaturowych (CSI) zidentyfikowano dla tej rodziny za pomocą analiz genomowych białek sukcynylotransferazy dihydrolipoamidu, dipeptydazy Xaa-Pro, dwufunkcyjnej hydrolazy cukrowej UDP (5'-nukleotydazy), czynnika sprzęgającego naprawę transkrypcji, acetylotransferazy fosforanowej, ligaza histydyna - tRNA i amidaza N-acetylomuramoilo-L-alaniny . Te sygnatury molekularne zapewniają nowatorski i niezawodny sposób odróżniania członków rodziny Morganellaceae od innych rodzin należących do rzędu Enterobacterales i wszystkie inne bakterie.
Systematyka historyczna i taksonomia bieżąca
Morganellaceae od 2021 r. Zawiera osiem ważnie opublikowanych rodzajów. Członkowie tej rodziny byli pierwotnie członkami rodziny Enterobacteriaceae , dużej niepowiązanej filogenetycznie grupy gatunków o odrębnych cechach biochemicznych i różnych niszach ekologicznych. Pierwotne przypisanie gatunków do rodziny Enterobacteriaceae było w dużej mierze oparte na analizach sekwencji genomu 16S rRNA, o którym wiadomo, że ma niską moc dyskryminacyjną, a którego wyniki zależą od zastosowanego algorytmu i informacji o organizmie. Mimo to analizy nadal wykazywały rozgałęzienia polifiletyczne, co wskazuje na obecność odrębnych podgrup w obrębie rodziny.
W 2016 roku Adeolu i in. zaproponowali podział Enterobacteriaceae na 7 nowych rodzin w oparciu o porównawcze analizy genomiczne i wzór rozgałęzień różnych drzew filogenetycznych zbudowanych z konserwatywnych sekwencji genomu, sekwencji 16S rRNA i analiz sekwencji multilocus. Markery molekularne, szczególnie zachowane indele sygnaturowe , charakterystyczne dla tej rodziny, zostały również zidentyfikowane jako dowód potwierdzający podział niezależny od drzew filogenetycznych.