PRPF4B

PRPF4B
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, PR4H, PRP4, PRP4H, PRP4K, dJ1013A10.1, czynnik przetwarzania pre-mRNA 4B
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Homolog kinazy serynowo-treoninowej PRP4 jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen PRPF4B .

Splicing pre-mRNA zachodzi w dwóch kolejnych etapach transestryfikacji i uważa się, że białko kodowane przez ten gen bierze udział w splicingu pre-mRNA i transdukcji sygnału. Białko to należy do rodziny kinaz, która obejmuje kinazy specyficzne dla białek bogatych w serynę/argininę i kinazy zależne od cyklin (CDK). Białko to jest uważane za kinazę podobną do CDK (Clk) wykazującą homologię do kinaz białkowych aktywowanych mitogenem (MAPK).

Interakcje

Wykazano, że PRPF4B oddziałuje z Pininem .

Dalsza lektura

•   Schultz SJ, Nigg EA (1994). „Identyfikacja 21 nowych ludzkich kinaz białkowych, w tym 3 członków rodziny spokrewnionej z regulatorem cyklu komórkowego nimA z Aspergillus nidulans”. Wzrost komórek różni się . 4 (10): 821–30. PMID 8274451 .
•    Gross T, Lützelberger M, Weigmann H, et al. (1997). „Analiza funkcjonalna rozszczepienia drożdżowej kinazy białkowej Prp4 zaangażowanej w splicing pre-mRNA i izolację domniemanego homologu ssaków” . Kwasy nukleinowe Res . 25 (5): 1028–35. doi : 10.1093/nar/25.5.1028 . PMC 146536 . PMID 9102632 .
•   Huang Y, Deng T, Winston BW (2000). „Charakterystyka aktywacji kinazy hPRP4: potencjalna rola w sygnalizacji”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 271 (2): 456–63. doi : 10.1006/bbrc.2000.2651 . PMID 10799319 .
•    Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR i in. (2002). „Oczyszczanie i charakteryzacja natywnych spliceosomów nadających się do trójwymiarowej analizy strukturalnej” . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
•    Dellaire G, Makarov EM, Cowger JJ i in. (2002). „Kinaza PRP4 ssaków współoczyszcza i wchodzi w interakcje ze składnikami kompleksów U5 snRNP i deacetylazy N-CoR” . Mol. Komórka. Biol . 22 (14): 5141–56. doi : 10.1128/MCB.22.14.5141-5156.2002 . PMC 139773 . PMID 12077342 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Brandenberger R, Wei H, Zhang S i in. (2005). „Charakterystyka transkryptomu wyjaśnia sieci sygnalizacyjne, które kontrolują wzrost i różnicowanie ludzkich komórek ES”. Nat. Biotechnologia . 22 (6): 707–16. doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197 . S2CID 27764390 .
•    Beausoleil SA, Jędrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). „Charakterystyka na dużą skalę fosfoprotein jądrowych komórek HeLa” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 101 (33): 12130-5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•    Bennett EM, Dźwignia AM, Allen JF (2004). „Ludzki wirus niedoboru odporności typu 2 Gag oddziałuje specyficznie z PRP4, kinazą serynowo-treoninową i hamuje fosforylację czynnika splicingowego SF2” . J. Wirol . 78 (20): 11303–12. doi : 10.1128/JVI.78.20.11303-11312.2004 . PMC 521795 . PMID 15452250 .
•    Rush J, Moritz A, Lee KA i in. (2005). „Profilowanie powinowactwa immunologicznego fosforylacji tyrozyny w komórkach nowotworowych”. Nat. Biotechnologia . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
•   Zhang Y, Wolf-Yadlin A, Ross PL i in. (2005). „Spektrometria mas z rozdzielczością czasową miejsc fosforylacji tyrozyny w sieci sygnalizacyjnej receptora naskórkowego czynnika wzrostu ujawnia moduły dynamiczne” . Mol. Komórka. Proteomika . 4 (9): 1240–50. doi : 10.1074/mcp.M500089-MCP200 . PMID 15951569 .
•    Stelzl U, Worm U, Lalowski M i in. (2005). „Sieć interakcji ludzkiego białka z białkiem: źródło opisywania proteomu”. komórka . 122 (6): 957–68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .
•    Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G i in. (2006). „Analiza fosfoproteomu ludzkiego wrzeciona mitotycznego” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 103 (14): 5391–6. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N . doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC 1459365 . PMID 16565220 .
•    Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA i in. (2006). „Oparte na prawdopodobieństwie podejście do wysokowydajnej analizy fosforylacji białek i lokalizacji miejsca”. Nat. Biotechnologia . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
•    Olsen JV, Blagoev B, Gnad F i in. (2006). „Globalna, in vivo i specyficzna dla miejsca dynamika fosforylacji w sieciach sygnalizacyjnych” . komórka . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
•    Ewing RM, Chu P, Elisma F i in. (2007). „Mapowanie na dużą skalę ludzkich interakcji białko-białko za pomocą spektrometrii mas” . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
•    Huang B, Ahn YT, McPherson L i in. (2007). „Interakcja PRP4 z czynnikiem Krüppel-Like 13 reguluje transkrypcję CCL5” . J. Immunol . 178 (11): 7081–7. doi : 10.4049/jimmunol.178.11.7081 . PMC 2674583 . PMID 17513757 .