Raoultella planticola
|
|
| Raoultella planticola | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
R. planticola
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Raoultella planticola Bagley i in. 1982
|
|
| Synonimy | |
|
Klebsiella planticola , Klebsiella trevisanii |
|
Raoultella planticola jest Gram-ujemną bakterią z rodzaju Raoultella . R. planticola ma dość podobny wygląd do Klebsiella pneumoniae i musi być identyfikowany na podstawie zwyczajów wzrostu lub analizy DNA. Zidentyfikowano wiele szczepów. R. planticola skomplikowała co najmniej jeden przypadek ciężkiego zapalenia trzustki .
Szczepy
Stwierdzono szczep Raoultella planticola, Cd-1, który rośnie beztlenowo przy wysokich stężeniach kadmu w wodzie i wytrąca nierozpuszczalny siarczek kadmu . Szczep ten został wyizolowany z redukujących osadów słonych bagien i może być przydatny w bioremediacji kadmu z odsłoniętych gleb.
Reklasyfikacja taksonomiczna
Raoultella planticola była wcześniej klasyfikowana jako część rodzaju Klebsiella . Został przeklasyfikowany wraz z kilkoma innymi Klebsiella w 2001 roku.
Modyfikacja genetyczna
Pod koniec lat 80-tych R. planticola została genetycznie zmodyfikowana przez wstawienie plazmidu z Zymomonas mobilis . Plazmid ten koduje enzym dekarboksylazę pirogronianową , który wraz z dehydrogenazą alkoholową już obecną w bakteriach umożliwia produkcję etanolu . Bakteria już wytwarza etanol podczas metabolizowania heksoz i pentoz, ale bardzo nieefektywnie. R. planticola został wybrany do otrzymania tego genu, ponieważ miał już szlaki metaboliczne do rozkładu cukrów pentozowych, takich jak ksyloza, która jest głównym składnikiem pozostałości rolniczych i leśnych. Wyniki pokazały, że genetycznie zmodyfikowany szczep może wytwarzać etanol, ale ginie przy stężeniu etanolu większym niż 5%. Zmodyfikowany szczep wytwarzał również więcej etanolu przy niższym pH (5,4), a produkcja etanolu zmniejszała się wraz ze wzrostem pH.
Na początku lat 90. firma biotechnologiczna postanowiła rozwiązać problem: jak bezpiecznie niszczyć resztki pożniwne. Niektóre pozostałości po uprawach są siedliskiem patogenów roślin. Sporadycznie stosuje się spalanie w celu zniszczenia pozostałości i patogenów, ale stwarza to zagrożenie pożarowe i może być niebezpieczne dla środowiska. Firma ta zdała sobie sprawę, że ponieważ R. planticola jest agresywną i występującą powszechnie bakterią glebową, można ją zmodyfikować genetycznie w celu zniszczenia resztek pożniwnych, a także wytworzenia etanolu .
Testowanie tego procesu było pierwotnie ograniczone do sterylnej gleby. doktorat badania przeprowadzone na Oregon State University , nadzorowane przez Elaine Ingham , pozwoliły uzyskać próbkę genetycznie zmodyfikowanego organizmu do oceny skutków ekologicznych przez niemiecki Institut für Biotechnologie i testując go w niesterylnej (zwykłej) glebie, stwierdzono, że zmodyfikowane bakterie spowodowały małe ilości alkoholu w glebie. Chociaż poziom ten jest kilkaset razy niższy niż wymagany do wpłynięcia na wzrost roślin, fakt ten w połączeniu z faktem, że R. planticola już rośnie w systemach korzeniowych wszystkich rodzajów roślin na całym świecie, wywołała mit zagłady.
Błędne twierdzenia dotyczące GMO
Dr Ingham stwierdził przed Komisją Nowozelandzką, że „prawdopodobnym skutkiem zezwolenia na próbę terenową [z genetycznie zmodyfikowaną bakterią, o której mowa] byłoby zniszczenie roślin lądowych”. Sugestia Inghama o możliwości „śmierci roślin na całym świecie” przyciągnęła uwagę społeczności naukowej. Jednak nie byli w stanie znaleźć żadnych dowodów na to, że twierdzenia te zostały przedłożone do publikacji naukowej w recenzowanym czasopiśmie i nie znaleziono żadnych dowodów wskazujących, że amerykańska Agencja Ochrony Środowiska lub Departament Rolnictwa Stanów Zjednoczonych dokonały przeglądu lub zatwierdziły jakiekolwiek badania dotyczące SDF20. Ponadto stwierdzono, że SDF20 wytworzył 20 mikrogramów na mililitr alkoholu w glebie, czyli kilkaset razy mniej niż wymagane do wpłynięcia na wzrost roślin.
Elaine Ingham publicznie przeprosiła za składanie fałszywych twierdzeń o ekologicznym wpływie GMO.
Partia Zielonych Nowej Zelandii publicznie przeprosiła za wprowadzające w błąd oświadczenia i przyznała, że cytowane badania nigdy nie zostały opublikowane.
W odcinku „ The Pyramid at the End of the World ” programu telewizyjnego BBC Doctor Who , Doktor powstrzymuje genetycznie zmodyfikowany szczep R. planticola przed spowodowaniem wymierania roślin i zwierząt na całym świecie, podobnie do scenariusza, który mają niektórzy naukowcy spekulowano o.
Dalsza lektura
- Westbrook GL, O'Hara CM, Roman SB, Miller JM (kwiecień 2000). „Występowanie i identyfikacja Klebsiella planticola w izolatach klinicznych ze szczególnym uwzględnieniem noworodków” . J. Clin. Mikrobiol . 38 (4): 1495–7. doi : 10.1128/JCM.38.4.1495-1497.2000 . PMC86473 . _ PMID 10747132 .
- Podschun R, Acktun H, Okpara J, Linderkamp O, Ullmann U, Borneff-Lipp M (sierpień 1998). „Izolacja Klebsiella planticola od noworodków na oddziale noworodkowym” . J. Clin. Mikrobiol . 36 (8): 2331–2. doi : 10.1128/JCM.36.8.2331-2332.1998 . PMC 105041 . PMID 9666015 .
- Klebsiella planticola
- Monnet D, Freney J (kwiecień 1994). „Metoda różnicowania Klebsiella planticola i Klebsiella terrigena od innych gatunków Klebsiella ” . J. Clin. Mikrobiol . 32 (4): 1121–2. doi : 10.1128/JCM.32.4.1121-1122.1994 . PMC 267203 . PMID 8027329 .
- Kanki M, Yoda T, Tsukamoto T, Shibata T (lipiec 2002). „ Klebsiella pneumoniae nie wytwarza histaminy: szczepy Raoultella planticola i Raoultella ornithinolytica są producentami histaminy” . Aplikacja Otaczać. Mikrobiol . 68 (7): 3462–6. Bibcode : 2002ApEnM..68.3462K . doi : 10.1128/AEM.68.7.3462-3466.2002 . PMC 126807 . PMID 12089029 .