Sirtuina 3
SIRT3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, SIR2L3, sirtuin 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Zależna od NAD deacetylaza sirtuina-3, mitochondrialna, znana również jako SIRT3 , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SIRT3 [sirtuina (homolog regulacji informacji typu cichego krycia 2) 3 (S. cerevisiae)]. SIRT3 należy do rodziny białek sirtuin ssaków, które są homologami drożdżowego białka Sir2. SIRT3 wykazuje aktywność deacetylazy zależną od NAD+ .
Członkowie rodziny sirtuin charakteryzują się rdzeniową domeną sirtuiny i są zgrupowani w czterech klasach, a białko kodowane przez ten gen zalicza się do klasy I rodziny sirtuin. Ludzkie sirtuiny pełnią szereg funkcji molekularnych i stały się ważnymi białkami w procesach starzenia, odporności na stres i regulacji metabolicznej. Wiadomo, że białka sirtuiny drożdży regulują epigenetyczne wyciszanie genów i hamują rekombinację rDNA . Oprócz deacetylacji białek, badania wykazały, że ludzkie sirtuiny mogą również działać jako wewnątrzkomórkowe białka regulatorowe z rybozylotransferazą mono ADP działalność.
Struktura
SIRT3 jest rozpuszczalnym białkiem znajdującym się w macierzy mitochondrialnej i zawiera peptyd przetwarzający mitochondria na N-końcu . Zestaw struktur krystalicznych ludzkiego SIRT3 został rozwiązany, w tym apostruktura bez substratu , struktura z peptydem zawierającym acetylolizynę jej naturalnego substratu syntetazy acetylo-CoA 2 , struktura pośrednia reakcji uwięziona przez peptyd tioacetylowy i struktura z detioacetylowanym wiązaniem peptydowym. Struktury te pokazują konformację zmiany wywołane przez dwa substraty wymagane do reakcji, acetylowany peptyd będący substratem i NAD + . Ponadto badanie wiązania za pomocą izotermicznej kalorymetrii miareczkowej sugeruje, że acetylowany peptyd jest pierwszym substratem wiążącym się z SIRT3, przed NAD + .
Funkcjonować
mitochondrialne
Trzy sirtuiny, SIRT3, SIRT4 i SIRT5 , znajdują się w mitochondriach i biorą udział w regulacji procesów metabolicznych. Endogenny SIRT3 jest rozpuszczalnym białkiem zlokalizowanym w macierzy mitochondrialnej. Nadekspresja SIRT3 w hodowanych komórkach zwiększa oddychanie i zmniejsza wytwarzanie reaktywnych form tlenu. Post zwiększa SIRT3 w białej i brązowej tkance tłuszczowej (odpowiednio WAT i BAT) oraz nadekspresję SIRT3 w brązowych adipocytach HIB1B zwiększa ekspresję PGC-1α i UCP1 , co sugeruje rolę SIRT3 w adaptacyjnej termogenezie BAT. BAT różni się od WAT, ponieważ zawiera dużą liczbę mitochondriów i jest ważny dla termogenezy u gryzoni. W termogenezie w BAT pośredniczy białko rozprzęgające 1 (UCP1), które indukuje wyciek protonów i tym samym wytwarza ciepło zamiast ATP. mechanistycznego wglądu w to, jak SIRT3 wpływa na termogenezę w BAT i nie wiadomo, czy SIRT3 bezpośrednio wpływa na aktywność UCP1.
Oprócz kontrolowania metabolizmu na poziomie transkrypcyjnym, sirtuiny kontrolują również bezpośrednio aktywność enzymów metabolicznych. W Salmonella enterica bakteryjna sirtuina CobB reguluje aktywność enzymu syntetazy acetylo-koenzymu A ( acetylo-CoA ) . Jak wspomniano powyżej, ortologi syntetazy acetylo-CoA występują u ssaków w cytoplazmie (AceCS1) i mitochondriach (AceCS2). Obecność deacetylazy sirtuiny SIRT3 w macierzy mitochondrialnej sugeruje istnienie białek mitochondrialnych acetylowanych lizyną. Rzeczywiście, SIRT3 deacetyluje i aktywuje ssaczą mitochondrialną syntetazę acetylo-coA (AceCS2). Ponadto stwierdzono, że SIRT3 i AceCS2 są ze sobą skompleksowane, co sugeruje krytyczną rolę SIRT3 w kontrolowaniu aktywności AceCS2.
Aktywacja enzymu NMNAT2 , który katalizuje istotny etap w szlaku biosyntezy dinukleotydu nikotynoamidoadeninowego (NAD+) przez SIRT3, może być sposobem na hamowanie degeneracji i dysfunkcji aksonów.
Jądrowy
Oprócz zgłoszonej funkcji mitochondrialnej, niektórzy badacze zaproponowali istnienie bardzo małej puli aktywnego jądrowego SIRT3. Podaje się, że ta pula składa się z długiej formy SIRT3 i sugeruje się, że ma ona deacetylazy histonowej . Obserwacja, że SIRT3 ma aktywność jądrową, pochodzi z raportu, że SIRT3 chroni kardiomiocyty przed śmiercią komórek za pośrednictwem stresu i że efekt ten był spowodowany deacetylacją czynnika jądrowego, Ku-70 .
Znaczenie kliniczne
Starzenie się
Istnieje silny związek między allelami SIRT3 a długowiecznością u mężczyzn.
Aktywacja SIRT3 hamuje apoptozę prowadzącą do związanego z wiekiem zwyrodnienia plamki żółtej . SIRT3 indukował mitofagię , hamując śmierć komórki , dzięki czemu może być stosowany w leczeniu chorób neurodegeneracyjnych .
rakotwórczość
Istnieje znaczna ilość opublikowanej literatury sugerującej silny mechanistyczny związek między funkcją mitochondriów , starzeniem się i karcynogenezą. SIRT3 hamuje nowotwory zależne od glikolizy , ale promuje nowotwory zależne od fosforylacji oksydacyjnej .
Sirt3 działa jako mitochondrialne białko supresorowe nowotworów . Chociaż niektóre dowody przypisują aktywność SIRT3 w omijaniu zatrzymania wzrostu w komórkach raka pęcherza moczowego poprzez regulację p53 w mitochondriach. Uszkodzona i nieprawidłowa funkcja mitochondriów, podobnie jak mutacje genów, może być wczesnym zdarzeniem, które ostatecznie prowadzi do rozwoju nowotworów. Myszy genetycznie zmienione w celu usunięcia Sirt3 rozwijają guzy sutka z dodatnim receptorem estrogenu i progesteronu (ER / PR). W próbkach guza od kobiet z rakiem piersi ekspresja SIRT3 była zmniejszona w porównaniu z normalnymi tkankami piersi. Tak więc Sirt3 nokautowy może być wykorzystany do zbadania rozwoju nowotworu sutka ER/PR-dodatniego.
Dalsza lektura
- Bellizzi D, Dato S, Cavalcante P, Covello G, Di Cianni F, Passarino G, Rose G, De Benedictis G (2007). „Charakterystyka dwukierunkowego promotora wspólnego między dwoma ludzkimi genami związanymi ze starzeniem: SIRT3 i PSMD13” . Genomika . 89 (1): 143–50. doi : 10.1016/j.ygeno.2006.09.004 . PMID 17059877 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „W kierunku mapy w skali proteomu sieci interakcji białko-białko człowieka”. Natura . 437 (7062): 1173–78. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Yang YH, Chen YH, Zhang CY, Nimmakayalu MA, Ward DC, Weissman S (2001). „Klonowanie i charakterystyka dwóch mysich genów z homologią do drożdżowego genu Sir2”. Genomika . 69 (3): 355–69. doi : 10.1006/geno.2000.6360 . PMID 11056054 .
- Frye RA (2000). „Klasyfikacja filogenetyczna prokariotycznych i eukariotycznych białek podobnych do Sir2”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 273 (2): 793–98. doi : 10.1006/bbrc.2000.3000 . PMID 10873683 .
- Frye RA (1999). „Charakterystyka pięciu ludzkich cDNA z homologią do drożdżowego genu SIR2: białka podobne do Sir2 (sirtuiny) metabolizują NAD i mogą wykazywać aktywność białkową ADP-rybozylotransferazy”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 260 (1): 273–79. doi : 10.1006/bbrc.1999.0897 . PMID 10381378 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrywanie genów” . Genom Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .