EFI6
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EIF6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , CAB, EIF3A, ITGB4BP, b(2)gcn, eIF-6, p27(BBP), p27BBP, eukariotyczny czynnik inicjacji translacji 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| identyfikatorów zewnętrznych | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Eukariotyczny czynnik inicjacji translacji 6 ( EIF6 ), znany również jako białko wiążące integrynę beta 4 ( ITGB4BP ), jest ludzkim genem .
Półdesmosomy to struktury łączące blaszkę podstawną z cytoszkieletem włókna pośredniego . Ważnym funkcjonalnym składnikiem półdesmosomów jest podjednostka beta-4 integryny ( ITGB4 ), białko zawierające dwie domeny fibronektyny typu III. Białko kodowane przez ten gen wiąże się z domenami fibronektyny typu III ITGB4 i może pomóc połączyć ITGB4 z cytoszkieletem włókna pośredniego. Kodowane białko, które jest nierozpuszczalne i znajduje się zarówno w jądrze , jak iw cytoplazmie , może działać jako czynnik inicjujący translację i katalizuje asocjację podjednostek rybosomu 40S i 60S wraz z eIF5 związanym z GTP. Dla tego genu znaleziono wiele wariantów transkryptu kodujących kilka różnych izoform .
EIF6 odgrywa ważną rolę w tworzeniu rybosomów eukariotycznych 80S, wzroście komórek i ekspresji genów. Rybosom 80S, który może rozdzielać się na podjednostki 40S i 60S. EIF6 pomaga chronić dojrzałą podjednostkę 60s, a następnie EIF6 powinien oddzielić się od podjednostki 60s, aby mógł związać się z podjednostką 40s, tworząc rybosom. Utrzymanie równowagi EIF6 jest niezbędne dla organizmu: kilka EIF6 pomaga w syntezie normalnego rybosomu, podczas gdy duża ilość hamowanych przez EIF6 podjednostek 60s wiąże się z podjednostkami 40s.
Funkcjonować
EIF6 występuje zarówno w jąderku, jak iw cytoplazmie. W jąderku eukariotycznym kompleks przedrybosomalny 90S rozdziela się na kompleks przedrybosomalny 60S i kompleks przedrybosomalny 40S, które biorą udział w syntezie dojrzałych rybosomów. EIF6 jest niezbędny w biogenezie podjednostki 60S, a delecja EIF6 ma skutek śmiertelny. Częściowa delecja eIF6 skutkuje zmniejszeniem wolnej podjednostki 60S rybosomu, co oznacza wytrącenie z równowagi proporcji podjednostek 40S/60S i ograniczenie szybkości syntezy białek. Kompleks pre-rybosomalny 60S związany z eIF6 przenosi się z jąderka do cytoplazmy, a następnie eIF6 odłącza się od pre-60S, tak że podjednostka 60S może wiązać się z podjednostką 40S i kontynuuje dalszy postęp. EIF6 może działać jako czynnik inicjacji translacji ograniczający szybkość, a jego poziomy ekspresji wpływają na szybkość translacji. Niewiele z eIF6 będzie przyspieszać translację białek, podczas gdy duże z eIF6 będą blokować proces translacji poprzez hamowanie produkcji rybosomów. Aktywność eIF6 powoduje również glikolizę i syntezę kwasów tłuszczowych poprzez kontrolę translacji mRNA.
Struktura
eIF6 ma długość 245 aminokwasów .
Wyrażenie
EIF6 ma różny poziom ekspresji w różnych tkankach i komórkach. EIF6 ma wysoki poziom ekspresji w komórkach macierzystych i komórkach cyklicznych, podczas gdy nie ma go w komórkach postmitotycznych; wysoki poziom w mózgu i nabłonku, podczas gdy niski poziom w mięśniach.
Interakcje
Wykazano, że EIF6 oddziałuje z FHL2 , ITGB4 i GNB2L1 .
EIF6 odgrywa ważną rolę w tworzeniu rybosomów 80S, wzroście komórek i ekspresji genów.
Ewolucja
eIF6 występuje zarówno u drożdży, jak i u ludzi, a jego sekwencja aminokwasowa jest w 77% identyczna między nimi. Nie są znane żadne duplikacje eIF6 ani nawet konserwatywne motywy w białku.
Historia
Aktywność eIF6 została po raz pierwszy opisana w pracy na początku lat 80. XX wieku w laboratoriach Lindy L. Spremulli i Umadasa Maitry. Gen został ostatecznie sklonowany przez grupy Maitry i Gene Carlo Marchisio, które opublikowały swoje prace w 1997 roku.
Zobacz też
Dalsza lektura
- Biffo S, Sanvito F, Costa S, Preve L, Pignatelli R, Spinardi L, Marchisio PC (listopad 1997). „Izolacja nowego białka wiążącego integrynę beta4 (p27 (BBP)) silnie wyrażanego w komórkach nabłonka” . Journal of Biological Chemistry . 272 (48): 30314–21. doi : 10.1074/jbc.272.48.30314 . PMID 9374518 .
- Si K, Chaudhuri J, Chevesich J, Maitra U (grudzień 1997). „Klonowanie molekularne i funkcjonalna ekspresja ludzkiego cDNA kodującego czynnik inicjacji translacji 6” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (26): 14285–90. Bibcode : 1997PNAS...9414285S . doi : 10.1073/pnas.94.26.14285 . PMC24943 . _ PMID 9405604 .
- Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (lipiec 1998). „Identyfikacja genów eksprymowanych w ludzkich krwiotwórczych komórkach macierzystych/progenitorowych CD34 (+) za pomocą eksprymowanych znaczników sekwencji i wydajnego klonowania pełnej długości cDNA” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (14): 8175–80. Bibcode : 1998PNAS...95.8175M . doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID 9653160 .
- Sanvito F, Arrigo G, Zuffardi O, Agnelli M, Marchisio PC, Biffo S (sierpień 1998). „Lokalizacja genu białka wiążącego p27 beta4 (ITGB4BP) w regionie ludzkiego chromosomu 20q11.2”. Genomika . 52 (1): 111–2. doi : 10.1006/geno.1998.5403 . PMID 9740680 .
- Sanvito F, Piatti S, Villa A, Bossi M, Lucchini G, Marchisio PC, Biffo S (marzec 1999). „Interaktor integryny beta4 p27 (BBP / eIF6) jest niezbędnym białkiem macierzy jądrowej zaangażowanym w montaż podjednostki rybosomalnej 60S” . Journal of Cell Biology . 144 (5): 823–37. doi : 10.1083/jcb.144.5.823 . PMC 2148184 . PMID 10085284 .
- Wixler V, Geerts D, Laplantine E, Westhoff D, Smyth N, Aumailley M, Sonnenberg A, Paulsson M (październik 2000). „Białko DRAL / FHL2 tylko LIM wiąże się z domeną cytoplazmatyczną kilku łańcuchów integryny alfa i beta i jest rekrutowane do kompleksów adhezyjnych” . Journal of Biological Chemistry . 275 (43): 33669–78. doi : 10.1074/jbc.M002519200 . PMID 10906324 .
- Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (październik 2000). „Klonowanie i analiza funkcjonalna cDNA z otwartymi ramkami odczytu dla 300 wcześniej niezdefiniowanych genów ulegających ekspresji w hematopoetycznych komórkach macierzystych/progenitorowych CD34+” . Badania genomu . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
- Donadini A, Giodini A, Sanvito F, Marchisio PC, Biffo S (marzec 2001). „Ludzki gen ITGB4BP ulega konstytutywnej ekspresji in vitro, ale jest wysoce modulowany in vivo” . gen . 266 (1–2): 35–43. doi : 10.1016/S0378-1119(01)00370-5 . PMID 11290417 .
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (styczeń 2002). „Skierowana analiza proteomiczna jąderka ludzkiego” . Bieżąca biologia . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
- Basu U, Si K, Deng H, Maitra U (wrzesień 2003). „Fosforylacja ssaczego eukariotycznego czynnika inicjacji translacji 6 i jego homologu Tif6p z Saccharomyces cerevisiae: dowód na to, że fosforylacja Tif6p reguluje jego dystrybucję nukleocytoplazmatyczną i jest wymagana do wzrostu komórek drożdży” . Biologia molekularna i komórkowa . 23 (17): 6187–99. doi : 10.1128/MCB.23.17.6187-6199.2003 . PMC 180954 . PMID 12917340 .
- Ceci M, Gaviraghi C, Gorrini C, Sala LA, Offenhäuser N, Marchisio PC, Biffo S (grudzień 2003). „Uwolnienie eIF6 (p27BBP) z podjednostki 60S umożliwia montaż rybosomu 80S”. Natura . 426 (6966): 579–84. Bibcode : 2003Natur.426..579C . doi : 10.1038/natura02160 . PMID 14654845 . S2CID 2431706 .
- Rosso P, Cortesina G, Sanvito F, Donadini A, Di Benedetto B, Biffo S, Marchisio PC (maj 2004). „Nadekspresja p27BBP w rakach głowy i szyi oraz ich przerzutach do węzłów chłonnych”. Głowa i szyja . 26 (5): 408–17. CiteSeerX 10.1.1.503.9652 . doi : 10.1002/hed.10401 . PMID 15122657 . S2CID 39531947 .
- Lehner B, Sanderson CM (lipiec 2004). „Struktura interakcji białek do degradacji ludzkiego mRNA” . Badania genomu . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (styczeń 2005). „Profilowanie powinowactwa immunologicznego fosforylacji tyrozyny w komórkach nowotworowych”. Biotechnologia przyrody . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (styczeń 2005). „Dynamika proteomu jądrowego”. Natura . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/natura03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
- Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (wrzesień 2005). „Sieć interakcji ludzkiego białka z białkiem: źródło opisywania proteomu”. komórka . 122 (6): 957–68. doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .