Lista zakażonych linii komórkowych
Wiele linii komórkowych , które są szeroko stosowane w badaniach biomedycznych, zostało przerośniętych przez inne, bardziej agresywne komórki. Na przykład przypuszczalne linie tarczycy były w rzeczywistości komórkami czerniaka, przypuszczalna tkanka prostaty była w rzeczywistości rakiem pęcherza, a przypuszczalne normalne posiewy macicy były w rzeczywistości rakiem piersi. To jest lista linii komórkowych, które zostały skażone krzyżowo i przerośnięte przez inne komórki. Szacunki oparte na skriningu białaczki - chłoniaka linie komórkowe sugerują, że około 15% z tych linii komórkowych nie jest reprezentatywnych dla tego, za co się zwykle przyjmuje. Obecnie realizowany jest projekt mający na celu wyliczenie i zmianę nazw zanieczyszczonych linii komórkowych, aby uniknąć błędów w badaniach spowodowanych błędną atrybucją.
Zanieczyszczone linie komórkowe były szeroko stosowane w badaniach bez znajomości ich prawdziwego charakteru. Na przykład większość, jeśli nie wszystkie, badania śródbłonka ECV-304 lub megakariocytów DAMI przeprowadzono w rzeczywistości odpowiednio na komórkach raka pęcherza moczowego i erytroleukemii . Tak więc wszystkie badania nad funkcjami specyficznymi dla śródbłonka lub megakariocytów z wykorzystaniem tych linii komórkowych okazały się błędne, służąc bardziej ostrzegawczemu przykładowi.
Istnieją dwa główne sposoby skażenia linii komórkowej: kultury komórkowe są często wymieniane między grupami badawczymi; jeśli podczas obchodzenia się próbka zostanie zanieczyszczona, a następnie przekazana dalej, kolejne wymiany komórek doprowadzą do ustalenia populacji zanieczyszczającej, chociaż części domniemanej linii komórkowej są nadal autentyczne. Bardziej poważne jest zanieczyszczenie u źródła: podczas tworzenia oryginalnej linii komórkowej niektóre zanieczyszczające komórki są przypadkowo wprowadzane do hodowli, gdzie z czasem przerastają pożądane komórki. W tym przypadku wstępne testy nadal sugerowały, że linia komórkowa jest autentyczna i nowatorska, ale w rzeczywistości zniknęła wkrótce po ustanowieniu i wszystkie próbki takich linii komórkowych są w rzeczywistości komórkami zanieczyszczającymi. Wymaga to długich badań, aby określić dokładny punkt, w którym linie komórkowe zostały skażone. Pomieszanie oceniane jako zanieczyszczenie może w rzeczywistości być zwykłym pomieszaniem dwóch linii komórkowych, ale zwykle zakłada się zanieczyszczenie. [ potrzebne źródło ]
Po odkryciu, że linia komórkowa jest skażona, zwykle nie są one ponownie używane do badań wymagających określonego typu linii komórkowej, za którą się zakłada. Większość zanieczyszczonych linii komórkowych jest odrzucana, jednak czasami zanieczyszczone komórki nabyły nowe cechy (np. przez mutację lub transfekcję wirusową , na przykład pochodną HeLa Det98) iw ten sposób stanowią mimo wszystko nową linię, więc nie są wyrzucane. Jeśli uważa się, że linia komórkowa jest zanieczyszczona, zwykle testuje się ją pod kątem autentyczności. Powszechne zanieczyszczenie komórek HeLa zostało początkowo rozpoznane przez Walter Nelson-Rees przy użyciu prostego kariotypowania metodą Giemsy pod mikroskopem świetlnym . Ta technika dobrze sprawdza się w rozpoznawaniu HeLa, ponieważ te komórki mają charakterystyczne chromosomowe . Nowe linie komórkowe są namnażane i dystrybuowane i/lub deponowane w instytucji zabezpieczającej, takiej jak ATCC , tak szybko, jak to możliwe po ustanowieniu, aby zminimalizować prawdopodobieństwo zepsucia linii przez zanieczyszczenie. Jest to uważane za dobrą praktykę okresowe sprawdzanie linii komórkowych utrzymywanych w warunkach laboratoryjnych (tj. nieumieszczanych w długotrwałym przechowywaniu) pod kątem zanieczyszczenia HeLa lub innymi powszechnie występującymi zanieczyszczeniami, aby zapewnić utrzymanie ich jakości i integralności. [ potrzebne źródło ]
Listy zakażonych linii komórkowych
Ta lista, zawierająca 488 linii komórkowych, została ostatnio zaktualizowana 1 grudnia 2016 r.
Cellosaurus prowadzi również listę „problematycznych” linii komórkowych. Lista jest generowana dynamicznie ze wszystkich linii komórkowych znajdujących się w bazie danych z komentarzem zawierającym dedykowane słowa „Problematyczna linia komórkowa”. Na dzień 17 stycznia 2017 r. wykaz zawiera 757 wpisów.
Jeżeli w poszczególnych pozycjach poniższych tabel nie podano gatunku, gatunek z tabeli odnosi się zarówno do zakładanych, jak i rzeczywistych typów komórek.
Linie komórkowe oznaczone jako Wirtualne w poniższej tabeli są znanymi przypadkami zanieczyszczenia u źródła; te linie komórkowe wymarły lub nigdy nie istniały. Przypadki, w których wiadomo o niezanieczyszczonych liniach lub istnieje silne podejrzenie ich istnienia, są oznaczone jako Istniejące .
Zanieczyszczone ludzkie linie komórkowe
Zanieczyszczone linie komórkowe inne niż ludzkie
| Domniemana linia komórkowa | Istniejący? | Domniemany typ komórki | Prawdziwa linia komórkowa | Prawdziwy typ komórki | Odniesienie | Celozaur |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
Aedes vexans , [Culiseta inornata], Aedes aegypti Klon zalotnika |
Nie dotyczy | nieznany | cesarza Gummotha ? |
CVCL_1R46 , CVCL_1R47 , CVCL_1R48 |
||
| GPS-M, GPS-PD | Śledziona świnki morskiej | Odcedź LM | Tkanka łączna myszy laboratoryjnych | CVCL_1R31 , CVCL_1R32 | ||
| LT-1 | Gruczolakorak nerki żaby lamparta | TH-1/FHM | Serce żółwia pudełkowego / nabłonek rybki fathead | CVCL_1R49 |
Notatki
Bibliografia
- Chen, TR (1988). „Ponowna ocena kariotypów HeLa, HeLa S3 i HEp-2”. Cytogenet Cell Genet . 48 (1): 19–24. doi : 10.1159/000132579 . PMID 3180844 .
- Dirks, Willy G.; MacLeod, Roderick AF; Drexler, Hans G. (1999). „ECV304 (śródbłonek) to tak naprawdę T24 (rak pęcherza moczowego): zanieczyszczenie krzyżowe linii komórkowej u źródła” . Biologia komórkowa i rozwojowa in vitro . 35 (10): 558–559. doi : 10.1007/s11626-999-0091-8 . PMID 10614862 . S2CID 31347874 .
- Drexler, Hans G.; Dirks, Willy G.; MacLeod, Roderick AF (1999). „Fałszywe ludzkie linie komórek krwiotwórczych: zanieczyszczenia krzyżowe i błędne interpretacje” . białaczka . 13 (10): 1601–1607. doi : 10.1038/sj.leu.2401510 . PMID 10516762 .
- Drexler, Hans G.; MacLeod, Roderick AF; Dirks, Willy G. (2001). „Zanieczyszczenie krzyżowe: HS-Sultan nie jest szpiczakiem, ale linią komórkową chłoniaka Burkitta” (PDF) . Krew . 98 (12): 3495–3496. doi : 10.1182/blood.v98.12.3495 . PMID 11732505 . S2CID 42238147 .
- Drexler, Hans G.; Quentmeier, H.; Dirks, Willy G.; Uphoff, przewód C.; MacLeod, Roderick AF (2002a). „Profilowanie DNA i analiza cytogenetyczna linii komórkowej WSU-CLL ujawniają zanieczyszczenie krzyżowe linią komórkową REH (pre B-ALL)” . białaczka . 16 (9): 1868–1870. doi : 10.1038/sj.leu.2402610 . PMID 12200708 .
- Drexler, Hans G.; Uphoff, przewód C.; Dirks, Willy G.; MacLeod, Roderick AF (2002b). „Pomieszania i mykoplazma: wrogowie w środku”. Badania nad białaczką . 26 (4): 329–333. doi : 10.1016/S0145-2126(01)00136-9 . PMID 11839374 .
- Drexler, Hans G.; Dirks, Willy G.; Matsuo, Y.; MacLeod, Roderick AF (2003). „Linie komórkowe fałszywej białaczki i chłoniaka: aktualizacja ponad 500 linii komórkowych” . białaczka . 17 (2): 416–426. doi : 10.1038/sj.leu.2402799 . PMID 12592342 .
- Lacroix, Marc (2008). „Trwałe stosowanie„ fałszywych ”linii komórkowych” . Międzynarodowy Dziennik Raka . 122 (1): 1–4. doi : 10.1002/ijc.23233 . PMID 17960586 .
- Liskowicz, Mordechaj; Ravid, Dana (styczeń 2007). „Studium przypadku błędnej identyfikacji linii komórek rakowych: komórki MCF-7 / AdrR (przemianowane na NCI / ADR-RES) pochodzą z ludzkich komórek raka jajnika OVCAR-8” . Listy raka . 245 (1–2): 350–352. doi : 10.1016/j.canlet.2006.01.013 . PMID 16504380 .
- MacLeod, Roderick AF; Dirks, Willy G.; Drexler, Hans G. (1997a). „Wczesne zanieczyszczenie linii komórkowej Dami przez HEL” . Krew . 90 (7): 2850–2851. doi : 10.1182/blood.v90.7.2850.2850_2850_2850 . PMID 9326259 .
- MacLeod, Roderick AF; Dirks, Willy G.; Reid, YA; Siano, RJ; Drexler, Hans G. (1997b). „Tożsamość oryginalnych i późnych pasażowanych megakariocytów Dami z komórkami erytroleukemii HEL wykazana przez połączoną cytogenetykę i pobieranie odcisków palców DNA” . białaczka . 11 (12): 2032–2038. doi : 10.1038/sj.leu.2400868 . PMID 9447816 .
- MacLeod, Roderick AF; Dirks, Willy G.; Matsuo, Y.; Kaufmann, M.; Milch, H.; Drexler, Hans G. (1999). „Powszechne wewnątrzgatunkowe zanieczyszczenie krzyżowe ludzkich linii komórek nowotworowych powstających u źródła” . Międzynarodowy Dziennik Raka . 83 (4): 555–563. doi : 10.1002/(sici)1097-0215(19991112)83:4<555::aid-ijc19>3.0.co;2-2 . PMID 10508494 .
- Mistrzowie, John R. (2002). „Komórki HeLa 50 lat później: dobre, złe i brzydkie”. Nature Recenzje Rak . 2 (4): 315–319. doi : 10.1038/nrc775 . PMID 12001993 . S2CID 991019 .
- Nelson-Rees, Waszyngton; Flandermeyer, RR (1976). „Zdefiniowane kultury HeLa” . nauka . 191 (4222): 96–98. Bibcode : 1976Sci...191...96N . doi : 10.1126/science.1246601 . PMID 1246601 .
- Nelson-Rees, Waszyngton; Daniels, DW; Flandermeyer, RR (1981). „Zanieczyszczenie krzyżowe komórek w hodowli”. nauka . 212 (4493): 446–452. Bibcode : 1981Sci...212..446N . doi : 10.1126/science.6451928 . PMID 6451928 .
- Unger, Ronald E.; Krump-Konvalinkova, V.; Peters, K.; Kirkpatrick, CJ (2002). „Ekspresja in vitro fenotypu śródbłonka: badanie porównawcze pierwotnych wyizolowanych komórek i linii komórkowych, w tym nowej linii komórkowej HPMEC-ST1.6R”. Badania mikronaczyniowe . 64 (3): 384–397. doi : 10.1006/mvre.2002.2434 . PMID 12453433 .
Linki zewnętrzne
- Cellosaurus lista problematycznych (zanieczyszczonych / błędnie zidentyfikowanych) linii komórkowych