Limfocystiwirus
| Klasyfikacja wirusów | |
|---|---|
| limfocystiwirusowych | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Varidnaviria |
| Królestwo: | Bamfordvirae |
| Gromada: | Nucleocytoviricota |
| Klasa: | Megawirycety |
| Zamówienie: | wirusy pimaskowirusowe |
| Rodzina: | Iridoviridae |
| Podrodzina: | Alphairidovirinae |
| Rodzaj: | Limfocystiwirus |
Lymphocystivirus to rodzaj wirusów z rodziny Iridoviridae . Ryby służą jako naturalnych żywicieli. W tym rodzaju występują cztery gatunki. Choroby związane z tym rodzajem obejmują: guzopodobne narośla na skórze.
Zastępy niebieskie
Lymphocystivirus jest jednym z sześciu rodzajów wirusów należących do rodziny wirusów Iridoviridae i jednym z trzech rodzajów należących do tej rodziny, które infekują ryby Teleost , wraz z megalocytivirusem i ranavirusem . Limfocystiwirusy infekują ponad 140 słodkowodnych i morskich , obejmujących co najmniej 42 rodziny żywicieli na całym świecie, powodując przewlekłą, samoograniczającą się chorobę kliniczną, limfocystis . Podczas gdy limfocystis nie powoduje masowej śmiertelności, takiej jak megalocytiwirusy i ranawirusy, ryby z limfocystisami wykazują rażąco widoczne brodawczakowate zmiany skórne, które znacznie zmniejszają ich wartość handlową. Obecnie nie są dostępne żadne szczepionki przeciwko wirusom limfocystis.
Taksonomia
Rodzaj obejmuje następujące gatunki:
- Wirus choroby Lymphocystis 1
- Wirus choroby Lymphocystis 2
- Wirus choroby Lymphocystis 3
- Wirus choroby Lymphocystis 4
genom LCDV
genomem dsDNA . Genom LCDV-1 ma długość około 102,7 kilopar zasad (kbp), z 195 potencjalnymi otwartymi ramkami odczytu (ORF) i koduje dwie zależne od DNA podjednostki polimerazy RNA , metylotransferazę DNA , polimerazę DNA , fosfohydrolazę trifosforanu guanozyny ( GTPaza ), helikaza , kinazy białkowe , reduktaza difosforanu rybonukleozydu i białka palca cynkowego , pośród innych. Genom LCDV-2 jest podobny do genomu LCDV-1, ale jest nieco mniejszy, ma długość około 98 kilopar zasad (kbp).
Struktura
Wirusy z rodzaju Lymphocystivirus są otoczone, mają geometrię dwudziestościenną i wielościenną oraz symetrię T = 189-217. Średnica wynosi około 120-350 nm. Genomy są liniowe, mają około 100 kb długości.
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
|---|---|---|---|---|---|
| Limfocystiwirus | Wielościenny | T=189-217 | Liniowy | jednoczęściowy |
Koło życia
Limfocystiwirusy przyczepiają się do komórki gospodarza i wchodzą przez endocytozę za pośrednictwem receptora, podobnie jak inne irydowirusy. Cząsteczki wirusa są niepowlekane i przemieszczają się do jądra komórki, gdzie rozpoczyna się replikacja DNA za pośrednictwem wirusowo kodowanej polimerazy DNA . Wirusowe DNA przemieszcza się następnie do cytoplazmy w celu drugiego etapu replikacji DNA, w wyniku którego powstają konkatamery DNA . Konkatameryczny wirusowy DNA jest następnie pakowany za pomocą mechanizmu headful do wirionów. Genom wirusa lymphocystis jest permutowany kołowo z końcowo redundantnym DNA . Transkrypcja na matrycy DNA jest metodą transkrypcji. Ryby służą jako naturalny żywiciel.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Limfocystiwirus | Ryba | Nic | Endocytoza receptora komórkowego | Liza; początkujący | Jądro | Cytoplazma | Nieznany |
Patogeneza
Choroba Lymphocystis jest przewlekłą chorobą, która rzadko powoduje śmiertelność. Infekcja powoduje transformację i przerost (około 1000x) komórek skóry właściwej, tworząc wyraźnie widoczne grudki limfocystisowe, a także transformację i przerost komórek tkanki łącznej różnych narządów wewnętrznych. Wirus szczególnie atakuje fibroblasty i osteoblasty . Wirusy Lymphocystis nie dają się łatwo hodować w hodowli komórkowej , co ogranicza eksperymenty z patogenezą molekularną in vitro .
Patologia diagnostyczna
Ponieważ wirusy lymphocystis nie dają się łatwo namnażać w hodowli komórkowej, diagnoza opiera się na objawach klinicznych , ogólnej patologii , histopatologii , serologii i/lub testach molekularnych opartych na reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) .
Obrzydliwa patologia
Patologia limfocystis obejmuje zmiany skórne przypominające brodawczaka, złożone z silnie przerośniętych zakażonych komórek gospodarza osadzonych w macierzy zewnątrzkomórkowej, czasami nazywanych komórkami nowotworowymi lymphocystis, które są wyraźnie widoczne jako białe plamy na skórze i płetwach zakażonej ryby. W niektórych przypadkach zmiany te namnażają się jako guzy nabłonkowe.
Histopatologia
W niedawnym porównaniu histopatologii limfocystis czterech niespokrewnionych gatunków morskich zmiany konsekwentnie związane z limfocystis obejmowały przerośnięte komórki wykazujące nieregularne jądra, zasadochłonne cytoplazmatyczne ciałka wtrętowe , które barwiły się pozytywnie w reakcji Feulgena i Manna oraz kwasu nadjodowego-Shiff (PAS)-dodatnie hialinowe kapsułki. Kapsułki hialinowe powstają z macierzy zewnątrzkomórkowej wytwarzanej przez zakażone komórki i składają się z siarczanowanych i karboksylowanych glikoprotein (kwaśnych mukopolisacharydów). Natomiast kształt ciała inkluzyjnego, rozmieszczenie cząstek wirusowych w cytoplazmie i ogólny wygląd guzków limfocystis różniły się w zależności od gatunku. Gatunki badane w tym badaniu obejmowały rozdymkę białą ( Arothron hispidus ), labraksa japońskiego ( Lateolabrax japonicus ), stornię oliwną ( Paralichthys olivaceus ) ) i „sting fish” lub czarny rockfish Schlegla ( Sebastes schegeli )
Serologia
Opracowano kilka testów serologicznych do identyfikacji infekcji LCDV, w tym cytometrię przepływową , immunoblot i immunofluorescencję . Jednak testy molekularne oparte na PCR są bardziej praktyczne w większości zastosowań.
Mikroskopia elektronowa
Transmisyjna mikroskopia elektronowa (TEM) zainfekowanych komórek ujawnia cząsteczki wirusa cytoplazmatycznego o średnicy zazwyczaj 198-227 nm (w niektórych przypadkach nawet 380 nm) oraz substancje o dużej gęstości elektronowej w przestrzeni okołojądrowej .
Patologia molekularna
Dostępne są opublikowane startery PCR i protokół amplifikacji części LCDV-1 MCP. Gdy test diagnostyczny PCR jest połączony ze szczeliną blot , zwiększa się czułość diagnostyczna , ułatwiając diagnozę bezobjawowych infekcji LCDV-1.