Ranawirus
Ranawirus | |
---|---|
Transmisyjna mikrografia elektronowa ranawirusów (ciemne sześciokąty) gromadzących się na granicy komórki i opuszczających komórkę w procesie zwanym „ pączkowaniem ”. | |
Klasyfikacja wirusów | |
(nierankingowe): | Wirus |
królestwo : | Varidnaviria |
Królestwo: | Bamfordvirae |
Gromada: | Nucleocytoviricota |
Klasa: | Megawirycety |
Zamówienie: | wirusy pimaskowirusowe |
Rodzina: | Iridoviridae |
Podrodzina: | Alphairidovirinae |
Rodzaj: | Ranawirus |
Ranavirus to rodzaj wirusów z rodziny Iridoviridae . W rodzinie Iridoviridae istnieje sześć innych rodzajów wirusów , ale Ranavirus jest jedynym, który obejmuje wirusy zakaźne dla płazów i gadów . Dodatkowo jest to jeden z trzech rodzajów należących do tej rodziny, które infekują teleost , razem z Lymphocystivirus i Megalocytivirus .
Wpływ ekologiczny
Ranawirusy, podobnie jak Megalocytiwirusy, to wyłaniająca się grupa blisko spokrewnionych wirusów dsDNA , które powodują infekcje ogólnoustrojowe u wielu dzikich i hodowlanych ryb słodkowodnych i morskich. Podobnie jak w przypadku megalocytiwirusów, ranawirusów mają zatem duże znaczenie gospodarcze w akwakulturze , ponieważ epizootie mogą powodować umiarkowane straty ryb lub przypadki masowej śmiertelności hodowanych ryb. Jednak w przeciwieństwie do Megalocytiviruses, Ranavirus infekcje u płazów zostały uznane za czynnik przyczyniający się do globalnego spadku populacji płazów. Wpływ ranawirusów na populacje płazów porównano z działaniem grzyba chytrid Batrachochytrium dendrobatidis , czynnika wywołującego chytridiomikozę . Uważa się, że w Wielkiej Brytanii nasilenie ognisk chorób wzrosło z powodu zmian klimatu.
Etymologia
Rana pochodzi od łacińskiego określenia „żaba”, co odzwierciedla pierwszą izolację ranawirusa w latach 60. XX wieku z żaby lamparta północnego ( Lithobates pipiens ).
Ewolucja
Wydaje się, że ranawirusy wyewoluowały z wirusa ryb, który następnie infekował płazy i gady.
Zastępy niebieskie
Gospodarze Anurana
- Żaby leśne ( Lithobates sylvaticus )
- Żaba rycząca ( Lithobates catesbieanus )
- Żaba Pickerel
Gospodarze Urodelan
Gospodarze Reptilianie
- Pyton zielony ( Chondropython viridis )
- Birmańskie żółwie gwiaździste ( Geochelone platynota )
- Żółw lamparci ( Geochelone pardalis )
- Żółwie susły ( Gopherus polyphemus )
- Jaszczurka górska ( Lacerta monticola )
- Żółwie pudełkowe ( Terrapene carolina carolina )
- Żółwie pudełkowe z Florydy ( Terrapene carolina bauri )
- Zachodnie ozdobne żółwie pudełkowe ( Terrapene ornata )
- Żółwie ostrogowate ( Testudo graeca )
- Żółwie Hermanna ( Testudo hermanni )
- Żółwie egipskie ( Testudo kleinmanni )
- Żółwie rosyjskie ( Testudo horsfieldii )
- Żółwie obrzeżone ( Testudo marginata )
- Suwaki czerwonolicy ( Trachemys scripta elegans )
- Żółwie jaszczurowate ( Chelydra serpentina )
- Żółwie chińskie ( Pelodiscus sinensis )
- Gekon z płaskim ogonem ( Uroplatus fimbriatus )
- Jaszczurka płotowa wschodnia ( Sceloporus undulatus )
Taksonomia
Rodzaj obejmuje następujące gatunki:
- Wirus Ambystoma tigrinum
- Wirus ropuchy położnej
- Epizootyczny wirus martwicy układu krwiotwórczego
- Europejski ranawirus północnoatlantycki
- Wirus żaby 3
- Santee-Cooper ranawirus
- Singapurski irydowirus grouper
Rodzina Iridoviridae jest podzielona na siedem rodzajów, które obejmują Chloriridovirus , Iridovirus , Lymphocystivirus , Megalocytivirus i Ranavirus . Rodzaj Ranavirus zawiera trzy wirusy, o których wiadomo, że infekują płazy (wirus Ambystoma tigrinum (ATV), wirus Bohle iridovirus (BIV) i wirus żaby 3).
Struktura
Ranawirusy to duże dwudziestościenne wirusy DNA o średnicy około 150 nm z dużym pojedynczym liniowym genomem dsDNA o wielkości około 105 kbp, który koduje około 100 produktów genów. Głównym składnikiem strukturalnym kapsydu białkowego jest główne białko kapsydu (MCP).
Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
---|---|---|---|---|---|
Ranawirus | Wielościenny | T=133 lub 147 | Liniowy | jednoczęściowy |
Replikacja
Replikacja ranawirusa jest dobrze zbadana przy użyciu wirusa Frog 3 (FV3). Replikacja FV3 zachodzi w temperaturze od 12 do 32 stopni Celsjusza. Ranawirusy dostają się do komórki gospodarza przez endocytozę za pośrednictwem receptora . Cząsteczki wirusowe są niepowlekane, a następnie przemieszczają się do jądra komórkowego , gdzie rozpoczyna się replikacja wirusowego DNA za pośrednictwem wirusowo kodowanej polimerazy DNA . Następnie wirusowe DNA opuszcza jądro komórkowe i rozpoczyna drugi etap replikacji DNA w cytoplazmie, ostatecznie tworząc konkatamery DNA . Wirusowe DNA jest następnie pakowane za pomocą mechanizmu headful do zakaźnych wirionów. ranawirusa , podobnie jak inne genomy irydowirusa, jest permutowany kołowo i wykazuje końcowo redundantny DNA . Istnieją dowody na to, że infekcje ranawirusowe atakują makrofagi jako mechanizm uzyskiwania dostępu do komórek.
Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ranawirus | żaby; węże | Nic | Endocytoza receptora komórkowego | Liza; początkujący | Jądro | Cytoplazma | Kontakt |
Przenoszenie
Uważa się, że przenoszenie ranawirusów odbywa się wieloma drogami, w tym zanieczyszczoną glebą, bezpośrednim kontaktem, narażeniem na wodę i spożyciem zakażonych tkanek podczas drapieżnictwa , nekrofagii lub kanibalizmu . Ranawirusy są stosunkowo stabilne w środowisku wodnym, utrzymując się kilka tygodni lub dłużej poza organizmem żywiciela.
Epizoologia
Zdarzenia masowej śmiertelności płazów spowodowane ranawirusem odnotowano w Azji, Europie, Ameryce Północnej i Ameryce Południowej. Ranawirusy wyizolowano z dzikich populacji płazów w Australii, ale nie powiązano ich z masową śmiertelnością na tym kontynencie.
Patogeneza
Synteza białek wirusowych rozpoczyna się w ciągu kilku godzin od wniknięcia wirusa, a martwica lub apoptoza występuje już kilka godzin po zakażeniu.
Dynamika chorób sezonowych
Istnieje kilka hipotez dotyczących sezonowych wzorców epidemii obserwowanych w przypadkach śmiertelności ranawirusa. Ranawirusy rosną in vitro w temperaturze 8-30°C, jednak w przypadku większości izolatów wyższa temperatura skutkuje szybszą replikacją wirusa. Połączenie tej optymalnej temperatury wzrostu wraz ze zmianami podatności larw płazów skutkuje sezonowymi epidemiami najczęściej obserwowanymi podczas ciepłych letnich miesięcy. Śmiertelność płazów jest często obserwowana, gdy płazy larwalne osiągają późne stadia Gosnera , zbliżając się do metamorfozy . Gdy płazy larwalne osiągają metamorficzne stadia rozwoju, ich układ odpornościowy jest reorganizowany przed rozwojem dorosłych tkanek. W tym okresie płazy są zestresowane, a ich układ odpornościowy jest osłabiony. Ten spadek funkcji odpornościowych i cieplejsze temperatury otoczenia pozwalają na większą replikację wirusa i uszkodzenie komórek. Spośród 64 przypadków śmiertelności w Stanach Zjednoczonych stwierdzono, że 54% miało miejsce między czerwcem a sierpniem.
Trwałość środowiska
Trwałość Ranawirusów w środowisku nie jest dobrze poznana, jednak w realistycznych warunkach środowiskowych wartość T90 wirusa podobnego do FV3 wynosi 1 dzień. Na czas trwałości prawdopodobnie ma wpływ temperatura i warunki mikrobiologiczne. Jest mało prawdopodobne, aby ranawirusy utrzymywały się w środowisku poza gatunkami żywicieli między wybuchami epidemii. Naukowcy zbadali kilka rezerwuarów patogenów dla wirusa, co może wyjaśniać, w jaki sposób wirus może przetrwać w społeczności płazów. W niektórych populacjach płazów osobniki zakażone subklinicznie mogą służyć jako rezerwuary patogenu. Te subklinicznie zakażone osobniki są odpowiedzialne za ponowne wprowadzenie wirusa do populacji larw. Ponieważ ranawirusy są zdolne do infekowania wielu taksonów i istnieją różnice w podatności między taksonami, prawdopodobne jest, że sympatyczne ryb i gadów mogą również służyć jako rezerwuary wirusa. Transmisja międzyklasowa została udowodniona dzięki zastosowaniu mezokosmicznych .
Obrzydliwa patologia
Duże zmiany chorobowe związane z infekcją Ranawirusem obejmują rumień, uogólniony obrzęk, krwotok, obrzęk kończyn oraz opuchniętą i łamliwą wątrobę.
Zobacz też
Linki zewnętrzne
Dane związane z Listą wirusów w Wikispecies
- ICTV Online (10.) Raport: Iridoviridae
- Strefa wirusowa : Ranawirus
- Globalne Konsorcjum Ranawirusów
- Choroby wirusowe płazów
- Więcej informacji na temat Ranawirusa i innych patogenów wpływających na populacje płazów, w tym Batrachochytrium dendrobatidis i Batrachochytrium salamandrivorans, można znaleźć na stronie internetowej zespołu zadaniowego Southeast Partners in Amphibian and Reptile Conservation disease. [1]