Birnaviridae

ODR.Birna.Fig1.v1.c.png
Birnaviridae
Cząsteczka wirusa zakaźnej choroby torby Fabrycjusza
Klasyfikacja wirusów
(nierankingowe): Wirus
królestwo : Rybowiria
Królestwo: Orthornawirusy
Gromada: incertae sedis
Rodzina: Birnaviridae

Birnaviridae to rodzina dwuniciowych wirusów RNA . Naturalnymi żywicielami są ryby łososiowate , ptaki i owady. Obecnie w tej rodzinie występuje 11 gatunków, podzielonych na siedem rodzajów. Choroby związane z tą rodziną obejmują zakaźną martwicę trzustki u ryb łososiowatych, która powoduje znaczne straty w sektorze akwakultury, z przewlekłą infekcją u dorosłych ryb łososiowatych i ostrą chorobą wirusową u młodych ryb łososiowatych.

Struktura

Wirusy z rodziny Birnaviridae nie mają otoczki , mają dwudziestościenną geometrię z pojedynczą skorupą i symetrię T = 13. Średnica wynosi około 70 nm.

Genom

Genom składa się z liniowego, dwusegmentowego, dwuniciowego RNA. Ma długość około 5,9–6,9 kbp i koduje od pięciu do sześciu białek. Birnawirusy kodują następujące białka:

Polimeraza RNA kierowana przez RNA (VP1), której brakuje wysoce konserwatywnej sekwencji Gly-Asp-Asp (GDD), składnik proponowanego miejsca katalitycznego tej rodziny enzymów, który występuje w konserwatywnym motywie VI domeny palmowej innych RNA- kierowane polimerazy RNA.

Duży segment RNA, segment A, birnawirusów koduje poliproteinę (N-VP2-VP4-VP3-C), która jest przetwarzana na główne białka strukturalne wirionu: VP2, VP3 (mniejszy składnik strukturalny wirusa), i do domniemanej proteazy VP4. Białko VP4 bierze udział w generowaniu VP2 i VP3. rekombinowany VP3 jest bardziej immunogenny niż rekombinowany VP2.

Wirus zakaźnej martwicy trzustki (IPNV), birnawirus, jest ważnym patogenem w gospodarstwach rybnych . Analizy białek wirusowych wykazały, że VP2 jest głównym strukturalnym i immunogennym polipeptydem wirusa. Wszystkie neutralizujące przeciwciała monoklonalne są swoiste wobec VP2 i wiążą się z ciągłymi lub nieciągłymi epitopami . Domena zmienna VP2 i 20 sąsiadujących aminokwasów konserwatywnego C-końca są prawdopodobnie najważniejsze w indukowaniu odpowiedzi immunologicznej w celu ochrony zwierząt .

Niestrukturalne białko VP5 znajduje się w segmencie A RNA. [ potrzebne źródło ] Funkcja tego małego białka wirusowego jest nieznana . Uważa się, że bierze udział w wpływaniu na apoptozę, ale badania nie są całkowicie zgodne. Białka nie można znaleźć w wirionie. [ potrzebne źródło ]

Replikacja wirusa

Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza następuje przez endocytozę receptora komórkowego . Replikacja przebiega zgodnie z modelem replikacji wirusa dwuniciowego RNA w cytoplazmie. Transkrypcja dwuniciowego wirusa RNA jest metodą transkrypcji w cytoplazmie. Wirus jest uwalniany przez pączkowanie. Ryby łososiowate ( Aquabirnavirus ), młode niedojrzałe płciowo kurczęta ( Avibirnavirus ), owady ( Entomobirnavirus ) i poplamiona ryba snakehead ( Blosnavirus ) jako naturalny gospodarz. Trasy transmisji są stykowe.

Taksonomia

Drzewo filogenetyczne Birnaviridae

Rozpoznawane są następujące rodzaje:

Linki zewnętrzne