tektiwirus
|
|
| Tectiviridae | |
|---|---|
| CryoEM kapsydu faga Enterobacteria PRD1. Wpis PDB | |
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Varidnaviria |
| Królestwo: | Bamfordvirae |
| Gromada: | Preplasmiviricota |
| Klasa: | Tectiliviricetes |
| Zamówienie: | Kalamavirales |
| Rodzina: | Tectiviridae |
| Rodzaje | |
Tectiviridae to rodzina wirusów z 10 gatunkami w pięciu rodzajach. Bakterie służą jako naturalni gospodarze. Tektiwirusy nie mają struktury głowa-ogon, ale są zdolne do wytwarzania rurek przypominających ogon o wymiarach ~ 60 × 10 nm po adsorpcji lub po obróbce chloroformem . Nazwa pochodzi od łacińskiego tectus (co oznacza „zakryty”).
Wirusologia
Wiriony gatunków Tectiviridae są bezotoczkowe, dwudziestościenne i wykazują pseudosymetrię T=25 . Kapsyd ma dwie warstwy . Zewnętrzna warstwa to struktura białkowa złożona z 240 trimerów białek kapsydu, a wewnętrzna to białkowa błona lipidowa, która otacza genom wirusa . Wierzchołkowe kolce rozciągające się na około 20 nanometrów (nm) wystają z wierzchołków dwudziestościanów. [ potrzebne źródło ]
Genom jest pojedynczą cząsteczką liniowego dwuniciowego DNA o długości 15 kilo zasad i ma 30 otwartych ramek odczytu. Tworzy ciasno upakowaną cewkę i koduje kilka białek strukturalnych. Koduje około 30 białek, które są transkrybowane w operonach. W wironie obecnych jest co najmniej 9 białek strukturalnych. Genom ma masę około 66 megadaltonów i stanowi 14–15% masy wirionu. Lipidy stanowią dalsze 15% wagowych. Węglowodany nie występują. [ potrzebne źródło ]
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez adsorpcję do komórki gospodarza. Po adsorpcji na powierzchni komórki gospodarza wirion wytłacza strukturę rurki ogonowej przez wierzchołek w celu dostarczenia genomu do gospodarza. Replikacja przebiega zgodnie z modelem przemieszczania nici DNA. Transkrypcja na matrycy DNA jest metodą transkrypcji. Białka kapsydu polimeryzują wokół pęcherzyka lipoproteinowego przemieszczanego w cytoplazmie przez czynniki składania wirionu.
Dojrzałe wirony są uwalniane przez lizę, która w przypadku PRD1 jest osiągana za pomocą zakodowanej w wirusie maszynerii lizy składającej się z czterech białek: P15 (endolizyna), P35 ( holina ), P36 i P37 (homologów genu Rz/ białka Rz1 faga lambda).
Taksonomia
Tectiviridae zawiera następujące rodzaje i gatunki:
-
alfatektiwirus
- Wirus Pseudomonas PR4
- Wirus Pseudomonas PRD1
-
betatektiwirus
- Wirus Bacillus AP50
- Wirus Bacillus Bam35
- Wirus Bacillus GIL16
- Wirus Bacillus Wip1
-
Deltatektiwirus
- Wirus Streptomyces Forthebois
- Wirus Streptomyces WheeHeim
-
Epsilontectivirus
- Wirus Rhodococcus Toil
-
Gammatectivirus
- Wirus Gluconobacter GC1
Inne nieprzypisane fagi:
- Wirus Thermus phiKo
- Wirus mikrobakterii Badulia
- Wirus mikrobakterii MuffinTheCat
Dalsza lektura
- ICTVdB — zarządzanie uniwersalną bazą danych wirusów ICTVdB (2006). 00.068. Tectiviridae. W: ICTVdB — The Universal Virus Database, wersja 3. Büchen-Osmond, C. (red.), Columbia University, Nowy Jork, USA
- Taksonomia wirusów : ósmy raport Międzynarodowego Komitetu Taksonomii Wirusów HV Van Regenmortel, DHL Bishop, MH Van Regenmortel, Claude M. Fauquet (red.)
- 68.0.1. tektiwirus