Mononegavirales
|
|
| Wirion | |
|---|---|
| wirusa pęcherzykowego zapalenia jamy ustnej (VSV) i genomy Mononegavirales | |
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Negarnaviricota |
| Klasa: | Monjiviricetes |
| Zamówienie: | Mononegavirales |
| Rodziny | |
Mononegavirales to rząd wirusów RNA o ujemnej nici , które mają niesegmentowane genomy. Niektóre wspólne członkowie tego rzędu to wirus Ebola , syncytialny wirus oddechowy człowieka , wirus odry , wirus świnki , wirus Nipah i wirus wścieklizny . Wszystkie te wirusy powodują poważne choroby u ludzi. Do tej grupy należy również wiele innych ważnych patogenów zwierząt i roślin innych niż ludzie. Zamówienie obejmuje jedenaście rodzin wirusów : Artoviridae , Bornaviridae , Filoviridae , Lispiviridae , Mymonaviridae , Nyamiviridae , Paramyxoviridae , Pneumoviridae , Rhabdoviridae , Sunviridae i Xinmoviridae .
Użycie terminu
Rząd Mononegavirales (wymawiane: / ˌ m ɒ n ə ˌ n ɛ ɡ ə v i ˈ r ɑː l ɪ z / MON -ə- NEG -ə-vee- RAH -liz ) to takson wirusologiczny, który powstał w 1991 roku i zmienione w 1995, 1997, 2000, 2005, 2011, 2016, 2017 i 2018 roku. Nazwa Mononegavirales pochodzi od starogreckiego przymiotnika μóνος monos (nawiązujący do jednoczęściowych i jednoniciowych genomów większości mononegawirusów), łaciński czasownik negare (nawiązujący do ujemnej polarności tych genomów) i przyrostek taksonomiczny -virales ( oznaczający rząd wirusów).
Zamów kryteria włączenia
Wirus jest członkiem rzędu Mononegavirales if
- jego genom jest liniowym, zazwyczaj (ale nie zawsze) niesegmentowanym, jednoniciowym, niezakaźnym RNA o ujemnej polarności; posiada odwrotnie komplementarne końce 3' i 5'; i nie jest kowalencyjnie związany z białkiem ;
- jego genom ma charakterystyczną kolejność genów 3'-UTR – geny białek rdzeniowych – geny białek otoczki – gen polimerazy RNA zależnej od RNA – 5'-UTR (3'-NPMGL-5') (są jednak pewne wyjątki);
- wytwarza 5–10 różnych mRNA ze swojego genomu poprzez polarną transkrypcję sekwencyjną z pojedynczego promotora zlokalizowanego na końcu 3 'genomu; mRNA są zakończone czapeczką 5' i poliadenylowane ;
- replikuje się poprzez syntezę kompletnych antygenomów;
- tworzy zakaźne helikalne rybonukleokapsydy jako matryce do syntezy mRNA, antygenomów i genomów;
- koduje zależną od RNA polimerazę RNA (RdRp, L), która jest wysoce homologiczna do polimerazy innych mononegawirusów; i/lub
- zazwyczaj (ale nie zawsze) wytwarza otoczkowe wiriony o masie cząsteczkowej 300–1000 × 106 ; S 20W ; 550–>1045 i gęstość wyporu w CsCl 1,18-1,22 g/cm 3 .
Koło życia
Cykl życiowy mononegawirusa rozpoczyna się od przyłączenia wirionu do określonych receptorów na powierzchni komórki , po czym następuje fuzja otoczki wirionu z błonami komórkowymi i jednoczesne uwolnienie nukleokapsydu wirusa do cytozolu . Wirus RdRp częściowo odsłania nukleokapsyd i dokonuje transkrypcji genów na dodatnioniciowe mRNA , które następnie ulegają translacji do białek strukturalnych i niestrukturalnych .
RdRps mononegawirusa wiążą się z pojedynczym promotorem znajdującym się na końcu 3' genomu. Transkrypcja albo kończy się po genie, albo przechodzi do następnego genu w dół. Oznacza to, że geny znajdujące się blisko końca 3' genomu są transkrybowane w największej ilości, podczas gdy geny znajdujące się blisko końca 5' są najmniej podatne na transkrypcję. Kolejność genów jest zatem prostą, ale skuteczną formą regulacji transkrypcji. Najobficiej wytwarzanym białkiem jest nukleoproteina , której stężenie w komórce określa, kiedy RdRp przełącza się z transkrypcji genu na replikację genomu.
W wyniku replikacji powstają antygenomy o dodatniej nici pełnej długości, które z kolei są transkrybowane do kopii genomu potomstwa wirusa o ujemnej nici. Nowo zsyntetyzowane białka strukturalne i genomy same się składają i gromadzą w pobliżu wnętrza błony komórkowej . Wiriony pączkują z komórki, uzyskując otoczki z błony komórkowej, z której pączkują. Dojrzałe cząstki potomne infekują następnie inne komórki, aby powtórzyć cykl.
Paleowirusologia
Historia mononegawirusów sięga kilkudziesięciu milionów lat. Odkryto „ skamieliny ” mononegawirusa w postaci genów mononegawirusa lub fragmentów genów zintegrowanych z genomami ssaków . Na przykład „skamieniałości” genu bornawirusa wykryto w genomach nietoperzy , ryb , góralek , torbaczy , naczelnych , gryzoni , przeżuwaczy i słoni . „Skamieniałości” genu filowirusa wykryto w genomach nietoperzy, gryzoni, ryjówek , tenreków i torbaczy . W genomie danio pręgowanego znaleziono „skamieniałość” wirusa Midway . Wreszcie „skamieniałości” rabdowirusa znaleziono w genomach skorupiaków , komarów , kleszczy i roślin .
Taksonomia
Kolejność ma jedenaście rodzin, które obejmują liczne rodzaje, które składają się z wielu różnych gatunków: [ potrzebne źródło ]
- Artoviridae
- Bornaviridae
- Filoviridae
- Lispiviridae
- Mymonaviridae
- Nyamiviridae
- Paramyxoviridae
- Pneumoviridae
- Rhabdoviridae
- Sunviridae
- Xinmoviridae
Tabela kolejności przedstawiająca wszystkie rodziny, rodzaje, gatunki i ich wirusy:
Legenda tabeli: „*” oznacza gatunek typu.