Siphoviridae

BacteriophageHK97.jpg
Siphoviridae
TME obraz wirionu HK97 wirusa Escherichia , Siphoviridae
klasyfikacja wirusów
(nierankingowe): Wirus
królestwo : Duplodnaviria
Królestwo: Heunggongvirae
Gromada: Urowiricota
Klasa: Caudoviricetes
Zamówienie: Caudovirales
Rodzina: Siphoviridae
Rodzaje

patrz tekst

Synonimy
  • Styloviridae

Siphoviridae to rodzina dwuniciowych wirusów DNA z rzędu Caudovirales . Bakterie i archeony służą jako naturalni gospodarze. Istnieje 1166 gatunków w tej rodzinie, przypisanych do 366 rodzajów i 22 podrodzin. Charakterystycznymi cechami strukturalnymi tej rodziny są nieotoczona głowa i niekurczliwy ogon.

Struktura

Typowa struktura sifowirusa

Wirusy w Siphoviridae są bezotoczkowe , z geometrią dwudziestościanu i ogona głowy ( morfotyp B1) lub wydłużonym kapsydem (morfotyp B2) i symetrią T=7. Średnica wynosi około 60 nm. Członkowie tej rodziny charakteryzują się również nitkowatymi, krzyżowymi, niekurczliwymi ogonami, zwykle z krótkimi włóknami końcowymi i podkońcowymi. Genomy są dwuniciowe i liniowe, mają około 50 kb długości i zawierają około 70 genów . Zawartość guaniny / cytozyny wynosi zwykle około 52% . [ potrzebny cytat ]

Koło życia

Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez adsorpcję do komórki gospodarza. Replikacja jest zgodna z replikacyjnym modelem transpozycji. Transkrypcja na matrycy DNA jest metodą transkrypcji. Translacja odbywa się poprzez przesunięcie ramki rybosomalnej -1 i przesunięcie ramki rybosomalnej +1. Wirus opuszcza komórkę gospodarza przez lizę i białka holina/endolizyna/spanin. Bakterie i archeony służą jako naturalny gospodarz. Drogi transmisji to dyfuzja pasywna.

Taksonomia

Mikrografie elektronowe sifowirusa z Cutibacterium Acnes (dawniej Propionibacterium Acnes ). Fagi wybarwiono negatywnie i poddano transmisyjnej mikroskopii elektronowej. Fagi mają głowę o średnicy około 55 nm, wypełnioną materiałem genetycznym. Ich ogony mają rozmiar 150 × 10 nm i są elastyczne i niekurczliwe. Na dolnym mikrofotografii PAD25 przylega do resztek komórek bakteryjnych, a dwa fagi straciły głowy. Wszystkie fagi zostały sklasyfikowane jako Siphoviruses na podstawie ich morfologii.

Rozpoznawane są następujące podrodziny:

  • Arquatrovirinae
    • akwatrowirus
    • Camwirus
    • Likawirus
  • Azeredovirinae
    • Dubowwirus
    • fietawirus
  • Bclasvirinae
    • Acadianwirus
    • Cooperwirus
    • pregunawirus
    • Wirus Piperyny
    • Wirus róży
  • Bronfenbrennervirinae
    • Biseptimawirus
    • Peevelwirus
  • Chebruvirinae
    • Brujita
  • Dclasvirinae
    • Wirus hawkeya
    • Plotwirus
  • Deejayvirinae
    • Kenoszwirus
    • Wirus sekretariatu
    • Taniswirus
  • Dolichocephalovirinae
    • Wirus Berteleya
    • Wirus kolosa
    • Poidexterwirus
    • Spirowirus
  • Gochnauervirinae
    • Dragolirwirus
    • Harrisonwirus
    • Wegawirus
    • Wanderswirus
  • Guernseyvirinae
    • korneliwirus
    • wirus Jersey
    • Kagunawirus
  • Gutmannvirinae
    • Carmenwirus
    • Pobcunawirus
  • Hendrixvirinae
    • Bryniewirus
    • Cauhtlivirus
    • Wirus Kwaitsinga
    • Nochtlivirus
    • Sainkungvirus
    • Wirus szamszuipowirusa
    • Wainchawirus
    • Wirus Wongtai
    • Jautsimwirus
  • Langleyhallvirinae
    • Getalongvirus
    • Horuswirus
    • fitawirus
  • Mccleskeyvirinae
    • Limdunawirus
    • Unakwatrowirus
  • Mclasvirinae
    • Bongowirus
    • Reywirus
  • Nclasvirinae
    • Wirus Bettera
    • Charlievirus
    • rediwirus
  • Nymbaxtervirinae
    • Baxterwirus
    • nimfadurawirus
  • Pclasvirinae
    • Bignuzwirus
    • Wirus Fisburne'a
    • Fajoncewirus
  • Queuovirinae
    • Amoywirus
    • Nipunawirus
    • Noagwirus
    • Seuratwirus
  • Skryabinvirinae
    • Bambunakwatrowirus
    • Puchinowirus
  • Trabyvirinae
    • Jelitawirus
    • Ślepowronwirus
  • Tybeckvirinae
    • Douglaswirus
    • Lenuswirus
    • Lideunawirus
    • Maenadvirus

Następujące rodzaje nie są przypisane do podrodziny:

  • Wirus Abbeymikolon
  • Abidżanwirus
  • Agmunawirus
  • Aguilawirus
  • Ahduowirus
  • Alachuawirus
  • Alegriawirus
  • Amigowirus
  • Anatolewirus
  • Andrzejwirus
  • Andromedawirus
  • Annadreamyvirus
  • Appawirus
  • Wirus moreli
  • Arawnwirus
  • Armstrongwirus
  • Ashduowirus
  • Attiswirus
  • Attoomiwirus
  • Wirus Audreyjarvisa
  • Austintiousvirus
  • Awaniwirus
  • Bantamwirus
  • Wirus stodoły
  • Beceayunawirus
  • Wirus buraków
  • Behunawirus
  • Bernalwirus
  • Betterkatzvirus
  • Bievrevirus
  • Bingwirus
  • Bowserwirus
  • Wirus Bridgette
  • Britbratwirus
  • Bronwirus
  • Brussowwirus
  • Camtrevirus
  • Wirus Casadabanu
  • Cbastwirus
  • Ceciwirus
  • Ceduowirus
  • Ceetrepowirus
  • Cequinquevirus
  • Chenonawirus
  • Cheoktowirus
  • Wirus Chertseya
  • Chiwirus
  • Chunghsingwirus
  • Cimpunawirus
  • Cynunawirus
  • Wirus Coetzee
  • Colunawirus
  • koralwirus
  • Korndogwirus
  • Korniewirus
  • Coventryvirus
  • Kronuswirus
  • Cukewirus
  • Daredevilvirus
  • Dekurrowirus
  • Delepkwitawirus
  • Demosteneswirus
  • Detrewirus
  • Deurplewirus
  • Dhillonwirus
  • Dinawirus
  • dezmaswirus
  • Doucettewirus
  • Edenwirus
  • Ekwatrowirus
  • Eiauwirus
  • Wirus Eisenstark
  • Eleriwirus
  • Wirus emalinowy
  • eyrewirus
  • Wirus Fairfaxidum
  • Wirus Farahnaz
  • Fattrewirus
  • Feofaniawirus
  • Paprociowy wirus
  • Fibralongawirus
  • Wirus fowlmouth
  • Wirus Franklinbaya
  • Fremauxwirus
  • Fromanvirus
  • Gajawirus
  • wirus galaktyczny
  • Galunawirus
  • Gamtrewirus
  • Gesputwirus
  • Getseptimavirus
  • Ghobeswirus
  • Gileswirus
  • Gillianwirus
  • Gilsonwirus
  • Glaedewirus
  • Godonkawirus
  • Wirus Goodmana
  • Gordonwirus
  • Gordtnkvirus
  • Gorganwirus
  • Gorjumwirus
  • Gustawwirus
  • halcyonewirus
  • Hattifnattwirus
  • Wirus Jadwigi
  • Helsingorwirus
  • Hiyawirus
  • Hnatkowirus
  • Holosaliniwirus
  • Wirus Homburga
  • Hubeiwirus
  • jaduowirus
  • Ikedawirus
  • Ilzatwirus
  • incheonwirus
  • indlulamitiwirus
  • Inhawirus
  • jacewirus
  • Jarrellwirus
  • Jenstwirus
  • Jouyvirus
  • Juiceboxvirus
  • Junawirus
  • Kairosaliniwirus
  • Wirus Kamczatki
  • Karimacwirus
  • Kelleziowirus
  • Kilunawirus
  • Klementwirus
  • Wirus Knuthellera
  • Kojiwirus
  • Konstantinewirus
  • Korrawirus
  • Kostyawirus
  • Krampuswirus
  • Kryptosaliniwirus
  • Kuleanawirus
  • labanwirus
  • laknuwirus
  • Lacusarxvirus
  • Lafunawirus
  • Lambdawirus
  • lambowirus
  • Lanawirus
  • Larmunawirus
  • wirus laroye
  • Latrobewirus
  • Wirus Leicester
  • Lentawirus
  • Liebewirus
  • Liefiewirus
  • Lillamywirus
  • Lokiwirus
  • Wirus Łomowskiej
  • Wirus Luckybarnesa
  • Luckytenwirus
  • Wirus płucny
  • Wirus Lwoffa
  • magadiwirus
  • Majawirus
  • Wirus Manhattanu
  • Mapwirus
  • Mardekawirus
  • Wirus Marienburga
  • marwinwirus
  • Maxrubnerwirus
  • Mementomoriwirus
  • Metamorfowirus
  • Minunawirus
  • Wirus Moineau
  • Montywirus
  • Wirus błota
  • Mufazoktowirus
  • Muminwirus
  • wirus Murraya
  • Nanhaiwirus
  • Nazgulwirus
  • Nefertenawirus
  • Nesewirus
  • Nevewirus
  • Nickievirus
  • Nonanawirus
  • wirus Nyceirae
  • Oenguswirus
  • Omegawirus
  • Oneupvirus
  • Wirus orchidei
  • oshimawirus
  • Paheksawirus
  • Pamekswirus
  • Pankowwirus
  • Papiruswirus
  • wirus cierpliwości
  • Pepyheksawirus
  • Fifelwirus
  • Picardwirus
  • Pikminwirus
  • Pleeduowirus
  • Pleetrewirus
  • Poushouwirus
  • Wirus drapieżnika
  • priunawirus
  • Psawirus
  • psimunawirus
  • pulvererwirus
  • Questintwirus
  • Wirus Quhwah
  • Radostwirus
  • Raleighvirus
  • Rawarandawirus
  • ravinwirus
  • erduowirus
  • rygallicwirus
  • Rymawirus
  • Wirus Rockefellera
  • Wirus Rockville'a
  • Wirus Rogerhendrixa
  • Ronaldowirus
  • Roufwirus
  • Rowawirus
  • rutywirus
  • samistiwirus
  • Samunawirus
  • samwawirus
  • Sandinewirus
  • Sanowirus
  • Sansawirus
  • Saheksawirus
  • Saszawirus
  • Saswirus
  • Saundersvirus
  • Sawarawirus
  • skapunawirus
  • Wirus Schnabeltiera
  • Schubertwirus
  • Wirus Seongbuk
  • Septimatrewirus
  • Seusswirus
  • sekstaekwirus
  • skunawirus
  • Slashwirus
  • Wirus śpiochów
  • Wirus smoothie
  • sonaliwirus
  • Wirus Zupy
  • kwaśny wirus
  • Sozziwirus
  • Sparkywirus
  • Spbetawirus
  • Wirus Spizizen
  • Squashwirus
  • Squirtyvirus
  • Stanholtwirus
  • Wirus Steinhofa
  • Sukhumvitvirus
  • Tandoganwirus
  • Wirus czołgów
  • Tanwirus
  • Terapinwirus
  • Teuberwirus
  • Thetabobwirus
  • Tigunawirus
  • Timkwatrowirus
  • Tinduowirus
  • Titanvirus
  • wirus tortellini
  • triawirus
  • Trigintaduowirus
  • trinawirus
  • trynewirus
  • Wirus potrójny
  • Unahawirus
  • Wirus Uwajimy
  • Waszwirus
  • Wedamutuwirus
  • Vendettawirus
  • Whulaniwirus
  • Widkwintawirus
  • Wirus
  • Vividuowirus
  • Wojwodinawirus
  • Wirus Waukesha
  • Wbetawirus
  • Wirus łasicy
  • Whackwirus
  • Wirus Whiteheada
  • Wirus dzikiego kota
  • Wilnyevirus
  • Czarodziejwirus
  • Woeswirus
  • Wirus marzanki leśnej
  • Xiamenwirus
  • Xipdekawirus
  • Wirus Yang
  • Wirus Yonsei
  • Yuawirus
  • wirus Yvonne
  • Zetawirus

Należy pamiętać, że rodzaj Inceonvirus to prawdopodobnie błędna pisownia Incheonvirus .

Linki zewnętrzne