Ceduowirus
Ceduovirus | |
---|---|
Klasyfikacja wirusów | |
(nierankingowe): | Wirus |
królestwo : | Duplodnaviria |
Królestwo: | Heunggongvirae |
Gromada: | Urowiricota |
Klasa: | Caudoviricetes |
Zamówienie: | Caudovirales |
Rodzina: | Siphoviridae |
Rodzaj: | Ceduowirus |
Ceduovirus (synonimy c2-podobne wirusy , c2-podobne fagi , C2likevirus ) to rodzaj wirusów z rodziny Siphoviridae , nieprzypisany do podrodziny. Bakterie służą jako naturalny gospodarz, a przenoszenie odbywa się poprzez bierną dyfuzję. Rodzaj ten obejmuje 34 gatunki.
Taksonomia
Rozpoznawane są następujące gatunki:
- Wirus Lactococcus 05802
- Wirus Lactococcus 20R03M
- Wirus Lactococcus 37203
- Wirus Lactococcus 50102
- Wirus Lactococcus 50504
- Wirus Lactococcus 5171F
- Wirus Lactococcus 62402
- Wirus Lactococcus 62403
- Wirus Lactococcus 62606
- Wirus Lactococcus bIBB14
- Wirus Lactococcus bIBBA3
- Wirus Lactococcus bIBBAm4
- Wirus Lactococcus bIBBE1
- Wirus Lactococcus bIBBL12
- Wirus Lactococcus bIBBp6-4
- Wirus Lactococcus bIL67
- Wirus Lactococcus blBB94p4
- Wirus Lactococcus c2
- Wirus Lactococcus CHPC116
- Wirus Lactococcus CHPC122
- Wirus Lactococcus CHPC966
- Wirus Lactococcus CHPC967
- Wirus Lactococcus CHPC972
- Wirus Lactococcus CHPC1020
- Wirus Lactococcus CHPC1170
- Wirus Lactococcus CHPC1182
- Wirus Lactococcus CHPC1183
- Wirus Lactococcus CHPC1242
- Wirus Lactococcus D4410
- Wirus Lactococcus D4412
- Wirus Lactococcus LacS15
- Wirus Lactococcus M5938
- Wirus Lactococcus PCB1
- Wirus Lactococcus PCS1
Struktura
Ceduowirusy są bezotoczkowe , z głową i ogonem. Wydłużona głowa ma około 56 nm długości i 41 nm szerokości i ma kołnierz. Ogon jest poprzecznie prążkowany, ma około 86-111 nm długości, 8 nm szerokości i ma krótkie włókna ogona. Genomy są liniowe, mają około 22 kb długości.
Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
---|---|---|---|---|---|
Ceduowirus | Orzeł reszka | T=7 | Bez koperty | Liniowy | jednoczęściowy |
Genom
Niektóre gatunki zostały w pełni zsekwencjonowane. Wynoszą one od 22k do 23k nukleotydów, z 37 do 39 białek. Pełne genomy są dostępne tutaj
Koło życia
Replikacja wirusa jest cytoplazmatyczna. Wirus przyczepia się do receptorów adhezyjnych komórki gospodarza za pomocą włókien końcowych, a wirusowa egzolizyna degraduje ścianę komórkową na tyle, aby wyrzucić wirusowe DNA do cytoplazmy gospodarza za pomocą systemu wyrzucania długiego, elastycznego ogona . Replikacja następuje po przemieszczeniu nici DNA za pomocą replikacyjnego modelu transpozycji. Transkrypcja na matrycy DNA jest metodą transkrypcji. Bakterie służą jako naturalny gospodarz. Drogi transmisji to dyfuzja pasywna.
Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ceduowirus | Bakteria | Nic | Zastrzyk | Liza | Cytoplazma | Cytoplazma | Bierna dyfuzja |
Historia
Według raportu ICTV z 1996 r. , rodzaj C2likevirus został po raz pierwszy zaakceptowany pod nazwą fagi c2-podobne , przypisane tylko do rodziny Siphoviridae . Cała rodzina została przeniesiona do nowo utworzonego rzędu Caudovirales w 1998 roku, a nazwa rodzaju została zmieniona na wirusy podobne do c2 w siódmym raporcie ICTV z 1999 roku. W 2012 roku nazwa rodzaju została ponownie zmieniona, tym razem na C2likevirus . Rodzaj został później przemianowany na Ceduovirus .