Mesoniviridae
Alphamesonivirus | |
---|---|
Mikrografia elektronowa zabarwionych ujemnie wirionów wirusa Nam Dinh (NDiV) Wirion | |
mesoniwirusa | |
Klasyfikacja wirusów | |
(nierankingowe): | Wirus |
królestwo : | Rybowiria |
Królestwo: | Orthornawirusy |
Gromada: | Pisuviricota |
Klasa: | Pisoniviricetes |
Zamówienie: | Nidowirusy |
Podrząd: | Mesnidovirineae |
Rodzina: | Mesoniviridae |
Podrodzina: | Hexponivirinae |
Rodzaj: | alfamesoniwirus |
Mesoniviridae to rodzina otoczkowych wirusów RNA o dodatniej nici z rzędu Nidovirales , które infekują komary . Nazwa rodziny pochodzi od wielkości genomów w stosunku do innych nidowirusów, przy czym meso- pochodzi od greckiego słowa mesos , co oznacza medium, a -ni jest skrótem od nido .
Historia
Rodzina jest stosunkowo nowa, została odkryta dopiero w 2011 roku. Pierwszy wirus, nazwany wirusem Nam Dinh , został znaleziony w wietnamskiej prowincji Nam Định . Drugi wirus, nazwany wirusem Cavally , został następnie znaleziony na Wybrzeżu Kości Słoniowej . Później okazało się, że te dwa wirusy należą do tego samego gatunku. Trzeci członek tego pierwszego gatunku, nazwany wirusem Dak Nong , został później znaleziony w populacjach Culex tritaeniorhynchus w Wietnamie. W 2013 roku odkryto cztery kolejne mesoniwirusy w populacjach komarów, wszystkie na Wybrzeżu Kości Słoniowej, aw 2014 cztery mesoniwirusy odkryto w populacjach komarów w Australii, Indonezji i Tajlandii.
Wirusologia
Struktura
Członkowie tej rodziny są otoczeni, mają kulisty kształt i średnicę 60–80 nm z kolcami powierzchniowymi w kształcie maczugi. Istnieje osiem głównych białek strukturalnych, w tym białko nukleokapsydu (masa 25 kDa), cztery różnie glikozylowane formy białka błonowego (20, 19, 18 i 17 kDa) oraz białko kolca (S) (77 kDa), które jest rozszczepione w celu wytworzenia dwóch podjednostek białka S (23 i 57 kDa).
Genom
Genomy są liniowe, policistronowe , jednoniciowe RNA o dodatniej czułości i mają długość około 20 000 nukleotydów, z ogonem poli(A) 3' i siedmioma głównymi otwartymi ramkami odczytu (ORF). Dwie nakładające się ORF, razem znane jako ORF1ab , znajdują się na końcu 5' i kodują główne białka niestrukturalne i są wyrażane jako białko fuzyjne przez rybosomalne przesunięcie ramki odczytu . ORF 1a i 1b zawierają sześć replikazy , jak również egzorybonukleazę 3'-5' (ExoN), który kontroluje wierność replikacji RNA i 2'-O-metylotransferazę , z których oba znajdują się w większych nidowirusach. ORF 1b koduje również N7-metylotransferazę .
Taksonomia
Mesoniviridae jest członkiem rzędu Nidovirales , rzędu wirusów +ssRNA z żywicielami zwierzęcymi. Rodzina ma tylko jedną podrodzinę, Hexponivirinae , która zawiera tylko jeden rodzaj, Alphamesonivirus . Istnieje 8 podrodzaje i 10 gatunków w Alphamesonivirus :
-
alfamesoniwirus
-
Casualivirus
- Alphamesonivirus 4
-
Enselivirus
- Alphamesonivirus 8
-
Hanalivirus
- Alphamesonivirus 5
-
Kadilivirus
- Alphamesonivirus 7
-
Karsaliwirus
- Alfamesoniwirus 2
- Alfamesoniwirus 3
-
Menoliwirus
- Alfamesoniwirus 9
-
Namcaliwirus
- Alfamesoniwirus 1
- Alfamesoniwirus 10
-
Ofaliwirus
- Alfamesoniwirus 6
-
Casualivirus
Odkrycie i analiza filogenetyczna czterech dodatkowych mesoniwirusów w 2013 roku, nazwanych wirusem Hana, wirusem Méno, wirusem Nsé i wirusem Moumo, sugeruje, że reprezentują one co najmniej trzy nowe gatunki mesoniwirusów. Ponadto w 2014 roku w Australii, Indonezji i Tajlandii odkryto cztery potencjalnie nowe gatunki, nazwane odpowiednio wirusem Casuarina, wirusem Karang Sari, wirusem Bontag Baru i wirusem Kamphaeng Phet.