Model Bueno-Orovio-Cherry-Fentona

Model Bueno-Orovio-Cherry-Fenton , zwany także po prostu modelem Bueno-Orovio , jest minimalnym modelem jonowym dla ludzkich komórek komorowych . Należy do kategorii modeli fenomenologicznych , ze względu na swoją charakterystykę opisu zachowania elektrofizjologicznego komórek mięśnia sercowego bez szczegółowego uwzględnienia fizjologii leżącej u podstaw i specyficznych mechanizmów zachodzących wewnątrz komórek.

Ten model matematyczny odtwarza zarówno pojedyncze komórki , jak i ważne właściwości na poziomie tkanki , uwzględniając rozwój fizjologicznego potencjału czynnościowego i szacunki prędkości przewodzenia . Zapewnia również wybór określonych parametrów, pochodzących z algorytmów dopasowywania parametrów MATLAB Optimization Toolbox , do modelowania tkanek nasierdzia, wsierdzia i mięśnia sercowego . W ten sposób możliwe jest dopasowanie morfologii potencjału czynnościowego, obserwowanych na podstawie danych eksperymentalnych, w trzech różnych obszarach ludzkich komór. Model Bueno-Orovio-Cherry-Fentona jest również w stanie opisać dynamikę fali zwrotnej i spiralnej , która występuje na przykład podczas tachykardii lub innych typów zaburzeń rytmu serca .

Z matematycznego punktu widzenia składa się z układu czterech równań różniczkowych . Jedno PDE , podobne do modelu jednodomenowego , dla bezwymiarowej wersji potencjału transbłonowego oraz trzy ODE , które definiują ewolucję tzw . zmiennych bramkujących , czyli funkcji gęstości prawdopodobieństwa , których celem jest modelowanie frakcji otwartych kanałów jonowych w komórce membrana .

Modelowanie matematyczne

Ewolucja tylko w czasie (tj. przypadek pojedynczej komórki serca) zmiennych modelu jonowego Bueno-Orovio

Układ czterech równań różniczkowych brzmi następująco:

gdzie domena przestrzenna, a ostateczny Warunki początkowe są następujące : , , , .

odnosi się do funkcji Heaviside wyśrodkowanej w . potencjał przeskalować mV pomocą afinicznej _ , i odnoszą się do zmiennych bramkowania, gdzie w szczególności być również używane jako wskazanie wewnątrzkomórkowego wapnia stężenie (podane w awymiarowym zakresie [0, 1] zamiast stężenia molowego ).

szybkimi prądami do wewnątrz, wolnymi na zewnątrz i wolnymi do wewnątrz , następującymi :

Wszystkie wyżej wymienione prądy gęstości jonowej są częściowo bezwymiarowe i są wyrażane w ciągu .

Różne zestawy parametrów, jak pokazano w Tabeli 1, można wykorzystać do odtworzenia rozwoju potencjału czynnościowego ludzkich komórek komorowych nasierdzia, wsierdzia i środkowej części mięśnia sercowego. Istnieją pewne stałe modelu, których nie ma w Tabeli 1, które można wywnioskować za pomocą następujących wzorów:

gdzie stałe czasowe, tj. są wyrażone w sekundach, podczas gdy i są dwuwymiarowe .

Współczynnik dyfuzji wartość , który pochodzi z testów eksperymentalnych na ludzkich tkankach komorowych.

Aby wywołać rozwój potencjału czynnościowego w określonej pozycji domeny , wymuszający termin , który reprezentuje przyłożony zewnętrznie prąd gęstości, jest zwykle dodawany po prawej stronie PDE i działa tylko przez krótki okres czasu.

Tabela 1: wartości parametrów dla różnych położeń serca człowieka
Parametr
Jedność miary - - - - - - sekundy sekundy sekundy sekundy sekundy - - sekundy sekundy sekundy sekundy sekundy sekundy - - sekundy sekundy - - sekundy - -
nasierdzie 0 1,55 0,3 0,13 0,006 0,006 60e-3 1150e-3 1.4506e-3 60e-3 15e-3 65 0,03 200e-3 0.11e-3 400e-3 6e-3 30.0181e-3 0,9957e-3 2.0458 0,65 2.7342e-3 16e-3 2,0994 0,9087 1.8875e-3 0,07 0,94
wsierdzie 0 1,56 0,3 0,13 0,2 0,006 75e-3 10e-3 1.4506e-3 6e-3 140e-3 200 0,016 280e-3 0.1e-3 470e-3 6e-3 40e-3 1.2e-3 2 0,65 2.7342e-3 2e-3 2,0994 0,9087 2.9013e-3 0,0273 0,78
mięśnia sercowego 0 1.61 0,3 0,13 0,1 0,005 80e-3 1.4506e-3 1.4506e-3 70e-3 8e-3 200 0,016 280e-3 0,078e-3 410e-3 7e-3 91e-3 0,8e-3 2.1 0,6 2.7342e-3 4e-3 2,0994 0,9087 3.3849e-3 0,01 0,5

Słaby preparat

Załóżmy, że się do wektora zawierającego wszystkie zmienne bramkowania, tj. _ _ odpowiednie trzy prawe strony modelu jonowego. Model Bueno-Orovio – Cherry – Fenton można przepisać w postaci zwartej:

Niech i będą dwiema ogólnymi funkcjami testowymi.

Aby otrzymać słaby preparat :

  • pomnóż przez pierwsze równanie modelu i przez równania ewolucji zmienne bramkujące. Całkowanie obu elementów wszystkich równań :

Wreszcie słabe sformułowanie brzmi:

Znajdź i , , tak że

Dyskretyzacja numeryczna

Istnieje kilka metod dyskretyzacji w przestrzeni tego układu równań, takich jak metoda elementów skończonych (MES) czy analiza izogeometryczna (IGA).

Dyskretyzację czasu można również przeprowadzić na kilka sposobów, na przykład za pomocą różniczkowania wstecznego (BDF) rzędu metody Runge-Kutty (RK).

Dyskretyzacja przestrzeni za pomocą MES

Niech teselacją domeny obliczeniowej pomocą określonego typu elementów ( lub sześciany ) , z reprezentujący wybraną miarę wielkości pojedynczego elementu . Rozważmy wielomianów stopniu mniejszym nad _ Zdefiniuj wymiar przestrzeń, której wymiar to . Zbiór funkcji bazowych jako .

Półdyskretyzowane sformułowanie pierwszego równania modelu brzmi: znajdź t na , } takie że

z , półdyskretyzowana wersja trzech zmiennych bramkujących i to prąd o całkowitej gęstości jonowej.

nieliniowych i :

gdzie , i .

jon można traktować na różne sposoby, na przykład za pomocą interpolacji zmiennej stanu (SVI) lub interpolacji prądów jonowych (ICI). W ramach SVI, oznaczając za pomocą i { węzły kwadraturowe i wagi ogólnego elementu siatki, , jak i są oceniane w węzłach kwadraturowych:

Równania dla trzech zmiennych bramkowania, które są ODE, są bezpośrednio rozwiązywane we wszystkich stopniach swobody (DOF) teselacji oddzielnie, co prowadzi do następującego postać półdyskretna:

Dyskretyzacja czasu za pomocą BDF (schemat niejawny)

odniesieniu do przedziału czasu będzie krokiem czasu, z liczbą podział w czasie .

Na tym etapie pełna dyskretyzacja modelu jonowego Bueno-Orovio może być przeprowadzona zarówno w sposób monolityczny, jak i segregowany. W do pierwszej metodologii (monolitycznej), w czasie aby pomocą albo metoda Newtona , albo iteracje punktu stałego :

gdzie i są ekstrapolacjami potencjału transbłonowego i zmiennych bramkowania w poprzednich krokach czasowych w odniesieniu do , biorąc pod uwagę tyle czasu momenty jako kolejność . jest współczynnikiem, który zależy od rzędu BDF .

Jeśli stosuje się metodę segregacji, równania ewolucji w czasie potencjału transbłonowego i równania zmiennych bramkujących są rozwiązywane numerycznie oddzielnie:

  • + jest obliczany przy użyciu ekstrapolacji w poprzednich krokach czasowych dla potencjału transbłonowego po prawej stronie:
  • , się Z została obliczona:

Innym możliwym segregowanym schematem byłby ten, w którym najpierw oblicza się , a następnie używa się go w równaniach dla .

Zobacz też