Perydynina

Perydynina

Nazwy
nazwa IUPAC Kwas octowy [(1 S ,3 R )-3-hydroksy-4-[(3 E ,5 E ,7 E ,9 E ,11 Z )-11-[4-[( E )-2-[(1 S ,4S ,6R ) -4-hydroksy-2,2,6-trimetylo-7-oksabicyklo[4.1.0]heptan-1-ylo]winylo]-5-okso-2-furylideno] -3,10 -dimetyloundeka-1,3,5,7,9-pentaenylideno]-3,5,5-trimetylocykloheksylo] ester
Identyfikatory
Numer CAS	33281-81-1   T
Model 3D ( JSmol )	Interaktywny obraz
Identyfikator klienta PubChem	5289155
Pulpit nawigacyjny CompTox ( EPA )	DTXSID20903948
UŚMIECH [H][C@@](/[C@@](C)=C/C=C/C=C/C=C(C)/C=C2C=C(/C=C/[C@ @]3(O4)[C@]4(C)C[C@@H](O)CC(C)3C)C(O\2)=O)=C=C1[C@](C) (O)C[C@@H](OC(C)=O)CC(C)1C
Nieruchomości
Wzór chemiczny	C 39 H 50 O 7
Masa cząsteczkowa	630,822 g·mol -1
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa).   Y ( co to jest Y N ?) Referencje w infoboksie

Perydynina jest apokarotenoidem zbierającym światło , pigmentem związanym z chlorofilem i znajdującym się w kompleksie zbierającym światło perydynina-chlorofil-białko (PCP) w wiciowcach , najlepiej zbadanym w Amphidinium carterae .

Znaczenie biologiczne

Struktura krystaliczna rozpuszczalnego kompleksu perydynina-chlorofil-białko z fotosyntetycznego wiciowca Amphidinium carterae . Kompleks ten występuje w wielu fotosyntetycznych bruzdnicach i obejmuje białko w kształcie łódki lub kołyski z dwoma pseudosymetrycznymi powtórzeniami ośmiu helis alfa (pokazanych na niebiesko i pomarańczowo) owiniętych wokół wypełnionej pigmentem centralnej jamy. Każdy segment z ośmioma helisami wiąże jedną cząsteczkę chlorofilu (zielona, ​​z centralnym jonem magnezu pokazanym jako zielona kula), jedną cząsteczkę diacyloglicerolu (żółta) i cztery cząsteczki perydyniny (szare).

Perydynina jest pigmentem apokarotenoidowym , który niektóre organizmy wykorzystują w fotosyntezie . Wiele fotosyntetycznych bruzdnic wykorzystuje perydyninę, która pochłania niebiesko-zielone światło w zakresie 470-550 nm, poza zasięgiem dostępnym dla cząsteczek chlorofilu . Kompleks perydynina -chlorofil-białko jest wyspecjalizowanym kompleksem molekularnym składającym się z cząsteczki białka w kształcie łódki z dużą centralną wnęką, która zawiera cząsteczki perydyniny, chlorofilu i lipidów, zwykle w stosunku perydyniny do chlorofilu 4: 1.

Charakterystyka widmowa

Widma emisyjne i wzbudzenia chlorofilu perydyniny (PerCP)

• Maksimum absorpcji: 483 nm
• Maksymalna emisja: 676 nm
• Współczynnik ekstynkcji (ε): 1,96 x 10 ⁶ M ^-1 cm ^-1
• A ₄₈₃ /A ₂₈₀ ≥ 4,6

Aplikacje

Chlorofil perydyniny (PerCP) jest powszechnie stosowany w testach immunologicznych , takich jak sortowanie komórek aktywowane fluorescencją (FACS) i cytometria przepływowa . Fluorofor jest kowalencyjnie połączony z białkami lub przeciwciałami do zastosowań badawczych.