XYLT1

Identyfikatory
XYLT1
	, DBQD2, PXT-I, XT1, XTI, XYLTI, xylT-I, ksylozylotransferaza 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	nie dotyczy
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Ksylozylotransferaza 1 jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen XYLT1 .

Ksylozylotransferaza (XT; EC 2.4.2.26) katalizuje przeniesienie UDP-ksylozy na reszty serynowe w obrębie sekwencji rozpoznawanych przez XT białek docelowych. Dodatek tej ksylozy do białka rdzeniowego jest wymagany do biosyntezy łańcuchów glikozaminoglikanów charakterystycznych dla proteoglikanów . [dostarczone przez OMIM]

Znaczenie kliniczne

Zespół Barateli-Scotta

W 2012 roku zespół Barateli-Scotta został zidentyfikowany u ludzi. Ekspansja powtórzeń GGC i metylacja eksonu 1 XYLT1 jest powszechnym wariantem patogennym w zespole Baratela-Scott .

Pacjenci z zespołem Bartarlla-Scott wykazują nieprawidłowy rozwój szkieletu , charakterystyczne rysy twarzy i opóźnienie rozwoju poznawczego. Problemy ze szkieletem obejmują rzepkę w niewłaściwej pozycji , krótkie kości długie z łagodnymi zmianami w wąskiej części , krótkie kości dłoni z krótkimi kciukami, krótkie szyje uda , płytkie stawy biodrowe i wady rozwojowe kręgosłupa. Charakterystyczne rysy twarzy to spłaszczona środkowa część twarzy z szeroką grzbiet nosa , rozszczep podniebienia i jednobrew . Zespół ten powoduje również przedszkolne opóźnienie rozwoju poznawczego, ze skróconym okresem uwagi. Niektóre opóźnienia poznawcze są maskowane przez ciepłą i ujmującą osobowość.

rozszerzenie aksonu

Neurony wykorzystują obecność cząsteczek macierzy pozakomórkowej jako wskazówki, czy promować, czy hamować wydłużanie aksonów. Proteoglikany siarczanu chondroityny hamują rozszerzanie się aksonów nad blizną glejową, barierą, która rozwija się po uszkodzeniu rdzenia kręgowego. Proteoglikany składają się z jednego stosunkowo małego rdzenia białkowego i przyłączonych dużych łańcuchów bocznych glikozaminoglikanów. Aby zablokować samo tworzenie tych łańcuchów bocznych, ksylozylotransferaza (XYLT1), która przyłącza ksylozę do seryny rdzenia białkowego jako inicjacja wydłużania łańcucha glikozaminoglikanu, była celem klasy zaprojektowanych cząsteczek DNA. Cząsteczki te nazywane są enzymami DNA, które zostały zaprojektowane do specyficznego rozszczepiania mRNA XYLT1 w komórkach. Enzymy DNA są łatwo pobierane przez komórki ssaków, ale są bardziej stabilne i wymagają znacznie niższych stężeń niż siRNA. Enzym DNA XTYL1 we wspólnych hodowlach neuronów z komórkami wydzielającymi neurokan wykazywał wyraźny wzrost wzrostu aksonów. Szczury ze zdefiniowanymi uszkodzeniami rdzenia kręgowego, m.in. klinicznie istotnym urazem stłuczenia, leczone enzymem DNA XTYL1 podawanym za pomocą pomp mikroinfuzyjnych lub systemowo osiągane ulepszenia w zadaniu drabiny poziomej, zwiększona plastyczność aksonów, wzrost przewodu korowo-rdzeniowego, brak wpływu na neuropatyczne ból podczas stosowania mechanicznych i termicznych testów na allodynię oraz brak toksykologicznych lub patologicznych skutków ubocznych w porównaniu ze zwierzętami kontrolnymi.{{Oudega M, Chao OY, Avison DL, Bronson RT, Buchser WJ, Hurtado A, Grimpe B. (2012) dezoksyrybozym do mRNA ksylozylotransferazy-1 wspomaga powrót do zdrowia po urazie rdzenia kręgowego Exp Neurol. wrz;237(1):170-9. doi: 10.1016/j.expneurol.2012.06.006. PMID: 22721770}}

Dalsza lektura

Götting C, Sollberg S, Kuhn J i in. (1999). "Ksylozylotransferaza surowicy: nowy marker biochemiczny procesu sklerotycznego w twardzinie układowej" . J. Inwestuj. Dermatol . 112 (6): 919–24. doi : 10.1046/j.1523-1747.1999.00590.x . PMID 10383739 .
Kuhn J, Götting C, Schnölzer M i in. (2001). „Pierwsza izolacja ludzkiej UDP-D-ksylozy: białko rdzeniowe proteoglikanu beta-D-ksylozylotransferaza wydzielana z hodowanych komórek raka kosmówki JAR” . J. Biol. chemia . 276 (7): 4940–7. doi : 10.1074/jbc.M005111200 . PMID 11087729 .
Götting C, Kuhn J, Brinkmann T, Kleesiek K (2002). „Aktywność ksylozylotransferazy w osoczu nasienia niepłodnych mężczyzn”. Clin. Chim. Akta . 317 (1–2): 199–202. doi : 10.1016/S0009-8981(01)00793-8 . PMID 11814476 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Götting C, Müller S, Schöttler M i in. (2004). „Analiza motywów DXD w ludzkiej ksylozylotransferazie I wymaganej do aktywności enzymu” . J. Biol. chemia . 279 (41): 42566–73. doi : 10.1074/jbc.M401340200 . PMID 15294915 .
Müller S, Schöttler M, Schön S i in. (2005). „Ludzka ksylozylotransferaza I: funkcjonalna i biochemiczna charakterystyka reszt cysteiny wymaganych do aktywności enzymatycznej” . Biochem. J. _ 386 (część 2): 227–36. doi : 10.1042/BJ20041206 . PMC 1134786 . PMID 15461586 .
Götting C, Hendig D, Adam A i in. (2006). „Podwyższona aktywność ksylozylotransferazy I u pacjentów z pseudoxanthoma elasticum (PXE) jako marker stymulowanej biosyntezy proteoglikanów”. J. Mol. Med . 83 (12): 984–92. doi : 10.1007/s00109-005-0693-x . PMID 16133423 . S2CID 9907867 .
Schön S, Prante C, Müller S i in. (2005). „Wpływ polimorfizmów w genach kodujących ksylozylotransferazę I i homolog u pacjentów z cukrzycą typu 1 z nefropatią i bez” . Nerki Int . 68 (4): 1483–90. doi : 10.1111/j.1523-1755.2005.00561.x . PMID 16164625 .
Müller S, Disse J, Schöttler M, et al. (2006). „Ludzka ksylozylotransferaza I i N-końcowe formy skrócone: charakterystyka funkcjonalna enzymu rdzeniowego” . Biochem. J. _ 394 (część 1): 163–71. doi : 10.1042/BJ20051606 . PMC 1386014 . PMID 16225459 .
Schön S, Prante C, Bahr C i in. (2006). „Klonowanie i rekombinacja ekspresji aktywnej pełnej długości ksylozylotransferazy I (XT-I) i charakterystyka lokalizacji subkomórkowej XT-I i XT-II” . J. Biol. chemia . 281 (20): 14224–31. doi : 10.1074/jbc.M510690200 . PMID 16569644 .
Schön S, Schulz V, Prante C i in. (2007). „Polimorfizmy w genach ksylozylotransferazy powodują wyższą aktywność XT-I w surowicy u pacjentów z pseudoxanthoma elasticum (PXE) i są zaangażowane w ciężki przebieg choroby” . J. Med. Genet . 43 (9): 745–9. doi : 10.1136/jmg.2006.040972 . PMC 2593031 . PMID 16571645 .
Prante C, Bieback K, Funke C i in. (2006). „Tworzenie macierzy pozakomórkowej podczas różnicowania chondrogennego mezenchymalnych komórek macierzystych koreluje ze zwiększonym poziomem ksylozylotransferazy I”. Komórki macierzyste . 24 (10): 2252–61. doi : 10.1634/stemcells.2005-0508 . PMID 16778156 . S2CID 40255873 .
Schön S, Prante C, Bahr C i in. (2007). „Polimorfizm genu ksylozylotransferazy I c.343G> T (p.A125S) jest czynnikiem ryzyka nefropatii cukrzycowej w cukrzycy typu 1” . Opieka nad cukrzycą . 29 (10): 2295–9. doi : 10.2337/dc06-0344 . PMID 17003309 .
Cuellar K, Chuong H, Hubbell SM, Hinsdale ME (2007). „Biosynteza chondroityny i siarczanu heparanu w komórkach jajnika chomika chińskiego zależy od ksylozylotransferazy II” . J. Biol. chemia . 282 (8): 5195–200. doi : 10.1074/jbc.M611048200 . PMID 17189266 .
Prante C, Milting H, Kassner A i in. (2007). „Przekształcanie aktywności ksylozylotransferazy I regulowanej przez czynnik wzrostu beta1 w ludzkich fibroblastach sercowych i jej wpływ na przebudowę mięśnia sercowego” . J. Biol. chemia . 282 (36): 26441–9. doi : 10.1074/jbc.M702299200 . PMID 17635914 .
Grimpe B, Pressman Y, Lupa MD, Horn KP, Bunge MB, Silver J (2005). „Rola proteoglikanów w interakcjach komórka Schwanna / astrocyt oraz w niepowodzeniu regeneracji na stykach PNS / OUN”. Neuronauka molekularna i komórkowa . 28 (1): 18–29. doi : 10.1016/j.mcn.2004.06.010 . PMID 15607938 . S2CID 38001196 .
Hurtado A, Podini H, Oudega M, Grimpe B (2008). „Knockdown mRNA ksylozylotransferazy-1 za pośrednictwem dezoksyrybozymu sprzyja wzrostowi aksonów w rdzeniu kręgowym dorosłego szczura” . Mózg . 131 (10): 2596–605. doi : 10.1093/mózg/awn206 . PMID 18765417 .
Koenig B, Pape D, Chao O, Bauer J, Grimpe B (2016). „Długoterminowe badanie podawania dezoksyrybozymu mRNA XT-1 sprzyja regeneracji układu korowo-rdzeniowego i poprawia wyniki behawioralne po urazie rdzenia kręgowego”. Neurologia Eksperymentalna . 276 : 51–58. doi : 10.1016/j.expneurol.2015.09.015 . PMID 26428904 . S2CID 10575072 .
Oudega M, Chao OY, Avison DL, Bronson RT, Buchser WJ, Hurtado A, Grimpe B (2012). „Ogólnoustrojowe podawanie dezoksyrybozymu do mRNA ksylozylotransferazy-1 sprzyja regeneracji po urazie rdzenia kręgowego”. Neurologia Eksperymentalna . 237 (1): 170–179. doi : 10.1016/j.expneurol.2012.06.006 . PMID 22721770 . S2CID 34942901 .