Bocaparwowirus
| Klasyfikacja wirusów | |
|---|---|
| Bocaparvovirus | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Monodnaviria |
| Królestwo: | Shotokuvirae |
| Gromada: | Cossaviricota |
| Klasa: | Quintoviricetes |
| Zamówienie: | Piccovirales |
| Rodzina: | Parvoviridae |
| Podrodzina: | Parwowirinae |
| Rodzaj: | Bocaparwowirus |
| Gatunki | |
Bocaparvovirus to rodzaj wirusów z podrodziny Parvovirinae z rodziny wirusów Parvoviridae . Ludzie, bydło i psy służą jako naturalni gospodarze. Istnieje 28 gatunków w tym rodzaju. Choroby związane z tym rodzajem obejmują u ludzi ostrą chorobę układu oddechowego, a u bydła biegunkę i łagodne objawy ze strony układu oddechowego.
Historia
Bocawirusy zostały po raz pierwszy opisane u zwierząt na początku lat 60.
Genom
Podobnie jak inni członkowie tej rodziny, bocaparwowirusy mają dwie otwarte ramki odczytu — ORF1 i 2. Unikalne wśród parwowirusów, bocaparwowirusy zawierają trzecią otwartą ramkę odczytu między niestrukturalnymi i strukturalnymi regionami kodującymi. Gen ten koduje wysoce ufosforylowane białko niestrukturalne (NP1).
ORF1 koduje niestrukturalne białko (NS1), które bierze udział w replikacji genomu wirusa. ORF2 koduje dwa białka kapsydu - VP1 i VP2.
Podobnie jak inne parwowirusy, unikalny region VP1 zawiera motyw fosfolipazy A(2) z konserwowanym motywem histydyny – kwasu asparaginowego -XXY w centrum katalitycznym.
Taksonomia
Do rodzaju przypisano 28 gatunków:
- Mięsożerne bokaparwowirusy 1
- Mięsożerne bokaparwowirusy 2
- Mięsożerne bokaparwowirusy 3
- Mięsożerne bokaparwowirusy 4
- Mięsożerne bokaparwowirusy 5
- Mięsożerne bokaparwowirusy 6
- Chiropteran bocaparwowirus 1
- Chiropteran bocaparwowirus 2
- Chiropteran bocaparwowirus 3
- Chiropteran bocaparwowirus 4
- Chiropteran bocaparwowirus 5
- Bocaparwowirus zajęczaków 1
- Bocaparwowirus płetwonogich 1
- bocaparwowirus płetwonogich 2
- Bocaparwowirus naczelnych 1
- bocaparwowirus naczelnych 2
- bokaparwowirus naczelnych 3
- Bokaparwowirus gryzoni 1
- Bokaparwowirus gryzoni 2
- Bocaparwowirus zwierząt kopytnych 1
- Bokaparwowirus zwierząt kopytnych 2
- Bokaparwowirus zwierząt kopytnych 3
- Bokaparwowirus zwierząt kopytnych 4
- Bokaparwowirus zwierząt kopytnych 5
- kopytny bocaparwowirus 6
- Bokaparwowirus zwierząt kopytnych 7
- Bokaparwowirus zwierząt kopytnych 8
- kopytny bocaparwowirus 9
Szczegóły wirusa
W Parvoviridae gatunki są obecnie ogólnie definiowane jako skupisko wirusów, które kodują białka inicjujące replikację (zwane NS1), które mają sekwencje aminokwasowe, które są co najmniej w 85% identyczne z sekwencjami kodowanymi przez wszystkich innych członków gatunku.
Świstaki zostały również zidentyfikowane jako gospodarze nowych bocaparwowirusów.
Wirusologia
Bocawirusy bydlęce wykorzystują endocytozę w pęcherzykach pokrytych klatryną, aby dostać się do komórek; są zależne od zakwaszenia i wydają się być związane z zależnością od aktyny i mikrotubul.
Wszystkie bocaparwowirusy kodują nowe białko o nazwie NP1, które nie występuje w parwowirusach z innych rodzajów. Wykazano, że w psim wirusie minutowym NP1 jest niezbędny do wczesnego etapu replikacji wirusa i jest również wymagany do odczytania wewnętrznego miejsca poliadenylacji, które jest niezbędne do ekspresji białek kapsydu.
Koło życia
Replikacja wirusa jest jądrowa. Wejście do komórki gospodarza uzyskuje się przez przyłączenie do receptorów gospodarza, co pośredniczy w endocytozie, w której pośredniczy klatryna. Replikacja jest zgodna z modelem toczącej się spinki do włosów. Metodą transkrypcji jest transkrypcja na matrycy DNA, z pewnym alternatywnym mechanizmem składania. Wirus opuszcza komórkę gospodarza przez eksport porów jądrowych. Naturalnymi gospodarzami są ludzie, bydło i psy. Drogi przenoszenia są ustne i oddechowe.
| Rodzaj | Dane gospodarza | Tropizm tkankowy | Szczegóły wpisu | Szczegóły wydania | Miejsce replikacji | Miejsce montażu | Przenoszenie |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bocaparwowirus | ludzie; krowy; psy | Nic | Endocytoza za pośrednictwem klatryny | wczesne uwalnianie z żywych komórek i liza komórek | Jądro | Jądro | Aerosol |
Kliniczny
Wirusy te na ogół infekują układ pokarmowy i oddechowy. Niektóre mogą przenikać przez łożysko i powodować wrodzone zakażenie płodu.
Wirus psiej minuty , po raz pierwszy wyizolowany w 1967 r. i powiązany z chorobą w 1970 r., powoduje choroby układu oddechowego z trudnościami w oddychaniu i zapaleniem jelit z ciężką biegunką, samoistnymi poronieniami płodów i śmiercią nowonarodzonych szczeniąt.
Ludzkie bocawirusy zostały po raz pierwszy wyizolowane w 2005 roku w Szwecji . Mogą być w stanie wywołać zapalenie wątroby u gospodarza z obniżoną odpornością.
Bocaparwowirusy zostały wyizolowane z ludzkiego raka okrężnicy i płuc. Kliniczne znaczenie tego odkrycia — jeśli w ogóle — dopiero się okaże.
Częstość występowania bokawirusa u pacjentów z rakiem jest wyższa niż u zdrowych osób z grupy kontrolnej.
Struktura
Podobnie jak inne parwowirusy, bocaparwowirusy mają dwudziestościenną i okrągłą strukturę z symetrią T=1. Kapsyd nie jest otoczony i składa się z 60 kopii do sześciu rodzajów białek kapsydu (zwanych od VP1 do VP6), które mają wspólny region C-końcowy. Strukturę wirusopodobnej cząstki złożonej wyłącznie z białka VP2 określono za pomocą kriogenicznej mikroskopii elektronowej i rekonstrukcji obrazu. Średnica wynosi około 21-22 nm. Genomy są liniowe, mają około 5,5 kb długości
| Rodzaj | Struktura | Symetria | Kapsyd | Układ genomowy | Segmentacja genomu |
|---|---|---|---|---|---|
| Bocaparwowirus | dwudziestościenny | T=1 | Bez koperty | Liniowy | Nic |
Linki zewnętrzne
- Strefa wirusowa : bokaparwowirus
- [1] Bokaparwowirus ICTV 2018 ]