Diazyryna

Diazyryna
Diazirin - Diazirine.svg
3H-Diazirine-3D-balls.png
Identyfikatory
Model 3D ( JSmol )
605387
CHEBI
ChemSpider
Identyfikator klienta PubChem
  • InChI=1S/CH2N2/c1-2-3-1/h1H2
    Klucz: GKVDXUXIAHWQIK-UHFFFAOYSA-N
  • 3H: C1N=N1
Nieruchomości
C H 2 N 2
Masa cząsteczkowa 42,041 g · mol -1
Związki pokrewne
Związki pokrewne
1H-diazyren
O ile nie zaznaczono inaczej, dane podano dla materiałów w stanie normalnym (przy 25°C [77°F], 100 kPa).
Ogólna diazyryna

W chemii organicznej diazyryny to klasa cząsteczek organicznych składających się z węgla związanego z dwoma atomami azotu , które są ze sobą połączone wiązaniami podwójnymi , tworząc pierścień podobny do cyklopropenu , 3H -diazyren ( >CN 2 ). Są izomeryczne z grupami diazowęglowymi ( >C=N=N ) i podobnie jak one mogą służyć jako prekursory karbenów poprzez utratę cząsteczki diazotu. Na przykład napromieniowanie diazyryn światłem ultrafioletowym prowadzi do wstawienia karbenu w różne wiązania C-H , N-H i OH . W związku z tym diazyryny zyskały na popularności jako małe, fotoreaktywne , sieciujące odczynniki. Są one często wykorzystywane w znakowania fotopowinowactwa do obserwacji różnych interakcji, w tym interakcji ligand -receptor, ligand- enzym , białko-białko i białko- kwas nukleinowy .

Synteza

W literaturze istnieje wiele sposobów wytwarzania diazyryn, które rozpoczynają się od różnych odczynników.

Synteza z ketonów

Ogólnie schematy syntezy rozpoczynające się od ketonów ( >C=O ) obejmują konwersję ketonu z żądanymi podstawnikami do diazyrydyn ( >CN 2 H 2 ). Te diazirideny są następnie utleniane z wytworzeniem pożądanych diazyryn.

Diazyrydyny można wytworzyć z ketonów przez oksymację, następnie tosylację (lub mesylację ), a na końcu przez traktowanie amoniakiem ( NH 3 ). Ogólnie reakcje oksymowania przeprowadza się w reakcji ketonu z chlorkiem hydroksyloamoniowym ( NH 3 OH - Cl + ) w warunkach ogrzewania w obecności zasady, takiej jak pirydyna . Późniejsze tosylowanie lub mesylowanie alfa-podstawionego tlenu tosylu lub mesylu w obecności zasady daje oksym tosylu lub mesylu . Ostateczna obróbka oksymu tosylu lub mesylu amoniakiem daje diazyrydynę.

Ogólna synteza diazyrydyny przez oksymowanie, tosylowanie i traktowanie amoniakiem.

Diazyrydyny można również wytwarzać bezpośrednio w reakcji ketonów z amoniakiem w obecności środka aminującego , takiego jak monochloramina lub hydroksyloamina, kwas O-sulfonowy.

Diazyrydyny można utleniać do diazyryn wieloma metodami. Obejmują one utlenianie chromu , takie jak utlenianie Jonesa , utlenianie jodem i trietyloaminą , utlenianie tlenkiem srebra , utlenianie chlorkiem oksalilu, a nawet utlenianie elektrochemiczne na anodzie platynowo-tytanowej.

Utlenianie Jonesa generycznej diazyrydyny do diazyryny.

Synteza w reakcji Grahama

Diazyryny można alternatywnie wytwarzać w procesie jednonaczyniowym, stosując reakcję Grahama , wychodząc z amidyn . Ta reakcja daje fluorowcowaną diazyrynę, której halogen można zastąpić różnymi odczynnikami nukleofilowymi .

Reakcja Grahama jako metoda syntezy diazyryny, gdzie X = Cl lub Br.
Reakcja wymiany diazyryny z użyciem różnych anionów i przeciwjonu tetra-n-butyloamoniowego.

Chemia

Po napromieniowaniu światłem UV diazyryny tworzą reaktywne formy karbenów . Karben może występować w postaci singletowej, w której dwa wolne elektrony zajmują ten sam orbital lub w formie trypletowej, z dwoma niesparowanymi elektronami na różnych orbitalach.

Diazyryny można rozkładać za pomocą światła UV.

Produkty karbenowe Triplet vs Singlet

Podstawniki na diazyrynie wpływają na to, które rodzaje karbenów są generowane po napromieniowaniu i późniejszym rozszczepieniu fotolitycznym. Podstawniki diazyrynowe, które z natury są donorami elektronów, mogą przekazywać gęstość elektronów pustemu p-orbitalowi karbenu, który zostanie utworzony, a zatem mogą stabilizować stan singletowy. Na przykład fenylodiazyryna wytwarza fenylokarben w stanie singletowego karbenu, podczas gdy p-nitrofenylochlorodiazyryna lub trifluorofenylodiazyryna wytwarzają odpowiednie trypletowe produkty karbenowe.

Podstawniki będące donorami elektronów mogą również sprzyjać fotoizomeryzacji do liniowego związku diazowego [30] , a nie singletowego karbenu, a zatem związki te są niekorzystne do stosowania w testach biologicznych. Z drugiej strony, w szczególności trifluoroarylodiazyryny wykazują korzystną stabilność i właściwości fotolityczne i są najczęściej stosowane w zastosowaniach biologicznych.

Powyżej pokazano trzy diazyryny. Fenylodiazyryna wytwarza singletowy karben, podczas gdy trifluorometylofenylodiazyryna i p-nitrofenylochlorodiazyryna wytwarzają karbeny w stanie trypletowym.

Karbeny wytwarzane z diazyryn są szybko gaszone w reakcji z cząsteczkami wody, a zatem wydajności fotoreaktywnych testów sieciowania są często niskie. Ponieważ jednak ta cecha minimalizuje niespecyficzne etykietowanie, w rzeczywistości jest to zaleta stosowania diazyryn.

Zastosowanie w sieciowaniu fotoreaktywnym

Diazyryny są często stosowane jako fotoreaktywne odczynniki sieciujące, ponieważ reaktywne karbeny, które tworzą po napromieniowaniu światłem UV, mogą wstawiać się w wiązania CH, NH i OH. Powoduje to zależne od bliskości znakowanie innych gatunków związkiem zawierającym diazyrynę.

Diazyryny są często preferowane w stosunku do innych fotoreaktywnych odczynników sieciujących ze względu na ich mniejszy rozmiar, dłuższą długość fali napromieniowania, wymagany krótki okres naświetlania oraz stabilność w obecności różnych nukleofili, zarówno w warunkach kwaśnych, jak i zasadowych. Benzofenony , które po napromieniowaniu tworzą reaktywne formy karbonylu typu triplet, często wymagają długich okresów naświetlania, co może skutkować niespecyficznym znakowaniem, a ponadto są często obojętne na różne rozpuszczalniki polarne. Azydki arylu wymagają promieniowania o niskiej długości fali, które może uszkodzić badane makrocząsteczki biologiczne.

Przykłady w badaniach znakowania receptorów

Diazyryny są szeroko stosowane w badaniach znakowania receptorów. Dzieje się tak, ponieważ analogi różnych ligandów zawierające diazyrynę można syntetyzować i inkubować z ich odpowiednimi receptorami, a następnie wystawiać na działanie światła w celu wytworzenia reaktywnych karbenów. Karben będzie kowalencyjnie wiązał się z resztami w miejscu wiązania receptora. Związek karbenowy może zawierać bioortogonalny znacznik lub uchwyt, za pomocą którego można wyizolować białko będące przedmiotem zainteresowania. Białko można następnie strawić i zsekwencjonować za pomocą spektrometrii masowej w celu zidentyfikowania, z którymi resztami związany jest ligand zawierający karben, a tym samym tożsamości miejsca wiązania w receptorze.

Przykłady diazyryn stosowanych w badaniach znakowania receptorów obejmują:

  • Odkrycie receptora brassinosteroidowego dla brasinosteroidowych hormonów roślinnych przez Kinoshita i in. Naukowcy wykorzystali analog hormonu roślinnego z ugrupowaniem sieciującym diazyrynę i znacznik biotynowy do izolacji w celu zidentyfikowania nowego receptora. Badanie to doprowadziło do wielu podobnych badań przeprowadzonych w odniesieniu do innych hormonów roślinnych.
Brassinosteroid diazirine analog.jpg
Propofol (po lewej) i m -azypropofol, jego diazyrynowy analog

Przykłady w badaniach enzym-substrat

W sposób analogiczny do znakowania receptorów, związki zawierające diazyrynę, które są analogami naturalnych substratów, zostały również wykorzystane do identyfikacji kieszeni wiążących enzymów. Przykłady obejmują:

  • Synteza diazyryny zawierającej analog etopozydu , szeroko stosowanego leku przeciwnowotworowego ukierunkowanego na topoizomerazę II , co daje nadzieję na identyfikację miejsca wiązania etopozydu.
    Etopside analog.png
  • Odkrycie, że inhibitory gamma-sekretazy typu kaprolaktamu celują w podjednostkę SPP gamma-sekretazy , która jest powiązana z chorobą Alzheimera.

Przykłady w badaniach kwasów nukleinowych

Diazyryny były również używane w eksperymentach znakowania fotopowinowactwem z udziałem kwasów nukleinowych. Przykłady obejmują:

Thymidine analog - Haworth projection.jpg
  • Włączenie ugrupowania diazyryny do cukru nukleozydowego w polimerze DNA w celu zbadania interakcji między mniejszym rowkiem DNA a polimerazami DNA.
  • Włączenie ugrupowania diazyryny do zasady nukleozydowej w polimerze DNA w celu zbadania sposobu naprawy DNA przez białka.
    Thymidine analog.jpg

Diazyryny były również używane do badania interakcji białek z lipidami, na przykład interakcji różnych sfingolipidów z białkami in vivo.

30. SM Korneev: Izomeryzacja walencyjna między związkami diazowymi i diazyrynami . W: EUR. J.Org. chemia (2011), zespół 31, S. 6153–6175, doi: 10.1002/ejoc.201100224